基因檢測臨床應用中的難題:基因型與表型信息關聯

2020-12-05 中國生物技術信息網

新一代測序技術的出現，使得基因組數據以及新基因突變的發現呈現爆炸式增長。基因組學研究所面臨的挑戰不再是單純的數據產生，而是數據的解讀。基因組學的信息如果不能和臨床、表型的數據關聯，就不能很好地解釋複雜的基因變異以及生物學相關問題。

與大多數研究不同，臨床表型信息的收集，必須考慮臨床醫療環境的約束、有限的資源、醫生的時間限制，以及通常做診斷時的緊迫感。已有臨床基因組研究指出，表型對罕見疾病遺傳以及基因診斷的重要性，並且強調確保表型信息準確可靠對基因診斷的重要性。

什麼是表型數據？

表型數據包括定量數據(體重，身高)、定性數據(行為)，照片，臨床特徵描述，病史，體格檢查以及生化檢查。表型信息的檢測項目包括侵入性檢測(如：血檢，組織檢測)和非侵入性檢測(如：測心率，進行X光檢測)。臨床醫生在做決定是否需要做這些檢測之前，也需要結合相應的臨床指標來加以判斷。在罕見病診斷的過程中，還包括患者父母的表型信息。

表型用於臨床診斷

表型信息對臨床診斷策略的決策至關重要，包括基因檢測之前和基因檢測之後。基因檢測之前，表型信息可以輔助鎖定要研究的區域，幫助篩選檢驗項目。基因檢測之後，表型信息可以和基因信息關聯起來對疾病進行解釋。

例如，一位病人患有主動脈病。而多個基因的變異都有主動脈病的發病有關，主動脈病不同亞型的臨床表現之間也有重疊。因此，基因型分型對於這類疾病的發病機制、分型非常重要。

Loeys-Dietz症候群和Marfan症候群的表型非常相近，但是前者是TGF-beta受體基因(TGFBR1, TGFBR2)發生了突變，而後者是FBN1基因發生了突變。相反，Ectopia Lentis症候群和Marfan症候群都是FBN1基因發生的突變，但是表型卻有所不同。因此，將表型信息和基因型信息結合起來進行研究對疾病的判別至關重要。

多個環節銜接

在醫療保健領域，基因型和表型並不是完全獨立的，在基因檢測開展之前，有些疾病單憑表型信息是無法診斷的。在日前舉辦的《基因檢測的臨床應用》沙龍上，中日友好醫院的顧衛紅大夫也表示：現在，臨床表型與基因型的結合研究越來越重要。在將臨床表型和基因型進行關聯的過程中，還需要多學科、多科室的協作，結合病史、體徵、生化檢測、電生理等相關表型信息，以及基因檢測等遺傳信息，對疾病進行診斷、分類，從而給出合理、有效的診療方案。而從基因檢測結果中，可以判斷病患的基因缺陷與遺傳模式。最終將表型信息與基因型信息無縫地對接在一起。

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