儒家經典《大學》中有「大學之道，在明明德」的論述，曲阜市明德學校因此而得名。學校將「明德」作為核心辦學理念，將「文化滋養，立德樹人」作為育人主線，在校訓「知禮明德，依仁弘道」的引領下走出了一條惠風和暢、德禮並行的現代辦學之路。
學校在「明德」理念的引領下，以培養學生成為「謙謙君子、時代公民」為目標，開發「明德樹人」校本課程，以「孝悌忠信、禮義廉恥」為基本內涵，結合青少年身心成長發展規律，由淺入深、循序漸進地開展以「禮」為核心的主題實踐活動，如「開筆禮」「尊師禮」「孝德禮」等。學校還開展以「張揚個性、展示自我」為主題的系列活動，每學期以學部為單位組織學生開展經典誦讀比賽、傳統美德故事比賽、傳統文化故事手抄報、作文比賽等。每學年開展一次全校傳統文化匯報展演，讓學生在潛移默化中感受經典文化的魅力。
學校把「志於道，據於德，依於仁，遊於藝」作為社團創建的基本原則，將優秀傳統文化的豐富內涵融入各類社團活動，創建了金石傳拓、翰墨書法、民樂、陶藝等類別的精品社團。社團活動側重於學生內心對文化內涵的體悟和實踐。例如，金石傳拓社團傳拓用墨不拘濃淡，濃不浸入畫裡，淡而筆鋒逼真為妙，需憑藉經驗調控紙張溼度，調節墨水的輕重。在規範操作的基礎上，引導學生理解「以和為貴，過猶不及」的文化內涵，讓學生在傳拓過程中感悟文化的博大，體會傳統技藝的珍貴。
學校深入挖掘《論語》中的教育思想，創建了「學疑練」智慧課堂教學模式。該模式是對「學」的形式，即自學、對學、組學、群學的靈活運用，讓學生當堂質疑、探疑、釋疑，體驗發現、研究、解決問題的過程，最後通過當堂訓練和課後訓練進行鞏固。智慧課堂要求教師在課堂教學中讓學生「感受過程、習得規律、發展智慧」，從目標問題入手，注重學思結合，充分發揮每名學生的潛在能力，通過自主學習、合作探究、交流展示等方式，達到質疑、探疑、釋疑的教學目的，並通過練習、踐行鞏固所學，激發學生的智慧潛能。
學校把師德師風作為教師考核的核心內容，通過開展「向道德模範學習」「職業道德培訓」「師德標兵評選」等活動，引導教師弘揚師道、以德施教，彰顯新時代的師德風採。學校制定了《1236課堂教學改革實施意見》，即制定一個高效課堂實施方案，推動「走出去、請進來」和督查反饋兩個策略，抓好課堂教學組織、管理制度、後勤三個保障，用好智慧講堂、行為規範、三級建模、四項評比、「五課」同建、分級評價等六條路徑，確保課改落地生根。