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我科學家首次展示RNA剪接「分子時鐘」精確原子模型，有望推動RNA相關遺傳疾病治療
聊點科技【我科學家首次展示RNA剪接「分子時鐘」精確原子模型，有望推動RNA相關遺傳疾病治療】西湖大學生命科學學院施一公教授研究組題為《ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化剪接體激活過程中結構重塑的分子機理》的論文，11月27日在《科學》雜誌以長文形式發表。
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我科學家首次展示RNA剪接「分子時鐘」精確原子模型
此文報導了釀酒酵母處於激活狀態的剪接體2.5埃的高解析度電鏡結構，該結構是目前報導的最高解析度的剪接體結構，首次展示了剪接體狀態轉變過程中的「動力驅動」蛋白——ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化其重塑的結構基礎，為理解剪接體激活重塑的分子機理提供了迄今最清晰的結構信息。
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我科學家首次展示RNA剪接「分子時鐘」精確原子模型 有望推動RNA相關遺傳疾病治療
此文報導了釀酒酵母處於激活狀態的剪接體2.5埃的高解析度電鏡結構，該結構是目前報導的最高解析度的剪接體結構，首次展示了剪接體狀態轉變過程中的「動力驅動」蛋白——ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化其重塑的結構基礎，為理解剪接體激活重塑的分子機理提供了迄今最清晰的結構信息。
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我科學家首次展示RNA剪接「分子時鐘」精確的原子模型
該結構是目前報導的最高解析度的剪接體結構，首次展示了剪接體狀態轉變過程中的「動力驅動」蛋白——ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化其重塑的結構基礎，為理解剪接體激活重塑的分子機理提供了迄今最清晰的結構信息。每種生物的行為、語言、思考等一切生命活動都是由基因所控制。
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我科學家首次展示RNA剪接「分子時鐘」精確原子模型-光明日報-光明網
此文報導了釀酒酵母處於激活狀態的剪接體2.5埃的高解析度電鏡結構，該結構是目前報導的最高解析度的剪接體結構，首次展示了剪接體狀態轉變過程中的「動力驅動」蛋白——ATP水解酶/解旋酶Prp2及其激活因子Spp2催化其重塑的結構基礎，為理解剪接體激活重塑的分子機理提供了迄今最清晰的結構信息。
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施一公等報導釀酒酵母剪接體處於完成RNA剪接後構象的高解析度電鏡...
中的3』剪接位點如何被識別，第二步轉酯反應如何發生以及成熟的mRNA如何被釋放等關鍵問題提供了重要的結構信息。 RNA 剪接是真核生物基因表達調控的重要環節之一，負責執行這一過程的是細胞核內一個巨大且高度動態變化的分子機器——剪接體（spliceosome）。從1977年首次發現RNA剪接至本世紀初，科學家們通過免疫沉澱、基因敲除、交聯質譜、建立體外剪接反應系統等研究手段，初步建立起剪接體的組裝與解聚的發生過程，以及蛋白與蛋白、蛋白與核酸之間的相互作用、相互調控等複雜的RNA剪接調控網絡。
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施一公研究組發文報導釀酒酵母剪接體處於完成RNA剪接後構象的高...
RNA 剪接是真核生物基因表達調控的重要環節之一，負責執行這一過程的是細胞核內一個巨大且高度動態變化的分子機器——剪接體（spliceosome）。從1977年首次發現RNA剪接至本世紀初，科學家們通過免疫沉澱、基因敲除、交聯質譜、建立體外剪接反應系統等研究手段，初步建立起剪接體的組裝與解聚的發生過程，以及蛋白與蛋白、蛋白與核酸之間的相互作用、相互調控等複雜的RNA剪接調控網絡。
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Nature:針對RNA轉錄和剪接的新觀點!磷酸化調節著RNA聚合酶II對不...
論文通訊作者、麻省理工學院生物學教授、懷特黑德生物醫學研究所研究員Richard Young說，「凝聚物代表了分子生物學家對基因控制的思考方式的真正轉變。如今，我們為這一思考添加了一個關鍵的新層，這增強了我們對剪接和主要的轉錄複合物RNA聚合酶II的理解。」Young的實驗室一直處於研究凝聚物形成方式和時間以及它們在基因調控中的功能的最前沿。
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施一公研究組在《科學》發文報導剪接體 激活過程中結構重塑的分子...
該結構是目前報導的最高解析度的剪接體結構，首次展示了剪接體狀態轉變過程中的 「動力驅動」 蛋白 ——ATP 水解酶 / 解旋酶 Prp2 及其激活因子 Spp2 催化其重塑的結構基礎，並結合大量生化實驗，闡明了 Prp2 在前體信使 RNA 上單向移動的分子機理，回答了 Spp2 如何通過將 Prp2 錨定在剪接體上輔助其發揮重塑剪接體的功能等一系列重要科學問題。
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施一公團隊在剪接體三維結構及RNA剪接分子結構領域取得新進展
8月21日，清華大學生命科學學院施一公教授研究組在國際頂級期刊《Science》同時在線發表了兩篇研究論文，題目分別為「3.6埃的酵母剪接體結構
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科學家揭示RNA摺疊背後的原理
RNA分子在DNA等遺傳信息的存儲和傳播、蛋白質等生命系統的功能中起著關鍵作用，其核心功能是在細胞內進行摺紙式的複雜摺疊。通過下一代高通量測序技術，利用化學成像的方法將RNA摺疊成動態形狀，Lucks等人發現了一系列RNA分子摺疊趨勢的相似性，並將這些RNA分子稱為核糖開關。核糖開關作為天然的生物傳感器會監測細胞的內部和外部狀態。
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科學家發現人類細胞表面穩定附著RNA分子
然而除了這些已知類型的分子，近日科學家們發現，人類細胞的外表面還穩定附著了一類過去鮮有人知的RNA分子。這些RNA分子既沒有封裝在任何囊泡裡，也不會輕易從細胞表面脫落。 之所以此次科學家們能在小鼠細胞和人類細胞中檢查出maxRNA的存在，得益於專門開發的表面測序（Surface-seq）技術。研究主要作者之一張良方教授是納米醫學領域的創新者，他的團隊開發了一種納米技術，可以從細胞上抽提出一部分細胞膜，包裹在納米顆粒上。
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科學家發現人類細胞表面穩定附著RNA分子
然而除了這些已知類型的分子，近日科學家們發現，人類細胞的外表面還穩定附著了一類過去鮮有人知的RNA分子。 根據在Genome Biology正式發表的一篇研究論文，加州大學聖地牙哥分校（UCSD）鐘聲教授與其合作者張良方教授、陳真教授共同領銜的研究團隊，利用專門開發的檢測和測序技術鑑定出，這類細胞表面RNA分子由細胞核內的基因組編碼產生。
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研究人員發現了調節神經發生的特定環狀RNA
多種基因在分化時上調或下調，產生神經元特異性蛋白和核糖核酸(RNAs)，包括環狀rna (circRNAs)。這類環狀rna直到最近才逃脫了常規檢測，儘管這些分子在哺乳動物大腦中高度表達。然而，腦表達環狀rna的功能作用仍然是未知的。
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奮鬥在RNA剪接體的研究之路
研究表明，30%的人類遺傳紊亂以及多種癌症均與某些基因的錯誤剪接、剪接體蛋白組分的突變以及剪接體的錯誤調控有關。然而，剪接體催化過程中不同構象高解析度結構的缺失嚴重限制了人們對剪接體工作機制以及RNA剪接的分子機理的理解。因此，對於剪接體以及RNA剪接通路上各複合物結構的研究，是真核生物生命活動最基礎的研究工作之一，也是當今世界最富有挑戰性、最亟待解決的課題之一。
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...利用新型CRISPR/Cas13靶向冠狀病毒SARS-CoV-2等RNA病毒
通過靶向人RNA轉錄本中成千上萬個不同的位點，這些研究人員開發出一種基於機器學習的預測模型，以加快鑑定最有效的Cas13嚮導RNA（gRNA）。這種新技術可以讓科學家們通過交互式網站和開源工具箱加以使用，以預測定製RNA靶標的gRNA效率，並為所有人類蛋白編碼基因提供預先設計的gRNA。
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越來越多的證據表明,地球上的生命不僅僅始於RNA
地球上的生命是如何起源的一直讓科學家們著迷，但要想追溯數十億年前的生命並非易事。現在，越來越多的證據支持一種相對較新的假說，即生命是如何開始的:一種非常精確的RNA和DNA混合。 RNA和DNA都決定了所有生物生命的基因組成，DNA是基因藍圖，而RNA是藍圖的解讀者或解碼器。
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non-coding RNA databases匯總
21世紀初期，通過對人類和小鼠基因組分析發現，98%的序列被劃分到「junk「 DNA之列，除被注釋的mRNA之外，大多收轉錄本似乎是不能encode蛋白質的，而這些轉錄本便是ncRNA, ncRNA因此也正式進入科學家的視野。隨著測序技術的發展與計算生物學的興起，使得人們對RNA領域的理解越來越深入，ncRNA領域也越發火熱。ncRNA參與了大多數生物學過程，調節生理，發育甚至疾病。
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研究揭示RNA剪接新機制
研究揭示RNA剪接新機制 作者：小柯機器人 發布時間：2019/9/5 15:57:49 美國科羅拉多大學安舒茨醫學校區Rui Zhao研究組與加州大學洛杉磯分校的Z.
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有望治癒愛滋病?沉默HIV病毒儲存庫新進展!
然而，雖然潛伏期逆轉劑可以誘導HIV-1rna轉錄，但最近的證據表明，沒有T細胞激活的潛伏期逆轉不足以誘導抗原提呈和免疫清除。 Ho Ya-Chi組在JCI報導了一種小分子化合物可以抑制HIV儲藏庫再次激活，並且緩解HIV感染引起的免疫紊亂和慢性炎症。