Seahorse XF實驗---常見問題及解答

2021-01-15 諾能生物NanoBio

     Agilent 無法保證因使用超出保質期的探針板或重複使用探針板而得到的實驗數據質量(有效性),為得到最佳的、最真實的數據,請使用有效期內的探針板及其它消耗品。


     Agilent建議將探針板放入37℃無CO2培養箱中水化過夜以得到最優結果。最短水化時間是37℃水化12小時。探針板最長水化時間是37℃水化72小時,但由於液體蒸發需要補充(或更換)校準液,因此37℃無CO2培養箱務必放置水盤保證溼度。


     探針板是Fluxpak的組成部分,一個Fluxpak包含探針板、水化板、校準液和細胞培養微孔板。以上各消耗品數量因所購Fluxpak類型而不同。探針板不能單獨訂購,必須通過訂購Fluxpak來購買,但細胞培養板和校準液可單獨購買。訂購前,需要了解使用機器的型號及所需要的實驗次數,訂購與之配套的Fluxpak。


     實驗前一天,打開主機,打開電腦,同時點開Wave軟體,確保是Connected的狀態,水化探針板,貼壁細胞提前接種到Seahorse的細胞培養板裡。


     是的,96孔探針板,實驗前一天,用無菌水;第二天做實驗前,棄去無菌水,更換上37℃預熱好的校準液,再放置無CO2恆溫箱孵育1小時,這樣二步法水化,最大程度避免了探針頭上的小氣泡;24機型探針板一步法水化即可,但是還是建議用之前手動排一下氣泡;


     為了將所有藥物或化合物成功地注入細胞培養孔中,Agilent建議水化整個探針板並因需要將相同字母標註的全部加藥孔注入藥物(請參考實驗流程中關於加載藥物的注意事項)。背景孔的加藥孔也必須加上藥物,保證所有的A加藥孔體積一致,B、C、D孔同理,否則會造成打藥失敗;


     背景校正孔被用來過濾掉實驗的幹擾因素,比如溫度和 buffering capacity,這些幹擾因素會影響氧含量和pH變化(非來源於代謝變化的影響)。背景校正孔還能被用來修正整板間溫度波動,來診斷潛在溫度問題,以及作為實驗獲得非期望數據時原因篩查的切入點。


      背景校正孔裡除了沒有細胞,其它所有操作和細胞孔一致。96機型背景校正孔(A1,A12, H1, H12,即4個角)不接種細胞;24機型背景校正孔設置為(A1, B4, C3, D6);確保背景校正孔中只加入培養液(無細胞)


為何細胞培養板需要在 37℃無CO2 培養箱中放置45-60min?

     細胞培養板在37℃無CO2培養箱中孵育45-60min的目的是為了脫氣,釋放CO2。


Seahorse 實驗時,我擔心細胞量少,我多種點細胞可以嗎?

     細胞的密度需要摸索,在實驗上機前,長滿板底面積80-90%為最佳,設置一個密度梯度,找到最佳的密度;細胞過密會使檢測時形成的瞬間微室氧氣快速耗盡。


Seahorse 實驗,種細胞和平時種細胞有區別嗎?

      安捷倫細胞培養板種細胞時候,槍頭抵壁,與水平面呈45°角度加入,加完在超淨臺靜置1小時,有助於促進細胞均勻分布並減少邊緣效應。96孔細胞板種80ul;24機型的板子分二步,先每孔接種100 μL細胞懸液,培養細胞1-6小時,細胞貼壁後,再補充生長培養基,每孔加入150μL生長培養液,總體積為250 μL。加液時沿壁輕輕加入,避免吹起剛貼壁的細胞。 


使用組織黏附劑處理細胞培養板會影響XF實驗測量嗎?

     不會。使用諸如poly-L-Lysine,fibronectin,Gelatin,poly-D-lysine,Cell-Tak™等組織黏附劑處理細胞培養板時,不會影響XF儀器測量的效果及實驗參數分析。


XFp/XFe96細胞培養微孔板的每個細胞孔的最大體積及底面積是多少?

       275 µL;底面積是正常96孔板底面積的40%。


XFe24細胞培養微孔板的每個細胞孔的最大體積及底面積是多少?

      1000 µL;底面積和正常96孔板底面積一樣大小。


      無需加入抗生素,因為大部分XF實驗在幾小時內就結束了。


      不建議加入血清(如:FBS),因為其會影響檢測液的緩衝能力,並可能與進行檢測的藥物/化合物發生非特異性結合而影響檢測效果,同時容易產生氣泡。另外,使用加入血清的檢測液溶解藥物加載至探針板加藥孔中進行注射時,會出現漏藥或加藥注射失敗。


加入底物的檢測液在多長時間內可保持穩定?或可以提前配好檢測液和藥物嗎

      Seahorse檢測液在實驗當天現用現配。藥物也要現配現用,溶解後的藥物要一次性用完,剩餘的也不能用於下次實驗了。


Seahorse XF糖酵解壓力試劑盒中的藥物狀態看上去很奇怪,是否有質量問題(或其他試劑盒中部分藥物)

      如Glycolysis stress test kit中的2-DG,該藥可能是透明的液體、不透明的(白色的)固體,也可能是白色固體與透明液體的混合物,以上藥物狀態均不影響其性能,可按照說明書正常溶解使用。


使用pH 7.4 的 XF DMEM 或 RPMI 基礎培養基製備檢測液時,加上Seahorse的三個底物,是否就無需調整pH了?

      是的。使用推薦的 XF 三個底物,能確保分析培養基最終 pH 值的準確。如果使用其他供應商提供的其他品牌的補充劑,則無法保證培養基pH 值的準確。啟封后的pH7.4的DMEM或RPMI基礎培養基,儘可能在一個月內用完,以免pH值因為空氣中的CO2進去,影響pH值。


Seahorse的基礎培養基與其他廠家的有啥不同?

       Seahorse XF 培養基專用於 XF 分析,推薦研究者使用,以獲得最佳試驗結果。XF 培養基以標準細胞培養基組分(DMEM 或 PRMI)為基礎,做了以下這些方面改進:

 無碳酸氫鹽和低緩衝容量:利於細胞外酸化率的檢測 

 無底物添加:適用於用戶的各種不同需求 

 低濃度酚紅或無酚紅:確保 pH 值測量的準確性 


請問進行FAO實驗時,能夠在探針板上加載BSA-palmitate使其在上機測量時自動注射入細胞孔嗎?

      Agilent建議將BSA-palmitate或相似底物在培養細胞時做預處理。如果實驗存在合理依據需在上機測量時通過注射加BSA-palmitate、血清或其他類似底物,請聯繫相關技術支持。


為何不能使用XF base medium配製的檢測液進行Glycolytic rate與real-time ATP rate兩個實驗?

      XF base medium中含有酚紅,該物質會影響這兩個實驗的測量。


為何不能使用GlutaMAX來代替Glutamine呢?

     不建議使用GlutaMAX來配製檢測液。因加入GlutaMAX後,還需細胞進一步將其轉化為glutamine,這可能會影響線粒體對Glutamine氧化的動力學過程。


    是的,Seahorse XF實驗通過測定細胞代謝物(如:氧和質子)的變化來確定OCR 和ECAR,而檢測液pH會影響這些代謝物的產生或消耗,因此保持檢測液一致的 pH(37℃,pH=7.4± 0.1)非常重要。


      不可以,雖然水化板與細胞培養板結構相同,但不能用來培養細胞。


Seahorse 探針板上機前加藥,需要注意什麼?

       加藥時同樣方法,槍頭抵著加藥孔壁大約與水平面呈45°度角,將液體一次性加入到加藥孔中,注意板子始終保持在平面上,加完藥的探針板不能晃動,以免加入的液體漏入水化板中。(24的機型,在加藥前需要取下粉色的水化輔助板);


Seahorse 細胞板上機時候,放進去應該就可以了?

       探針板和細胞板放入儀器時,朝向為A1孔朝向機器內部,記得把蓋子拿掉;


Seahorse XF報告生成器中的代謝數據是如何計算的?

      在每個試劑盒的Seahorse XF報告生成器的用戶指南中詳細列出了數據的計算公式,請參閱。


Seahorse數據分析軟體Wave可以免費下載安裝嗎?

      是的,可在安捷倫官網找到Wave軟體下載網址,並且免費下載安裝。


Seahorse XF 儀器模板選項中沒有想檢測試劑盒的模板怎麼辦?

     可在桌面板wave軟體中將相應實驗模板先導出到 U 盤中,再導入XF 儀器模板庫即可。


Seahorse數據分析軟體導出選項中沒有對應的report generator?

      當軟體導出選項中無相應的report generator時,請移步到Agilent官網細胞分析軟體下,下載最新wave分析軟體,也可以在對應試劑盒的菜單中下載對應的report generator。(https://www.agilent.com/en/products/cell-analysis/cell-analysis-software#0 )


Seahorse Wave 分析軟體,我的電腦怎麼都安裝不上,怎麼辦?

     當軟體無法安裝時,可採用 Seahorse Analytics雲分析, 這是一款網頁形式的 Seahorse XF 數據分析軟體,用戶可以通過任何一臺電腦安全地存儲、訪問和分析數據。極大地簡化了用戶的數據分析流程(https://www.agilent.com/zh-cn/product/cell-analysis/real-time-cell-metabolic-analysis/xf-software/agilent-seahorse-analytics-787485)


Seahorse XF 實驗後,是否需要做歸一化處理呢,有哪些方法呢?

     功能生物數據的歸一化是原始數據展示和後續分析工作流程中的關鍵因素,以確保對結果的準確一致的解析。XF 代謝分析在這方面也是如此,大多數實驗需要進行某種形式的歸一化。無論是比較不同的細胞類型、基因修飾還是化合物處理,都必須根據共同的參數將數據歸一化以便正確比較。

     常用的方法,蛋白定量,細胞成像計數,核DNA的檢測等。


購買的Fluxpak包裝為啥細胞板總是多幾塊呢?

    Agilent 充分考慮到實驗中的各種情況,如果你發現細胞種的過密了或者發生了汙染,那麼就需要更換新的細胞板重新鋪板。


      Agilent 基礎培養基類,請4℃避光保存,避免凍結。FAO和穀氨醯胺需要存放在-20℃;板子及常見的試劑盒,室溫存儲即可。


Seahorse XF 相關試劑盒的說明書在哪呢,有中文的嗎?

   Agilent 一直提倡遵循環保理念,當您收到試劑盒後,標籤面都有一個二維碼,掃描即可下載說明書。部分有中文說明書,請聯繫相關技術支持索取。

   

Seahorse XFe24 組織胰島板能簡單介紹下嗎?

     目前只要24機型配有組織胰島微孔板,其微孔板的腔室容積為16.6 µL;

其網狀捕獲篩孔徑為125 µm。


Seahorse 啥數據能大致判斷實驗結果靠譜不?

      通過大量的結果數據,24機型基礎OCR值範圍50~400(pmol/min),基礎ECAR值範圍20~120(mpH/min);96機型基礎OCR值 範圍20~160(pmol/min),基礎ECAR值範圍10~90(mpH/min)。這個範圍內的值,還是比較靠譜的。


Seahorse  24/96 孔微孔板的尺寸是多少?

板類型

板寬度板高度板長度體積 (UL)比表面積9685.5 mm17.4 mm127.8 mm150-2750.11cm22485.5 mm20.3 mm127.8 mm500-10000.28cm2


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