枳基因組

2021-02-19 植物基因組

物種名：枳；枸橘 

拉丁名：Poncirus trifoliata; Citrus trifoliata

屬：枳屬（Poncirus）

科：芸香科（Rutaceae）

目：芸香目（Rutales）

綱：雙子葉植物綱（Dicotyledoneae）

門：被子植物門（Angiospermae）

中國植物志：http://www.iplant.cn/info/Citrus%20trifoliata?t=z

染色體數量：2n=18

測序技術和數據量：

Illumina: ~80X

PacBio: ~140X

Hi-C

基因組組裝大小：264.9 Mb

Scaffold N50 長度：27.7 Mb

Contig N50 長度：842.8 Kb

預測的基因數量：25538

轉座子比例：42.6%

論文題目：A chromosome‐scale reference genome of trifoliate orange (Poncirus trifoliata) provides insights into disease resistance, cold tolerance and genome evolution in Citrus

期刊和日期：Plant Journal 2020-09-27

論文 DOI：10.1111/tpj.14993

數據可用性：

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