吐蕃王朝崩潰後，西藏高原進入了長達400餘年的割據混亂時期。在這段漫長的歲月裡，吐蕃王室後裔吉德尼瑪袞在阿里的不讓（普蘭縣）建立了古格王朝。
當吉德尼瑪袞老去時，他裂土封王，將三個兒子分封各地，各自建國。
其中，長子貝吉德·日巴袞（通常簡稱貝吉袞）獲封拉達王，以今日列城（今印控克什米爾列城）為中心，轄瑪域、拉達（今日土和克什米爾）地方；次子扎西德袞為普蘭、亞孜王，轄古格、普蘭和亞孜（今日尼泊爾之木斯塘）；三子德祖袞為桑噶三門、比地、比角王，主要轄古格以西，拉達以南今印度境內的桑噶、果松等地。這就是歷史上有名的「三袞佔三圍」。
從此，象雄（羊同）地區改稱為「阿里速古魯孫」（意為阿里三圍或阿里三部）。這是「阿里」一詞的肇始，其意為吐蕃後裔的「屬地、領地」。
隨後，阿里地區組建了一個以古格為首的國家聯盟。
拉達克雖然名義上是一個獨立王國，但在其國家歷史的早期，古格王國對其擁有近乎統治級別的影響力。
按照藏文史料《拉達克王統記》的記載，當時的拉達克被分為上、下兩個部分。上部拉達克靠近勃律，長時間被講韃靼語為主的克什米爾人控制。這部分族裔因接近阿富汗，轉而信奉了伊斯蘭教，而下部拉達克則信奉佛教，保持了和西藏相近的風俗。在很長一段時間的拉達克歷史中，抵禦上部拉達克穆斯林侵襲的工作是由古格王朝軍隊負責的。由此可見，古格王朝的強勢地位。
早期的古格國家聯盟，處於完全獨立的狀態。既沒有和西藏其他地區的政權發生多少聯繫，其版圖也不隸屬於西藏其他地區的政權。但隨著蒙古勢力的崛起，元朝在西藏（烏斯藏）派駐軍隊維護驛路交通，兩次提兵入藏打擊反對者，並至少進行了三次以上的人口普查（括戶）。也就是從這個時期起，包括拉達克在內的西藏，被一起納入了中國的版圖。
隨著古格王朝實力的衰落，漸漸做大的拉達克王國開始侵襲古格的領土。這便和當時居於衛藏的格魯派甘丹頗章政權產生了根本性的矛盾。
古格遺址
清康熙十八年（1679年），拉達克和衛藏格魯派政權在阿里爆發了一場意義深遠的戰爭。這場持續四年的戰爭，被稱為「古格之戰」，或「衛藏——拉達克戰爭」。
雖然戰爭初期，拉達克獲得了一定的戰場優勢，但隨著清朝以及蒙古實力派對格魯派政權支持，拉達克的失敗不過是遲早的事。
五世達賴喇嘛阿旺羅桑嘉措欽點甘丹次旺（噶爾丹策旺）為統帥，領蒙藏聯軍大敗拉達克軍隊，也給從未見識過騎兵衝鋒的拉達克人一個深刻認識蒙古鐵騎的機會。
不甘心失敗的拉達克王德登郎嘉，轉而向印度的莫臥兒王朝求援。但一個新巨頭的登場徹底改變了戰爭格局。這個新入場的強人，就是縱橫新疆草原的綽羅斯·噶爾丹。這位蒙古準噶爾部的「博碩克圖汗」與康熙皇帝打得你死我活。但在阿里，他們卻分別成了格魯派政權的幫手。
綽羅斯·噶爾丹
甘丹次旺在五千準噶爾鐵騎的幫助下，兵圍拉達克首都列城。康熙二十三年（1684年），拉達克國王德登郎嘉親自到蒙藏聯軍的軍營中叩頭認罪，表示「願意做任何被要求的事情」。
最後，雙方在丁莫崗達成口頭協議，再次明確了拉達克作為西藏政權的屬國地位，還規定藏傳佛教是拉達克的國教，王室不能信仰異教（伊斯蘭教）。
藏文史料《頗羅鼐傳》中記載：「歷代神聖藏王，與拉達克王子洛桑白瑪是西藏的近親，特予撫慰，賜千餘戶，乃封為王」。
也就是說，至少在17世紀晚期，拉達克依舊是西藏領土的一部分。但到了十九世紀下半葉（1834年至1841年，清道光年間），在英國殖民者的支持下，查漠道格拉王室（錫克王國的屬國）出兵侵略西藏，因藏語中，將道格拉人稱為「森巴」，故此史稱「森巴之戰」。
「森巴之戰」最終決定了拉達克的命運。
道光十四年（1834年）道格拉人入侵拉達克，佔領拉達克及巴爾蒂斯坦全境；道光二十一年（1841年）道格拉人繼續侵略西藏，與清軍發生軍事衝突，並最終與衛藏政權（格魯派地方政權）籤訂停火協議。
雖然清朝保住了阿里的大部分地區，但拉達克卻被生生割去，被併入了印度的多格拉土邦。
但道格拉人和格魯派籤署的協議之草率，不但沒有解決任何問題，反而成了之後雙方各執一詞的理由。因為這份本來就沒什麼約束力的協議分別由波斯文和藏文書寫，但兩種文字的內容存在很多出入，也沒有規定以哪個版本為主。難怪英國作家在《中印邊境》一書中揶揄道：「僅僅這一點，就有足夠的資料，可以使練達的外交家們辯論幾代了。」
駐藏大臣衙門
更有意思的，協議是由格魯派的地方政權具名籤署的，清朝駐藏大臣從未在上奏中提及此協議。因此，身在北京的清朝皇帝可能根本就不知道有過這麼一個邊境協議。新中國政府也從未表示認可此協議。
道光二十二年（1842年），在道格拉人的控制下，拉達克國王貢嘎郎嘉被廢黜，綿延八百多年的拉達克王國滅亡。
道光二十六年（1846年）3月，道格拉人又被迫和英國殖民者籤署了《阿姆利則條約》，其建立的查謨王國也逐漸淪為英國的附庸，包括拉達克在內的克什米爾地區落入英國人之手，成為英屬印度的一部分。這成了之後印度對拉達克地區提出主權要求的基礎。
民國三十六年（1947年），英國撤出印度次大陸，印、巴兩國分治，克什米爾地區成了印巴相爭的焦點，直接誘發了第一次和第二次印巴戰爭。