核酸檢測「多面手」,這家企業能精準測定體內有多少病毒

2021-01-07 騰訊網

你知道嗎?對於新冠肺炎確診患者來說,體內病毒數目不同,病毒傳播能力、病程進展和採用的治療手段也是不同的。這就需要在診斷和治療過程中,對患者攜帶的病毒個數進行精準檢測,並隨時關注病毒載量的變化,及時調整治療方案。

那麼,如何檢測出患者攜帶多少個病毒呢?

在分子生物學領域,有一種絕對定量技術,可以從一份DNA樣本中直接讀出核酸分子的個數,這就是數字PCR(digital PCR或dPCR)。

數字PCR技術用於新冠肺炎病毒核酸檢測中,不僅能夠檢測出是否攜帶病毒(包括無症狀感染),最厲害的是還可以精確數出病毒個數(DNA拷貝數),這對於醫生動態觀察患者的病情變化和治療評估非常有幫助,對後期藥物篩選、病理研究也至關重要。

北京新羿生物科技有限公司(以下簡稱「新羿生物」)是中關村示範區一家專注於數字PCR技術自主研發的前沿科技企業,在數字PCR領域擁有從晶片、儀器、軟體到原料、試劑、耗材全系統研發能力,已申請九十餘項相關技術專利。在今年6月舉辦的2020中關村國際前沿科技創新大賽病毒檢測技術專場決賽上,新羿生物憑藉基於數字PCR的新型冠狀病毒精準定量核酸檢測產品,從眾多參賽企業中脫穎而出,登頂該領域TOP10榜單第一名。

數字PCR

核酸定量的金標準

大家都知道,我們每個人的DNA都不相同。不過,我們血液中的DNA(核酸分子)含量很少很少,必須採取特殊手段才能夠採集檢測出來。

PCR是Polymerase Chain Reaction(聚合酶鏈反應)的縮寫,這項技術可以看作一種在生物體外進行DNA複製的手段,可以將生物體中含量微小的遺傳物質(核酸分子)被複製擴增為原來的將近百億倍,從而實現核酸分子的超敏檢測和精準定量,是目前最靈敏的核酸檢測技術,也是核酸定量的金標準。

那麼,數字PCR是如何做到精確定量的呢?

數字PCR的原理,就是把一份反應液樣本,分散成幾萬個極微小的液滴,每個小液滴所在的反應單元中都包含零個、一個或多個拷貝的核酸分子(也就是說我們所說的DNA模板) 。這些小微滴同時進行PCR反應,最後通過數發螢光的液滴數目,輔助於統計,就可以計算出原來的反應液當中,有多少個目標核酸分子的拷貝了。

微液滴生成過程

舉例來說,數字PCR檢測就像在大海裡打撈一根發光的針,周圍都是海水,很難看到這根針到底在哪。數字PCR技術就像把海水分盛到好多碗裡面,這樣就容易看出哪個碗裡有針在發光了。這種技術對於病毒檢測與傳染性疾病診斷等具有非常重要的作用。

數字PCR技術的流程

自1999年有學者首次提出數字PCR的概念以來,由於其涉及化學、材料、儀器、軟體、生物試劑等眾多技術領域,直到近十年才有商用儀器問世,且僅限於實驗室中用於科學研究。

新羿生物聯合創始人郭永此前一直從事重大疾病的診斷技術研究,他敏銳地覺察到,數字PCR技術特別適合在臨床診斷中使用。

「如果能開發出具有自主智慧財產權的國產數字PCR儀,將大大提高我國在精準醫療領域的技術水平,用更加精確的方法輔助臨床治療。」郭永坦言。

2015年,郭永聯合儀器、晶片、材料、生化試劑等相關技術領域專業人才聯合創業,用4年的時間專注於技術攻關,於2019年自主研發出全系統臨床用微液滴數字PCR平臺,並獲得醫療器械批文。

全鏈條自主研發

真正適合臨床使用的數字PCR系統

21世紀進入精準醫療時代,分子診斷是精準醫療的基礎,可以從基因層面對病人進行個體化診療,但什麼樣的分子診斷技術能夠既滿足精準定量的技術標準,絕對防汙染,符合臨床診斷的基本要求,還方便醫護人員操作、費用不能太高,病人能承受得起?

數字PCR是目前已知最好的選擇之一。新羿生物一直以讓數字PCR技術用於臨床診療為己任,潛心解決各個關鍵環節的技術難題,走出了一條行之有效的道路。

不同於一般數字PCR研發企業,新羿生物數字PCR系統從核心原材料、晶片、儀器、軟體到臨床檢測試劑,全鏈條各個環節都實現了自主研發,這在業內是不多見的。

就拿其中關鍵的微液滴生成和檢測晶片來說,新羿生物數字PCR系統採用了先進的聚合物高精度微納加工技術,利用兩年多時間進行技術攻關,打通了掩膜設計、光刻製版、注塑封裝的「最後一公裡」。「通過自主研發,與專業團隊強強聯合,只有將核心技術掌握在自己手裡,才能在激烈競爭中掌握主動權」,郭永說。迄今為止,新羿生物已申請三十餘項晶片設計製造相關專利,授權二十餘項,並已實現100%國產化量產。

除了檢測產品研發,數字PCR檢測過程中的樣本汙染也是急需解決的難題。

「臨床上使用PCR技術最大的風險是陽性樣本的汙染,因為在PCR擴增的1個半小時內,可以將DNA分子數量從1增加至百億個甚至更多。一旦發生陽性擴增樣本洩露或氣溶膠汙染,不僅可造成假陽性的結果,甚至還會引起整個PCR實驗室的汙染。」郭永介紹說。

為此,研發團隊對整個作業系統進行了獨特的防汙染設計,讓整個反應過程都在全封閉的空間中進行,防止PCR產物汙染,有效解決了數字PCR檢測的痛點問題,極大地提高了檢測準確度。

新羿TD-1 數字PCR平臺

新羿生物數字PCR系統包含樣本製備儀生物晶片分析儀,一次PCR可以完成96個樣本,且無須手工移液,PCR擴增完成後,直接放入生物晶片分析儀中,即可進行信號讀取與分析,具有通量高、方便快捷、安全可靠等特點。

此外,針對不同病症和用途,新羿生物還研發了不同的檢測試劑,通過「儀器+試劑」相互配合的方式,打出了數字PCR檢測的「組合拳」。據了解,新羿生物目前已開發出20多種檢測試劑,可用於感染性疾病的早期和快速診斷、腫瘤基因檢測、無創產前篩查等多種臨床診斷和治療中。

新冠病毒核酸定量檢測試劑盒

以新冠病毒核酸檢測產品為例,疫情初期,新羿生物與清華大學等單位聯合攻關,針對公布的新型冠狀病毒序列,加班加點,在春節期間開發出新型冠狀病毒定量檢測試劑盒。

該試劑盒採用創新的RNA一步法逆轉錄數字PCR技術,可以精確計算出病人攜帶病毒DNA的拷貝數,這是判斷病情程度的「晴雨表」。這樣,對於一線醫生來說,能夠更準確地篩查出病毒攜帶者,減少漏診誤診;同時,在病程判斷、療效評估以及治療方案調整等方面都具有重要參考價值。

目前,新羿生物新型冠狀病毒定量檢測試劑盒已完成四家單位的臨床試驗,正式進入國家藥監局審批階段。

戰「疫」利器

國產數字PCR產品首次出「海」

今年2月,湖北省新冠肺炎疫情形勢極為嚴峻。除了準確檢測,對患者進行有效治療是另一項非常重要的工作。此時,國家派出的醫療隊正在武漢多家重點醫院開展血漿治療研究,該研究需要實時評估治療的效果,尤其是新冠病毒數量是否有下降。

2月12日,國家醫療隊提出需要數字PCR系統對血漿治療進行評估。新羿生物第一時間響應號召。當時,通往武漢的運輸渠道極為不暢,經多方協調,發往武漢地區的第一套數字PCR儀及配套新冠病毒核酸檢測試劑盒於2月17日順利抵達武漢亞洲心臟病醫院,有力地支援了國家醫療隊的血漿治療評估。經過一個多月700餘例臨床樣本驗證,國家醫療隊對新羿生物數字PCR平臺給予了很高的評價。

國家醫療隊的劉忠教授說:「傳統的恢復期血漿療法在數字PCR等現代科技的支撐下,重新喚起了新的活力,在新冠肺炎重症救治、疫情防控中發揮了重要作用。」

疫情期間,新羿生物數字PCR新冠檢測方案在20多家新冠肺炎重點診治和研究單位進行了逾5000例臨床樣本合作研究,大量數據顯示該方案在疑似病例的確診過程中表現優異。

據了解,新羿生物數字PCR儀器和新冠數字PCR試劑盒於4月2日獲得歐盟準入,7月上旬完成出口第一單,這是國產數字PCR產品首次出「海」,為支持海外戰「疫」貢獻科技力量。

新羿生物TD-1數字PCR系統生產現場

在中關村昌平園,新羿生物擁有兩千餘平米的生物醫學儀器、耗材和體外診斷試劑生產基地,為數字PCR技術和產品研發提供了良好的支撐保障。

公司成立5年以來,新羿生物始終致力於數字PCR技術及相關分子診斷技術平臺設備研發工作,並自主開發各種臨床診斷和檢測試劑,通過重點突破、以點帶面,以期實現國產數字PCR臨床檢測技術全面發展。

「隨著一系列試劑盒的推出,我們將會在醫學檢驗和健康體檢領域帶來更為精準有效的檢測產品,從而不斷降低檢測成本,提高檢測效率和檢測準確度。未來,新羿生物將繼續深耕數字PCR領域核心技術,通過持續創新,走出一條自主可控的路子,為重大疾病的早期預警、早期診斷、個體化用藥以及復發監測等提供高品質的自主品牌產品。」郭永說。

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