明朝定都南京，現在的江蘇地位大增，設南直隸，轄今天的江蘇、安徽、上海。清朝初年，將南直隸改名為江南省。到了1661年，江南省分拆為江南左和江南右。1667年，江南右改名為江蘇省（取江寧府、蘇州府首字），江南左改名為安徽省，至此，現在江蘇省的輪廓大致形成。
在清朝時，江蘇省一大特色是實質上的雙省會。首先，兩江總督駐江寧府，江蘇巡撫駐蘇州府。其次，江蘇省設置了兩個布政使（主管全省的財政、民政及人事），一是江蘇布政使，與江蘇巡撫同駐蘇州，主管蘇州府、鎮江府、常州府、松江府、太倉州相關事宜；二是江寧布政使，與兩江總督同駐江寧，主管江蘇其他地區。其實，江寧布政使在1761年才設立，之前駐在江寧的是主管安徽省相關事宜的安徽布政使，直到1760年，安徽布政使才從江寧府遷往安徽省城安慶。
江蘇省在清朝時，共轄八府三直隸州一直隸廳，府、直隸州、直隸廳相當於現在的地級行政單位。隨著歷史的發展和變遷，這十二個地級行政單位，只有六個還是地級市的名字了，今天就把相關情況總結如下：
蘇州府：蘇州市。明代設蘇州府，清代因之，府治設在吳縣，管轄範圍大體上與今天的蘇州市差不多（太倉在雍正年間升級為直隸州）。前文說過，清代的蘇州府是江蘇巡撫和江蘇布政使駐地，是江蘇雙省會之一。民國廢蘇州府留吳縣。1953年1月，蘇北行署區和蘇南行署區合併為新中國的江蘇省，吳縣縣城析出（吳縣建制還存在），設立省轄蘇州市，蘇州這個名字就這樣從蘇州府變成了蘇州市。而吳縣則在2000年，成為蘇州市吳中區和相城區。
鎮江府：鎮江市。北宋曾經置鎮江府，明清均有鎮江府建制，府治設在丹徒縣。民國廢鎮江府，留丹徒縣。1928年，南京再次成為民國首都，於是，丹徒改名為鎮江，並成為江蘇省會，一直到1949年。解放後，鎮江縣城析出，設立縣級鎮江市，鎮江縣其餘部分改為丹徒縣。1983年，鎮江成為地級市。2002年，丹徒縣撤縣設區，成為鎮江市丹徒區。
常州府：常州市。明代設常州府，清代因之，府治在武進縣，管轄範圍是現在的常州大部分地區、無錫全境以及靖江、張家港。民國廢常州府，留武進縣。1953年1月，新中國江蘇省成立，武進縣城析出，設立省轄常州市。而武進建制還在，2002年改為常州市武進區。
揚州府：揚州市。明代設揚州府，清代因之，治所設在江都縣，管轄今天揚州市大部分地區及東臺、興化（雍正年間通州升為直隸州）。民國廢揚州府，留江都縣。解放後，江都縣城析出（江都縣建制還存在），設立縣級揚州市。1983年，揚州成為地級市。2011年，江都成為揚州市江都區。
淮安府：淮安市。明代設淮安府，清代因之，府治設在山陽縣（今淮安市淮安區），管轄今天的淮安市、鹽城市大部分地區（海州在雍正年間升級為直隸州）。至於淮安和淮陰的歷史，因為在前文《解放後，江蘇省共有十一個市被撤銷》中詳細的寫過，本文就簡單一說：民國廢淮安府，山陽縣改名為淮安縣，清河縣改名為淮陰縣。解放後設淮陰專區，1983年，淮陰市成為地級市，2001年，淮陰市改名為淮安市，至此，淮安這個名字，從淮安府沿用到淮安市。
徐州府：徐州市。明代設徐州直隸州，清代改為徐州府，府治設在銅山縣。管轄今天的徐州、宿遷及安徽的碭山、蕭縣等地。民國廢徐州府，留銅山縣。抗戰時，銅山縣城析出，設立徐州市。1953年1月，新中國江蘇省成立，徐州成為江蘇省轄市。而銅山縣則在2001年，成為徐州市銅山區。
剩下的府州廳，簡略的說一下現狀：江寧府（明代為應天府），即現在的南京市。松江府，治所華亭縣，管轄今天上海蘇州河以南地區，華亭縣即現在的松江區。通州直隸州，清代升通州為直隸州，即今天的南通。太倉直隸州，太倉原屬蘇州府，清代雍正年間升為直隸州，管轄今天上海蘇州河以北地區。海州直隸州，清代雍正年間升為直隸州，管轄今天的連雲港及沐陽、新沂等地。海門直隸廳，清代乾隆年間置，管轄今天的海門和啟東。
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