研究揭示人類對真菌進化有重要影響
手工麵包酵母與水果和其他天然來源的菌株有遺傳聯繫。圖片來源:Getty
本報訊酵母通常不被認為是一種能馴化的生物。說到馴化的動物,人們首先想到的可能是狗、貓和牛,但人類在真菌的進化過程中扮演了重要的角色。12月9日發表在《當代生物學》上的一項研究報告稱,人類已經使大多數麵包酵母菌分化為兩種不同的菌群:一種用於大規模的工業麵包製作,另一種用於手工製作酵母麵包。工業菌株開始發酵更快,但手工製作酵母有更多負責麥芽糖代謝的基因拷貝,這一過程通常發生在發酵過程的後期,有助於使麵團發酵。
「這是一篇很好的論文。」美國太平洋西北研究所研究酵母的高級研究員、並未參加這項研究的Aimee Dudley說,「這是有道理的,因為我們知道歷史上人們是如何烘焙麵包的。」
該研究合作者、法國國家農業研究所進化遺傳學家Delphine Sicard解釋說,麵包已經存在了幾千年,隨著工業時代大規模生產酵母發酵劑的戲劇性轉變,她的團隊想了解這些變化是如何影響酵母進化的。酵母馴化已經在其他食品和飲料(例如奶酪、葡萄酒和啤酒)中得到了研究,但尚未在麵包中進行。因為這些酵母菌株中有許多是四倍體,即含有四組同源染色體的細胞,這使得研究它們的種群遺傳學比二倍體或單倍體更為複雜。
歷史學家和科學家一直認為,啤酒廠和麵包師在歷史上交換過他們的酵母,而這次的研究結果為這一觀點增添了分量。
Sicard的團隊從法國、比利時和義大利獲得了198種酵母菌株,從發酵劑試劑盒或國際酵母標本中獲得了31種工業菌株。他們使用流式細胞儀分析了每個菌株的染色體組數量,並使用微衛星標記分析了二倍體和四倍體的遺傳多樣性。隨後,Sicard和同事分析了17種烘焙酵母菌株和《自然》雜誌2018年發表的研究中描述的1011種其他釀酒酵母菌株的新測序基因組,最終創建了一個系統進化樹,並繪製了拷貝數的變化圖。
他們發現,酵母菌株通常含有更多基因拷貝數,這些基因編碼蛋白質運輸和調節麥芽糖酶和異麥芽糖酶,以及分解麥芽糖和異麥芽糖的酶本身。拷貝數的異常可能對細胞有害,但作者解釋說,它們也能使細胞在嚴格的選擇時期迅速適應,比如在用於製作酵母麵包的有毒高麥芽糖和異麥芽糖環境中增殖。
研究人員發現,在一個僅以麥芽糖為碳源的合成酵母環境中,這些基因副本更多的酵母在發酵結束時比副本更少的酵母更豐富。Sicard解釋說,無論手工麵包師故意將他們認為最有效的酵母發酵劑傳下去,還是使酵母進化以適應環境,最終結果是手工酵母非常適合製作特別的酵母麵包。「這是馴化基因的一個好例子。」Sicard說。
同時,工業麵包師似乎選擇了能更快開始發酵的酵母——研究中,酵母接種後產生1 克二氧化碳的時間比平均速度早半小時。它會優先分解葡萄糖,而不是分解更複雜的糖,如麥芽糖和異麥芽糖,後者需要更多的時間來分解。工業菌株和手工酵母菌株開始發酵的速度都比其他酵母(包括啤酒和葡萄酒菌株)快。(馮麗妃)
來源: 《中國科學報》