Agripheno高通量基因分型檢測平臺及其應用案例

2021-02-24 AgriPheno平臺

Agripheno™高通量基因分型檢測平臺包括高通量Oktopure DNA提取儀、Nexar®模塊化內聯液體處理與分析系統、Soellex®高通量PCR水浴熱循環系統和Araya®內聯螢光檢測系統。

Oktopure DNA提取儀採用磁珠的方法提取DNA，通量達到800個樣本/3小時。同時，適用於多種樣本類型的DNA提取，包括植物葉片、種子，毛髮、血方卡、精液、口拭子、唾液、組織等。提取的DNA適用於多種下遊應用，如基因分型、一代測序、二代測序等。

Oktopure DNA提取儀

Nexar高通量吸取樣品DNA和引物、mix至384孔卷帶並封膜。Soellex對封膜完成的卷帶進行PCR水浴熱循環，每次最多可達230,000個樣本。Araya對水浴完成的卷帶掃描分析，28秒掃描一張卷帶。

Nexar®模塊化內聯液體處理與分析系統

Soellex®高通量PCR水浴熱循環系統

Araya®內聯螢光檢測系統

Agripheno™基因分型採用KASP（KompetitiveAllele Specific PCR）原理，對目標SNPs和InDels進行精準的雙等位基因分型。反應體系僅1.6μl，具有高通量、低成本，準確率和檢出率接近100%的明顯優勢。

>>服務流程<<

>>客戶提供<<

每個位點至少10個陽性對照。 

>>服務周期<<

 引物測試完成後，每批樣品一周內出結果。

>>服務特點<<

高通量、低成本、快速準確，引物測試免費。

>>應用案例<<

☑ 牛毛基因分型

項目背景：牛奶裡的蛋白有兩種，酪蛋白和乳清蛋白。酪蛋白中的β酪蛋白分為A1和A2型。人在消化蛋白的時候，消化酶會在A1β酪蛋白67號位置一刀切，產生一種7個胺基酸的肽鏈（BCM-7），而無法切A2蛋白。BCM-7會導致許多人無法吸收牛奶中的營養成分，通常表現為喝奶後出現不同程度的脹氣、腹痛、腹瀉等胃腸不適現象。而A2型牛奶更易吸收。A1, A2的區別是由奶牛的基因不同造成的，不同基因的奶牛會生產出含有不同蛋白質類型的牛奶。所以，需要檢測奶牛的基因型用於奶牛育種。

項目目的：檢測不同奶牛的SNP基因型（決定牛奶A1A2類型的位點）。

實驗過程：

分型結果：

每個數據點代表一個獨立的DNA樣本的螢光信號，相同基因型的樣本會發出相似水平的螢光，因此富集在一起。

延伸閱讀：

▪ 基因組時代用於作物改良的高通量表型分析

▪ 高通量表型與基因組學的結合改善小麥育種預測和選擇精度

▪ AgriPheno新推出Nexar超高通量分子標記服務

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