Cell:環狀RNA有望作為癌症生物標誌物

2020-11-28 生物谷

2019年2月11日/

生物谷

BIOON/---隨著新技術允許科學家們深入研究基因組和外顯子組,一類新的稱為環狀RNA(circular RNA, circRNA)的RNA可能發揮著一種有趣的作用。

在一項新的研究中,來自美國密西根大學的研究人員對多種癌症中的circRNA進行了編目,並進行了初步研究,表明這些穩定的結構可能作為血液或尿液中的癌症

生物標誌物

。相關研究結果發表在2019年2月7日的Cell期刊上,論文標題為「The Landscape of Circular RNA in Cancer」。

圖片來自Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2018.12.021。

circRNA是一種

非編碼RNA

,它們形成閉合的環狀結構而不是線性結構。新的RNA測序方法曝光了這些circRNA,但是人們對它們起作用的原因或方式知之甚少。不過它們的穩定結構使得它們成為癌症

生物標誌物

的理想候選對象。

這項新的研究確定了癌症中的circRNA目錄,從而為未來的研究構建了一個資料庫。論文共同通訊作者、密西根大學轉化病理學中心主任Arul M. Chinnaiyan博士說,「我對circRNA作為非侵入性

生物標誌物

的潛力感到非常興奮。鑑於它們的穩定性,我們可能能夠在癌症患者的血液或尿液中檢測到它們。這可能對癌症的

診斷

或預後有用。」

作為MiONCOSEQ項目的一部分,這些研究人員從800多個

腫瘤

樣本中發現了circRNA。他們證實為MiONCOSEQ項目開發的捕獲RNA測序在檢測circRNA方面比現有方法更為強大。

Chinnaiyan說,「這種捕獲方法可能是有限的,這是因為它基於我們用來捕獲RNA的探針。但是,全外顯子組捕獲方法使得它具有重大的意義。我們通過這種方式捕獲大量的RNA。這就是為何我們能夠鑑定出如此多的之前並不知道的circRNA。」

這種技術僅需少量總RNA就能夠鑑定出circRNA。這意味著它們可能在RNA被稀釋的地方被檢測到,比如血液或尿液。

此外,這些研究人員還鑑定出幾種在前列腺癌組織中發現的circRNA。通過評估來自前列腺癌細胞的circRNA,他們發現它們比線性RNA更穩定。它們也可在尿液樣品中檢測到。

Chinnaiyan說,「我們能夠證實這些circRNA存在於尿液中並且來自前列腺癌的circRNA可被檢測到。我們未來的研究將探究這些circRNA作為尿液或血液中的癌症

生物標誌物

。」

這些研究人員將他們的研究結果轉變為一個名為MiOncoCirc的資料庫,這個資料庫對

腫瘤

樣本中報導的circRNA進行編目。這種資源可供科學家們使用,有助於開發新的癌症

生物標誌物

。(生物谷 Bioon.com)

參考資料:Josh N. Vo et al. The Landscape of Circular RNA in Cancer. Cell, 2019, doi:10.1016/j.cell.2018.12.021.

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