中國首個NGS在臨床腫瘤學實踐中的大規模調研報告

2020-12-07 騰訊網

本文來源：基因Talks

2018年《JCO Precision Oncology》發表了一項具有美國NGS代表性的腫瘤醫生調研報告：75.6% 的美國腫瘤醫生都在用 NGS 基因檢測技術指導腫瘤治療！

2019年9月19日，CSCO燃石衛星會上報告了一項具有中國NGS代表性的腫瘤醫生調研報告：95.4%的中國腫瘤醫生願意在未來推薦更多患者選擇NGS檢測，同時，在不考慮經濟因素的情況下，46.5%的醫生會推薦NGS大panel，大panel 的NGS已經逐漸成為臨床選擇趨勢！

中國NGS在臨床腫瘤學實踐中的調研報告

二代測序（NGS）又稱大規模平行測序，能夠同時對上百萬甚至數十億個DNA分子進行測序，實現了大規模、高通量測序的目標，是繼 Sanger 測序之後的革命性進步。近年來，NGS技術發展迅速，其應用已進展至臨床腫瘤檢測，尤其在中國的普及發展，由於沒有受到監管的控制，NGS的普及應用程度可能比國外更高。

中國腫瘤NGS臨床普及應用程度有多高？沒人統計過，基於此背景，CSCO腫瘤生物標誌物委員會攜手燃石醫學共同發起和完成了具有中國NGS代表性的腫瘤醫生調研報告。（內容來自2019年CSCO 燃石 衛星會，旨在進行學習交流，侵刪！）

調研方式：線上調研。

調研對象：30個省市的臨床腫瘤醫生（三甲醫院，主治及以上為主）。

調研數量：1020名（980名曾推薦患者進行NGS檢測的醫生 + 40名未曾推薦患者進行NGS檢測的醫生）。

調研醫生背景：看診癌種與中國癌症流行數據一致（Globocan2018）。

中國首個NGS在臨床腫瘤學實踐中的大規模調研報告將分為以下三個部分進行介紹： NGS臨床應用習慣； 不同癌種 Biomarker 認知程度； NGS檢測規範化情況。

NGS臨床應用習慣

NGS使用頻率：>30%腫瘤醫生每個月NGS檢測處方量超過5個；表明NGS檢測已成為中國腫瘤臨床醫生的常規檢測工具！

NGS檢測主要目的：臨床指導用藥！（國內臨床NGS檢測主要目的：1. 臨床指導用藥；2. 復發監控、療效評估；3. 跨適應症用藥 vs 美國臨床NGS檢測主要目的：1. 臨床指導用藥；2. 復發監控、療效評估；3. 跨適應症用藥）

NGS使用目的與各癌種目前診治現狀高度相關：輔助診斷和用藥：肺癌，結直腸癌，乳腺癌等；復發監控療效評估：子宮內膜癌，淋巴瘤，肝癌等；跨適應症用藥：淋巴瘤，乳腺癌，胃癌/食管癌等；臨床入組：尿路上皮癌，卵巢癌，肝癌等。

遺傳篩查關注度最高癌種：卵巢癌（54%）> 子宮內膜癌（38%）= 乳腺癌（38%）> 結直腸癌（37%）等。

NGS應用場景：以一線治療為主導，NGS檢測在臨床診療的各階段都有應用；晚期一線治療（胰腺癌，淋巴瘤，肺癌等） > 術後輔助治療 （子宮內膜癌，肝癌，結直腸癌等）> 晚期後線治療（胰腺癌，卵巢癌，淋巴瘤等） > 新輔助治療（尿路上皮癌，前列腺癌，胃癌/乳腺癌等）。

NGS主要參數關注順序：腫瘤醫生在具體推薦檢測 panel 時，基因數目是臨床考慮的主要參數。基因數目 > 變異類型是否覆蓋 > 測序深度 >最低檢測限。目前，超過半數臨床醫生開始關注NGS的具體質控參數。在不考慮經濟因素的情況下，46.5%的醫生會推薦大panel，大panel的NGS已經逐漸成為臨床選擇趨勢！

不同癌種 Biomarker 認知程度

肺癌Biomarker：EGFR、ALK、ROS1、KRAS、PD-L1等。62.8%的醫生同時關注EGFR、ALK、ROS1這三個基因；免疫治療在肺癌中受到認可，>50%醫生關注PD-L1的表達；單次檢測已經無法滿足肺癌的臨床需求，多基因平行檢測是肺癌的剛需。

結直腸癌 Biomarker：KRAS/NRAS、BRAF、MSI等。

胃癌/食管癌/EGJ癌 Biomarker：MSI，PD-L1，TMB，HER2等。

乳腺癌 Biomarker：HER2，BRCA1/2，CDK4/6等。

全癌種免疫 Biomarker：絕大多數醫生重視免疫治療，最為關注PD-L1的檢出，此外，67.5%醫生同時關注PD-L1和TMB。

NGS檢測規範化情況

選擇檢測平臺時，精準檢測、生信解讀、質控成為臨床醫生最重要考量因素。

規範化檢測背書：國際認證、NMPA審批；75.4%的醫生認為，擁有國際質量管理體系證書代表NGS檢測規範化！

23.27%臨床專家對NGS實驗室認證體系完全不了解。

月均>10個患者進行NGS檢測的醫生中，30.36%從未收到過送檢樣本不合格/樣本質量警示提醒。

58.47%的醫生常規推薦1-2家檢測公司，41.53%的醫生常規推薦≥3家檢測公司。

中國NGS臨床應用主要限制因素：價格高、是否有臨床價值、缺少接觸渠道。價格高在美國也是主要限制因素。

超過 95% 醫生願意在未來推薦更多患者選擇NGS檢測！

重 點 總 結

在推薦患者進行NGS檢測的醫生中，超過 30% 臨床醫生每月NGS檢測大於5個，NGS已經成為腫瘤臨床腫瘤醫生常用檢測工具；

不同醫生對NGS檢測目的、臨床應用場景略有不同，但均與各癌種目前診治現狀高度匹配；

基因數目是臨床選擇NGS考慮的主要參數，在不考慮經濟條件下，超過300基因的大panel成為臨床選擇趨勢；

免疫Biomarker如 PD-L1，TMB已經成為常用靶點之後臨床最為關注的分子標誌物；

23% 的臨床醫生對NGS實驗室認證體系完全不了解，超過 30% 常用NGS的臨床醫生從未收到不合格/警戒提示，90% 醫生臨床醫生NGS報告需要解讀，說明國內NGS檢測的規範化及教育仍任重道遠。

參考資料：

1.Freedman A N, Klabunde C N, Wiant K, et al. Use of next-generation sequencing tests to guide cancer treatment: results from a nationally representative survey of oncologists in the United States[J]. JCO Precision Oncology, 2018, 2: 1-13.

——本期完——

我們（醫世象，微信ID：medhealife）

致力於癌症、慢病、婦幼等領域的科研成果報導，以及科普知識的傳播；

關注於腫瘤、婦幼、病理、檢驗、內科等科室的最新資訊及政策指導；

為醫生、患者以及相關科研機構人員提供最新的實訊；

為醫學惠民貢獻一份力量。

相關焦點

  • 燃石醫學獲批中國首個腫瘤NGS檢測試劑盒
    該試劑盒是中國首個基於高通量測序技術(NGS)以及伴隨診斷標準審批的多基因腫瘤突變聯合檢測試劑盒，將用於幫助非小細胞肺癌患者精準選擇靶向藥物治療的方式。2016年9月，國家藥品監督管理局批准該試劑盒作為中國首個腫瘤NGS檢測產品進入 「創新醫療器械特別審批程序」。
  • 中國首個癌症早篩前瞻性大規模多中心註冊臨床試驗結果公布
    澎湃新聞2020年9月27日訊 9月25日，2020年中國臨床腫瘤學會（CSCO）學術年會上，中國首個癌症早篩前瞻性大規模多中心註冊臨床試驗（Clear-C）的重要數據結果正式發布。「Clear-C」試驗，是將諾輝健康旗下自主研發的多靶點糞便FIT-DNA聯合檢測技術——常衛清與傳統的結直腸癌臨床篩查手段FIT（便隱血檢測）進行了「頭對頭」比對研究。
  • 燃石醫學上市首日大漲近50%!納斯達克迎來首個中國腫瘤NGS企業
    在六年的發展中，無論是拿下「腫瘤NGS第一證」，還是2019年初的8.5億元人民幣C輪融資，燃石醫學始終保持在腫瘤NGS伴隨診斷行業的前列。 根據燃石醫學招股書中引用的灼識投資諮詢（China Insights Consultancy, CIC）行業報告，在2019年的中國腫瘤NGS市場中，燃石醫學市場份額處於領先地位。
  • 廣州藥企燃石醫學首個腫瘤NGS檢測試劑盒上市
    燃石醫學創始人兼執行長漢雨生表示，該試劑盒是中國首個基於高通量測序技術(NGS)以及伴隨診斷標準審批的多基因腫瘤突變聯合檢測試劑盒，將用於幫助非小細胞肺癌患者精準選擇靶向藥物治療的方式。 　　據21世紀經濟報導記者了解，實際上，早在2016年9月，國家藥品監督管理局就已經批准該試劑盒作為中國首個腫瘤NGS檢測產品進入 「創新醫療器械特別審批程序」。
  • 中國腫瘤NGS第一股燃石醫學赴美上市
    通過提前思考入院工作的瓶頸和壁壘，燃石醫學在行業進展推演的過程中，判斷出能否將基於捕獲的NGS實驗方法自動化對NGS入院市場開發的決定性作用，2017年燃石醫學開始和安捷倫科技公司合作共同開發中國首個基於捕獲法的NGS全自動文庫製備系統Magnis BR，並於2019年推出產品開始市場推廣。
  • 扎堆上市背後:中國腫瘤NGS檢測第一股燃石醫學領跑
    中國的臨床腫瘤學NGS市場規模可能在120億左右，以目前腫瘤領域測序公司的營收情況來看，現有市場規模不到20億，整體市場估計還有6倍左右空間。以美國腫瘤基因檢測公司Guardant Health為例，市值78億美元，國內腫瘤基因檢測企業亦有可能達到此規模。如何在保證技術領先的同時，找到持續的盈利點，取得商業上的成功?這是擺在國內企業面前的重要挑戰。
  • 腫瘤基因檢測公司扎堆上市:中國腫瘤NGS檢測第一股燃石醫學領跑
    來源：嘿財經腫瘤基因檢測賽道競爭膠著，扎堆上市也意味著競爭進入新階段。中國的臨床腫瘤學NGS市場規模可能在120億左右，以目前腫瘤領域測序公司的營收情況來看，現有市場規模不到20億，整體市場估計還有6倍左右空間。
  • 科學家完成首個大規模蛋白質基因組分析
    所以現在，基於較大組織的質譜分析是進行大規模蛋白質組學和PTM鑑定的重要手段。該項研究的主要通訊作者、美國西奈山伊坎醫學院遺傳學和基因組學教授王沛在接受《中國科學報》專訪時表示，在治療兒科腦瘤時，需要精確的藥物方法限制危害大腦發育的毒性
  • 全球首個腫瘤二代測序（NGS）指南出爐
    所有的腫瘤患者除了人手一份的病理報告還需要一份基因檢測報告。儘管基因檢測已成為臨床的標準動作，但醫學界尚未制定用於臨床的二代測序規範指南建議。2.在高分化和中分化神經內分泌腫瘤（NETs），宮頸癌，唾液癌，甲狀腺癌和外陰癌中檢測腫瘤突變負荷（TMB）。3.強烈建議臨床研究中心在分子篩選過程進行多基因測序，增加獲得新藥物的機會並加速臨床研究。
  • 科學家完成首個大規模蛋白質基因組分析 兒童腦瘤有治了
    所以現在，基於較大組織的質譜分析是進行大規模蛋白質組學和PTM鑑定的重要手段。另一方面，兒科腦瘤是兒童癌症死亡的第二大原因，僅次於白血病。一些兒科腦瘤類型的預後很差，5年生存率不到20%，例如高級別膠質瘤和非典型畸胎樣橫紋肌樣腫瘤。改善患兒的治療策略迫在眉睫。
  • 醫科院腫瘤醫院應建明教授:腫瘤NGS入院病理專家關注什麼?
    近日，中國醫學科學院腫瘤醫院病理科主任應建明教授接受了測序中國專訪，深度分享了醫院NGS平臺搭建的考量因素以及腫瘤NGS的現狀和未來臨床的應用方向。一、建庫方法學的選擇應建明教授：腫瘤NGS檢測有兩大環節——建庫和測序。
  • 專訪泛生子CEO王思振:腫瘤NGS行業將迎來進階發展
    「現在還沒有一個國家或者是一個公司能夠真正大規模地將基於 NGS 的腫瘤液體活檢技術進行早篩商業化，不僅是中國，在全球範圍內，基於 NGS 液體活檢的癌症早篩目前還處在技術和產品升級優化的階段。」王思振表示。但這一行業正在加速發展，上市公司的集中湧現就是十分明顯的信號。
  • 2020中國腫瘤學大會在廣州召開
    本次大會秉承「腫瘤防治，贏在整合」的主題，通過80個前沿專題，聚焦「基礎研究」，尋找科學問題，釐清研究思路；關注「臨床研究」，論道研究感悟，分享創新成果；推動「成果轉化」，搭建溝通橋梁，促進研企合作；開設「新品發布」，發新書、推新藥、展新裝；解構「智慧醫院」，共探大數據、雲計算、人工智慧，推動智慧醫療。　　14日上午，大會舉行開幕式。
  • 2020年中國腫瘤學大會(CCO)報導:中國消化道腫瘤領域年度進展
    2020年中國腫瘤學大會（CCO）學科前沿專場，北京大學腫瘤醫院沈琳教授為大家盤點《中國消化道腫瘤領域年度進展》。　　　　02：免疫一線治療　　KEYNOTE-590研究是全球首個顯示PD-1免疫檢查點抑制劑聯合化療一線治療局部晚期或轉移性食管癌，相比當前標準的含鉑化療方案可以帶來顯著OS、PFS、ORR、緩解持續時間（DOR）獲益的III期臨床研究，其結果必將改變局部晚期或轉移性食管癌一線治療的臨床實踐。
  • 滬建首個兒童血液腫瘤資料庫
    □記者 許沁晚報訊 今天上午，上海交通大學醫學院附屬上海兒童醫學中心兒童血液腫瘤中心大樓奠基。與此同時，上海兒童醫學中心還將建立國內首個兒童血液腫瘤診治信息資料庫，將收集血液腫瘤患兒在發病症狀、醫療過程、預後情況，以及生活情況長期追蹤等方面的信息，用於幫助分析來自不同區域的病兒在疾病發展上的各種情況、治療效果和生活質量。
  • 中國腫瘤NGS第一股!燃石醫學登陸納斯達克,市值25億美元
    根據灼識投資諮詢（China Insights Consultancy, CIC）行業報告， 在2019年的中國腫瘤NGS行業中，燃石醫學市場份額處於領先地位：在基於NGS檢測選擇癌症治療藥物的患者中，26.7%選擇了燃石醫學，肺癌達到31%。
  • 中國流式細胞儀市場調研報告(2020年)發布
    目前流式細胞儀主要應用於科研領域和臨床領域。在科研領域的應用以免疫、腫瘤、單細胞研究為主；在臨床上，流式細胞儀主要應用於淋巴細胞亞群分析及絕對計數、HLA-B27的檢測以及血液病/淋巴瘤的免疫分型。除了中心實驗室及檢驗科以外，應用的臨床科室主要集中在血液科、腫瘤科等。此外，疾控系統也將流式細胞儀應用於HIV監測。
  • 對比DNA-NGS與RNA-NGS檢測融合基因的臨床意義
    哈佛大學醫學院近期發表的一項癌症中融合/重排變異的大規模研究顯示[6]，通過 DNA-NGS檢測到的13,698個融合變異事件中，「基因---基因間區域」融合模式的比例為28%；「基因---基因」融合模式的比例為38%；「基因間區域---基因間區域」融合模式的比例為34%（圖3）。
  • 指南·共識|哪些腫瘤標誌物和基因檢測適用於肝膽腫瘤?
    （3）建議使用血清學糖類抗原（CA）19-9、CA125及癌胚抗原（CEA）聯合檢測，結合影像學特點作為CCA臨床診斷的標誌物。 （4）建議使用血清學CA19-9檢測，結合影像學特點作為膽囊癌臨床診斷的標誌物。
  • 紅杉資本投資企業、中國腫瘤NGS第一股燃石醫學(BNR.US)上市首日高...
    美股 紅杉資本投資企業、中國腫瘤NGS第一股燃石醫學(BNR.US)上市首日高開高走收漲49.27% 2020年6月13日 07:00:00 智通財經網 智通財經