微視頻丨Discovery Studio基於幾何形狀匹配的快速分子對接技術

2021-02-25 叮噹科研

生命科學分子模擬軟體Discovery Studio系列操作視頻以DS 2016版本為例，為大家直觀演示DS軟體中各功能模塊的操作流程。利刃君建議學習時同時參照公眾號內對應的圖文教程。

基於結構的藥物設計技術在藥物研發中起著非常重要的作用。分子對接技術即基於結構的藥物設計主要採用的手段，分子對接是指通過計算機模擬技術將大分子靶標(受體)與小分子(配體)相互匹配，再通過計算物理化學參數來預測兩者的結合力(結合親和性)和結合方式(構象)。當靶標蛋白的三維結構已知，分子對接技術可完成目標先導化合物的虛擬篩選（活性篩選）。

Ligandfit 是應用精確的經典分子對接方法進行虛擬篩選的工具。它本身具備了受體分子活性位點的自動尋找和確認、構象柔性的多配體對接以及基於力場的相互作用打分評價的功能。Ligscore 不僅包括PLP、PMF 等在內的8 種不同算法的打分函數，還包括對所有打分函數評分結果的綜合評價。

本期教程為大家演示在Discovery Studio 中如何藉助LigandFit工具進行基於幾何形狀匹配的快速分子對接以及配體對接構象的查看。

建議在wifi的環境下觀看~

①執行分子對接計算微視頻

②分析配體對接構象微視頻

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