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環狀RNA/DNA研究新進展!
研究者表示,環狀RNA (circRNA)不編碼蛋白質,而是複雜調控系統的一部分,但其功能仍不清楚。這項在細胞培養和小鼠身上進行的研究,首次證明了一種名為CDR1as的環狀RNA可以阻止黑色素瘤的惡性擴散,而它的缺失則會促進這種擴散。一項對人類黑素瘤組織的研究分析也表明,CDR1as水平升高與存活率增加有關。
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研究人員發現了調節神經發生的特定環狀RNA
美國治療服務機構和生元國際了解到,在篩選神經元分化過程的功能影響時,丹麥研究人員發現了一種特殊的環狀RNA circZNF827,它令人驚訝地「踩下了神經發生的剎車」。這個結果提供了一個有趣的例子,circRNA和它的宿主編碼的蛋白產物共同進化,調節彼此的功能,直接影響神經發生的基本過程。正確的時間和神經元分化的精細控制對神經系統功能的發展至關重要。
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2月長非編碼RNA和環狀RNA研究推薦
其中,LXRs的激活通過誘導一系列基因(包括編碼質膜轉運蛋白ABCA1的Abca1)促進膽固醇逆向轉運。Abca1對於高密度脂蛋白(HDL)的產生是至關重要的,其功能的缺失會導致丹吉爾病(Tangier disease)。研究者通過用LXRs的興奮劑處理細胞,鑑定到一系列差異表達的長非編碼RNA。
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非編碼RNA之環狀RNA最新研究進展
2017年10月31日/生物谷BIOON/---環狀RNA(circRNA)是一類不具有5' 末端帽子和3' 末端poly(A)尾巴、並以共價鍵形成環形結構的非編碼RNA分子。環狀RNA是區別於傳統線性RNA的一類新型RNA,具有閉合環狀結構,大量存在於真核轉錄組中。
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Nat Commun:癌細胞與成纖維細胞相互作用促進惡化
2020年3月25日訊/生物谷BIOON/---為了在其他器官中定居並發展成轉移灶,已經發生轉移的腫細胞需要適應並操縱新的微環境。近日,德國癌症研究中心和海德堡幹細胞技術與實驗醫學研究所的科學家現在發現,某些癌細胞會刺激周圍環境中的結締組織細胞釋放促進轉移的遞質。這一發現在更好地了解這些轉移性癌細胞如何產生方面起著關鍵作用。
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Cancer Cell:環狀RNA限制皮膚癌的轉移
該研究的作者說,環狀RNA (circRNA)不編碼蛋白質,而是複雜調控系統的一部分,但其功能仍不清楚。圖片來源:Cancer Cell由紐約大學格羅斯曼醫學院(NYU Grossman School of Medicine)的研究人員領導的這項在細胞培養和小鼠身上進行的研究,首次證明了一種名為CDR1as的環狀RNA可以阻止黑色素瘤的惡性擴散,而它的缺失則會促進這種擴散。
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【分子克隆專題】環狀RNA
②外顯子-內含子環狀RNA(EIciRNA)是一種外顯子和內含子同時環化的RNA。內部重複序列可能在其生成過程中發揮重要作用,它們可能與EcircRNA類似(圖1)。③來源於內含子的環狀RNA(CiRNAs):由內含子環化形成(圖2)。
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環狀RNA(circRNA)資料庫大匯總,快來看看有沒有你需要的!
2018 年是環狀RNA大爆發的一年, 據統計, 2018 年國內外環狀 RNA 領域發表 SCI 文章高達 8167 篇, 比 2017 年增長了 10 多倍, 產量呈現指數性地暴漲。此外,更新後的資料庫包含了人類和小鼠之間環狀 rna 的保守性分析。
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環狀RNA(Circular RNA):noncoding RNAs的新明星分子
因此,比線性RNA穩定,不容易被RNA核酸外切酶或者RNase R降解。在健康人的唾液細胞裡發現了400種以上的circRNAs。(2)circRNAs表達豐度差異大,在某些情況下,環狀分子是其對應線性mRNA表達豐度的10倍以上。(3)circRNAs大部分有外顯子組成,主要存在於細胞質中,可能有miRNA結合的原件(MREs)。
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環狀RNA臨床潛力可期,有助腫瘤患者耐藥難題
抗癌耐藥的機制涉及多方面,腫瘤生長、選擇性治療壓力、免疫系統特性和腫瘤微環境等不同特徵決定了抗腫瘤耐藥的生物學行為。這些特徵是由複雜的潛在分子調控機制驅動的。識別這些過程中的關鍵分子可以幫助我們了解耐藥的發生,這些分子在預測和逆轉腫瘤耐藥過程中發揮著重要作用。隨著測序技術的發展,研究表明,大約70%的人類基因組被轉錄,但只有2%的基因編碼蛋白。剩下的不編碼蛋白質的RNA,最初被認為是轉錄垃圾。
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揭示腫瘤微環境中的巨噬細胞叛徒導致乳腺癌生長...
論文通訊作者為倫敦大學學院的Valentí Gómez博士和Tony Ng博士。圖片來自Science Signaling, 2020, doi:10.1126/scisignal.aax4585。腫瘤微環境指的是包含腫瘤的區域,這個區域與供養腫瘤的血管糾纏在一起,並得到免疫細胞、信號分子、成纖維細胞、常駐宿主細胞、淋巴管和一系列蛋白的支持。
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非編碼RNA研究園地 | 一種大環肽與腫瘤發生的自然通訊
論文:An oncopeptide regulatesm 6 A recognition by the m 6 Areader IGF2BP1 and tumorigenesis | Nature Communications(一種大環肽調節m6A讀取器IGF2BP 1對m6A的識別與腫瘤發生的自然通訊)
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綜述: 腫瘤及其微環境中的內質網應激信號
細胞內活性氧的積累ER中的蛋白質摺疊在很大程度上依賴於這個細胞器的氧化還原狀態。細胞內活性氧(ROS)的積累是對外界條件的反應,或由各種信號事件引起的,可極大地擾亂細胞內的蛋白質穩定。例如,通過幹擾穀胱甘肽的產生和改變內質網腔內的氧化還原環境,限制穀氨醯胺的水平會加重內質網的壓力。
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癌細胞「綁架」神經元幫自己壯大,科學家破譯癌細胞分子機制 |...
但是到如果要具體到分子作用層面,還要慢慢講:綁架神經元惡性腫瘤是複雜的多細胞集合。腫瘤細胞被其他類型的正常細胞包圍,共同形成了腫瘤微環境。其中有「纖維母細胞」、「免疫細胞」,前者幫助腫瘤細胞生長擴散,後者負責消滅腫瘤細胞。所以過去人們希望搞清楚這兩種細胞與腫瘤細胞的作用機理。
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曝光癌細胞的「欺騙」手段!普林斯頓大學成功探測到蛋白質間通訊狀況
這項突破性技術被命名為μMap,普林斯頓大學的研究團隊和默克公司的科學家用光催化劑對蛋白質及其鄰居進行標記,從而使它們在微觀領域中的精確觀測成為可能。該技術可以在10納米的級別上,標識出某個蛋白質及其10-15個相鄰蛋白質。文章通訊作者麥克米倫(David W. C.
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癌細胞「綁架」神經元幫自己壯大,科學家破譯癌細胞分子機制
但是到如果要具體到分子作用層面,還要慢慢講:綁架神經元惡性腫瘤是複雜的多細胞集合。腫瘤細胞被其他類型的正常細胞包圍,共同形成了腫瘤微環境。其中有「纖維母細胞」、「免疫細胞」,前者幫助腫瘤細胞生長擴散,後者負責消滅腫瘤細胞。所以過去人們希望搞清楚這兩種細胞與腫瘤細胞的作用機理。
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【學術前沿】江鵬組報導T細胞感知微環境天冬醯胺的分子機制和功能
【學術前沿】江鵬組報導T細胞感知微環境天冬醯胺的分子機制和功能 2021-01-11 17:11 來源:澎湃新聞·澎湃號·政務
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農科院破譯環狀RNA調控豬產肉性狀分子機制
近日,從中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所獲悉,該所「豬基因工程與種質創新團隊」和農業基因組研究所「豬基因組設計育種創新團隊」合作,歷時3年,開發出環狀RNA研究平臺,繪製豬環狀RNA時空圖譜,破譯環狀RNA對豬產肉性狀形成調控機制,並構建首個農業動物的環狀RNA資料庫。
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科學家闡明癌細胞重編程血管促進癌症擴散的...
受體蛋白Notch通過配偶體激活是臨近細胞之間信號交流的關鍵通訊通路,不管是從線蟲到昆蟲,再到人類機體,Notch在胚胎發育期間能夠調節器官的發育,而在成年人機體中,這種信號蛋白卻能夠調節血液幹細胞的活性。
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關於環狀RNA的科研設計
另外,微串(nanostring)技術證實有許多基因下調了。還有,通過病毒引入小髮夾RNA的方法穩定減少CDR1as的表達引起體外創傷修復中細胞遷移的明顯減少(補充圖5阿附,補充表7)。這樣,敲除CDR1as會影響HEK293細胞,但我們無法說明這是miR-7的特異性作用,因為它可能是非直接的,或者是不依賴於miR-7的CDR1as的功能。