48個實用的生信在線工具強烈推薦,不看是你的損失!

在線工具一般具有「功能強大、操作簡單、無需安裝、用完就走」的特點，輕鬆實現「用別人的伺服器分析自己的數據」。

基因結構繪製

1.Exon-Intron Graphic Maker

工具連結：

RNA二級結構

2.Mfold

工具連結：

3.RNAfold

工具連結：

http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi

蛋白互作網絡

4.String

工具連結：

https://string-db.org/

基因共表達網絡

5.Coexpedia:

工具連結：

http：//www.coexpedia.org/

序列Motif

6.MEME

工具連結：

http://meme-suite.org/

7.Weblogo

工具連結：

基因信息查找

8.Genecard

工具連結：

序列展示

9.ESPript:

工具連結：

http://espript.ibcp.fr/ESPript/cgi-bin/ESPript.cgi

點擊播放 GIF 0.0M

Gene ID轉化

10.BioMart

工具連結：

11.g:profiler

工具連結：

https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/convert

12.UniPort Retrieve/ID mapping

工具連結：

https://www.uniprot.org/uploadlists/

13.bioDBnet

工具連結：

https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/

韋恩圖

14.Venny2.0

工具連結：

http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

15.OmicShare 韋恩圖工具

工具連結：

http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/venn

三元圖

16.Ternary plot maker

工具連結：

https://www.ternaryplot.com/

基因結構分析

17.FGENES

工具連結：

http://softberry.com/

範例結果：

系統發育分析

18.iTOL

工具連結：

https://itol.embl.de/

19.Evolview

工具連結：

http://www.evolgenius.info/evolview/

啟動子預測

20.Promoter Scan

工具連結：

http://www.cbs.dtu.dk/services/Promoter/

蛋白一級結構預測

21.PredictProte

工具連結：

https://www.predictprotein.org/home

22.ProtParam tool

工具連結：

http://web.expasy.org/protparam/

信號肽預測

23.SignalP

工具連結：

http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

跨膜結構域

24.TMHMM Server v. 2.0

工具連結：

http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/

亞細胞定位

25.PSORT

工具連結：

https://www.psort.org/

蛋白三級結構預測

26.SWISS-MODEL

工具連結：

https://swissmodel.expasy.org/

27.Phyre2

工具連結：

http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index

短序列拼接

28.Cap3

工具連結：

http://doua.prabi.fr/software/cap3

GO富集分析

29.OmicShare GO富集分析工具

工具連結：

http://www.omicshare.com/tools/home/report/goenrich.html

KEGG富集分析

30.OmicShare KEGG富集分析工具

工具連結：

http://www.omicshare.com/tools/home/report/koenrich.html

趨勢分析

31.OmicShare 趨勢分析工具

工具連結：

http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/trend

蛋白結構域預測

32.Pfam

工具連結：

33.SMART

工具連結：

http://smart.embl-heidelberg.de/

基因組雜合性評估

34.GenomeScope

工具連結：

http://qb.cshl.edu/genomescope/analysis.php?code=example2

圈圖

35.CIRCOS

工具連結：

http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/

36.熱圖

Omicshare 熱圖工具

工具連結：

http://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/heatmap

注釋工具

37.Omicshare 注釋工具

工具連結：

https://www.omicshare.com/tools/Home/Soft/getsoft/type/annotation

細胞標記

38.CellMarker

工具連結：

http://biocc.hrbmu.edu.cn/CellMarker/index.jsp

circRNA資料庫

circRNA

39. circBase

工具連結：

40. CIRCpedia

工具連結：

http://www.picb.ac.cn/rnomics/circpedia/

small RNA

41. deepBase

工具連結：

http://rna.sysu.edu.cn/deepBase/

42. sRNAanno

工具連結：

www.plantsRNAs.org

lncRNA

43. TANRIC

工具連結：

http://bioinformatics.mdanderson.org/main/TANRIC:Overview

44. NONCODE

工具連結：

ceRNA

45. starBase

工具連結：

http://rna.sysu.edu.cn/deepBase/

46. miRSponge

工具連結：

http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/miRSponge/

序列翻譯

47. ExPASy Translate tool

工具連結：

https://web.expasy.org/translate/

48. ORFfinder

工具連結：

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/

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