話說光合色素分子閉門家中坐，光從天上來。光合色素分子中的一些電子本來安分守己，各安天命。照了光之後，被光賦予了力量，變得不安分了。它們知道了世界很大，想要出去看看，於是乎離家出走。
色素分子的孩子（電子）丟了，正常情況下應該出去找孩子啊！但是，它們腦路清奇，它們知道找孩子的難度太大，還不如從別人家搶一個來得實在些。於是，它們就去鄰居家搶了來。它們的鄰居也如它們一樣腦路清奇，於是就A搶B的，B搶C的……總得有個頭吧，是的，這個「頭」是水分子。
水分子是最慫的，沒得可搶了，只好自認倒黴，任由別人將孩子搶走。家裡孩子丟了，生活也過不下去了，離婚吧。氧元素家裡有8個弟兄姐妹（8個質子），勢力大，把所有的家財都帶走了，剩下的孩子（電子）也帶走了，形成了O2分子。氫元素淨身出戶，形成氫離子。
再說一個一個的電子離家出走之後，形成電子流。電子流推動一個泵將氫離子從類囊體外主動運輸到類囊體腔中，在類囊體膜兩側形成了濃度梯度，腔內氫離子濃度高，腔外濃度低。這就像水電站發電一樣，氫離子濃度梯度相當於水位，氫離子從腔內通過ATP合酶流到類囊體腔外，在這個過程中釋放的能量推動ATP合成。
電子的能量釋放到一定程度之後，另一束光照過來，電子又一次活躍起來，繼續流動，最後在酶的催化下和H+、NADP+結合形成NADPH。也就是說，在光反應中電子的最終歸宿是NADPH。
這就是光合作用的光反應，在此過程中生成了氧氣、ATP和NADPH。