...感染源,「路勝生物」發布全球首個新冠病毒亞基因組RNA檢測試劑盒
2020-11-23 36kr36氪獲悉，基因組醫學公司「路勝生物」（Lucence）今日宣布發售全球首個用於直接檢測新型冠狀病毒（SARS-CoV-2）亞基因組RNA（sgRNA）試劑盒DeepMARK™。DeepMARK™二代測序試劑盒利用基於擴增子的新一代測序（NGS）技術，可在一次測序中同時解析新型冠狀病毒基因組和亞基因組RNA，幫助科學家們快速追蹤感染溯源，確定病毒傳染性，及指導疫苗研發。
「路勝生物」全稱路勝生物科技（蘇州）有限公司，是新加坡精準醫療公司Lucence在中國的子公司，通過自主研發的高通量測序技術，為精準醫療行業提供研究服務，數據分析以及整體解決方案。公司總部位於新加坡，在蘇州、加利福尼亞和香港設有辦事處。此外，「路勝生物」還設有獲得CAP, CLIA權威資質認證的中心實驗室。
DeepMARK™二代測序試劑盒
從原理上講，新冠病毒的sgRNA是科研人員認可的與傳染性相關的活性病毒複製的標誌物，sgRNA作為病毒複製的標誌物也是公認的評估疫苗效果的方法。然而病毒培養存在耗時長，成本高的問題，DeepMARK™利用公司專利的超靈敏二代測序（NGS）技術AmpliMARK™，可以大幅縮短分析臨床樣本的時間，且工作流程簡單，安全高效。
DeepMARK™試劑盒還採用了基因指紋識別技術，鑑別病毒傳播路徑、病毒簇和病毒傳染性，以便公共衛生中心快速應對疫情爆發。新加坡國立大學蘇瑞福公共衛生學院的副院長Hsu Li Yang也表示：「基因指紋分析技術可以更快，更深入地分析病毒傳播。該技術幫助我們更加全面了解SARS-CoV-2，並有助於持續對抗COVID-19。」
利用以上技術，DeepMARK™可以實現全基因組覆蓋，消除常規的測序錯誤；檢測低病毒載量樣本，減少假陰性，能對RT-PCR假陰性樣本進行二次檢測、覆核確診；快速鑑定單倍型和病毒株，追溯病毒來源；無需耗時的病毒培養，即可鑑定sgRNA轉錄組基因突變是否會導致病毒變異，適用於指導疫苗和新藥研發。此外，該產品還可以同時檢測無症狀患者和康復患者是否具有傳染性。
DeepMARK™ pipeline平臺
最後，「路勝生物」還為DeepMARK™開發了pipeline平臺，通過將測序數據上傳到AI生物分析平臺，可實現病毒基因組測序結果的自動化分析，例如系統學分析，並將多種數據可視化。現階段DeepMARK™適用於illumina平臺，未來會推出基於華大智造（MGI）的版本。
註：DeepMARK™試劑盒僅供科學研究使用，不用於臨床診斷。
編輯：蔡姝凝
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