近年來原生質體融合技術迅速發展，但如何有效地挑取融合子仍是一個難題，而將培養中的細胞進行DAPI染色，標記細胞核，即可對核進行計數等研究。
DAPI 是啥
DAPI （4,6-diamidino2-phenyl-indole dihydrochloride），中文名稱是4，6-聯脒-2-苯基吲哚。
DAPI染色原理：
DAPI 是一種常用的DNA特異性染料，這種染料可以用汞弧燈或氬離子雷射的紫外光來激發，發射出明亮的藍色螢光。該染料與DNA的結合是非嵌入式的，主要結合在DNA的A-T鹼基區，結合後產生的螢光基團的吸收峰是358nm而散射峰是461nm，正好UV（紫外光）的激發波長正好是356nm，使得DAPI成為了一種常用的螢光檢測信號。這種藍色的螢光染料結合在雙股DNA的小溝上,特別容易和AT鹼基團相結合，其螢光壽命分布曾用於確定結合位點的不均勻性.DAPI與雙股DNA結合時，其螢光強度增加20倍左右，這是由於DAPI和小溝處的水分子都被置換。DAPI與單股DNA結合時螢光強度一般不會增加。DAPI的螢光在它與葡聚糖磷酸鹽、SDS、多磷酸鹽其它多聚陰離子(Polyanion)相結合時也會增加。DAPI還可與肌質網,微管蛋白和微管相結合。DAPI有較強的消光係數,是螢光最強的DNA染料之一。
雖然Hoechst染料螢光可能更強一些，但其光穩定性不如DAPI。DAPI在瓊脂中檢測雙股DNA靈敏度要明顯高於溴化乙錠(EB)，在RNA存在的條件下對DNA的選擇性也高於EB等染料。現在DAPI常於作螢光染色的復染，標記出細胞核。快速簡便成功率高，整個染色過程只需十分鐘，而且DAPI極不易淬滅。一般購買的都是原液，需加Triton－X100配成工作液，-20度保存即可。
DAPI染色結果為什麼和想像中差距那麼大？
我的染色圖：
不清楚或者糊成一片
染色時間不夠
染色時間過長，用力過猛！
別人的圖片：
還可以染真菌菌絲的細胞核
注意事項：
1、DAPI強烈致癌，操作時要戴上手套。
2、貯存液用70%酒精配製，濃度100µg/ml，可用黑紙包住，長期凍存。使用液按1:1000用PBS稀釋，最終濃度100 ng/ml。
DAPI染色觀察細胞核小秘訣：
核酸染料 4',6-Diamidino-2-Phenylindole（DAPI）（Invitrogen，D3571），10 mg 粉末用 2 mL 滅菌蒸餾水溶解，配製成濃度為 10.9 mM 的母液，-20°C 避光保存，母液用水按 1:5000 的體積比進行稀釋後作為染色液的工作濃度。
菌絲和遊動孢子囊用濾紙吸去表面殘餘水分後充分侵潤於 DAPI 染液中，避光放置 5 min 左右，用滅菌蒸餾水衝洗數次。在螢光顯微鏡下進行觀察，激發光波長範圍為 330-405 nm。使用軟體 ZEN 2010 進行螢光強度分析。
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