日本姓氏眾多，從使用人數龐大的主流姓氏，到使用人數極少的稀有姓氏，其中還有不少標了假名才能讀出來，光看漢字完全不知道怎麼讀的姓氏。
日本排名44,874名，全國只有約50人的「青龍」（せいりゅう）姓氏，可說是十分罕見的姓氏之一。青龍這個姓氏主要分布於鹿兒島、東京周邊以及滋賀地區。日本姓「朱雀」（すじゃく）的人口，總共約有320人，排名全國第16,547名，起源於京都南部的朱雀村以及福岡縣北部的筑前朱雀氏，目前姓「朱雀」的人多集中於福岡縣。而集中於日本京都的「玄武」（げんぶ），是非常罕見的姓氏，全日本大約只有10人有這個姓氏，在日本排名為第79,022名，十分珍稀。另外，因為日本沒有白虎這個姓氏，因此神獸系列只能三缺一。「四月一日」這個姓氏也是一個只有約10人的罕見姓氏，排名全日本第94,405名，現在只集中於日本的宮崎縣，其名字的由來也是眾說紛紜。「八月一日」也是出名的日期相關罕見姓氏，人數稍微比四月一日多一點點，不過全國也只有約80人左右，排名為第35,726名。名字的由來相傳與群馬縣吾妻郡於農曆的八月一日採摘稻穗的習俗有關，是穂積氏的變形，念法也不同；這個姓氏目前比較集中於群馬縣。日本的姓氏大約可分為兩類，一種是世代傳承的貴族姓氏，基本上在古時候的日本只有貴族、武士才能夠擁有姓氏；另一類則是於1875年（明治8年）時，明治天皇頒布了「平民苗字必稱義務令」之後，規定所有日本人限期內都一定要有自己的姓氏，因此突然間創立了非常多的明治新姓。所以，在日本不管是魚、蝦、蟹類還是青菜、豆腐都有可能成為姓氏。比如像集中於臨海地區的「魚」姓，大多為從事漁師或跟魚有關的職業，屬於職業姓氏。而「豆腐」跟「砂糖」這些姓氏也有著賜姓一說；據說「砂糖」姓氏起源於宮崎縣的日南市，為江戶時代的藩主所賜與的姓，不過也與製作砂糖這個職業有關。至於「鴨」氏則為古代的大族、鴨君、鴨縣主的子孫，從飛鳥時代即有鴨君這個姓氏。「海藻」姓氏則與收集海藻的區域有關；而「茄子」姓氏則發源於遠江國敷知郡茄子一色邑（也就是現在的靜岡縣西部），和發源於富山縣的「牛」姓氏一樣，是屬於比較傳統的姓氏。
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