1949年10月，時任四野十二兵團司令的蕭勁光，突然接到軍委電報：「主席召見，有要事相商，」後來的事，我們都知道了，毛主席點名蕭勁光成為新中國的第一任海軍司令。
毛主席的女兒李訥曾回憶，主席很少到別人家吃飯，但是曾唯獨在蕭勁光的家裡吃過一次飯，那是1957年在青島時，毛主席對他說：「回去告訴你老伴，叫她親自給我做幾個菜，麻醬茄子，苦瓜炒鴨子，一盤辣椒，一碗米飯蠻好嘛！」
毛主席與蕭勁光的深厚友誼持續了一生，早些年間，蕭勁光曾落難差點被處決，毛主席出面救了他。
1933年5月，蔣介石準備調集50萬大軍圍剿紅軍在江西的根據地，當時他派3個師前來攻打中央蘇區的北部門戶，黎川。駐紮在黎川的，正是蕭勁光部隊，當時想要守黎川是根本不可能的事，因為在蕭勁光的麾下，只有70個人。
蕭勁光後來回憶說：「我的主力部隊已隨三軍團到福建去了，剩下一個獨立師，在敵人進攻前的一個星期，又被調往峭石，歸錢總直接指揮，當時我手上只有一支70人的教導隊和一些地方遊擊隊守黎川。」
70個人對敵軍3個師，恐怕沒有一個指揮官會選擇硬拼，作為毛主席稱讚的：「科班出身的第一個學軍事的軍事家」蕭勁光選擇了撤退，退到了距離黎川60裡的溪口。
消息傳到中央蘇區，博古和張聞天憤怒了，他們當即準備批判蕭勁光，毛主席支持蕭勁光，在敵強我弱的情況下，蕭勁光的撤退是很有必要，也是很正確的。
隨後，蕭勁光組建了紅七軍團，11月，蕭勁光奉命在滸灣阻擊，等到彭德懷的三軍團來到，一起向敵軍發起進攻，那時候，蕭勁光先是和敵人進行了一天一夜的交戰，彭德懷患了病，由彭雪楓指揮，第三天，敵人衝破了阻擊。
這一戰，彭老總之後主動向前委說明情況，責任不在蕭勁光，但是博古等人，決定立即批判他。
1934年初，蕭勁光被押上法庭，蕭勁光心裡不服氣，在法庭上激辯：「我手上的兵都被調走了，敵人是一個軍三個師，我怎能守住黎川？再說上級也沒有讓我死守黎川啊，我是差不多被敵人保衛的嚴重情況下，才帶70人的教導隊撤出。」
聽聞蕭勁光說出了事實真相，很多人緘默不語，在李德的意見下，最終法庭的判決結果是開除蕭勁光黨籍，軍籍，判處有期徒刑5年，
在獄中服刑時，毛主席派賀子珍來探望蕭勁光對他說：「你應該撤退，做的對，他們對你的決定是錯誤的。」毛主席的一番話，讓蕭勁光深受感動，給落難時的他很大的鼓舞。
後來蕭勁光被關了一個月，就被調到紅軍大學當教員了。
遵義會議後，中央在毛主席的建議下，恢復了蕭勁光的黨籍，軍籍，他又重新上了戰場，被任命為紅三軍團參謀長。
文革期間，毛主席公開的對林彪說：「蕭勁光是個老同志，你們老是整他幹什麼？」後來毛主席又說：「蕭勁光是個老同志，他上什麼賊船？他在，海軍司令不易人。」
自從1949年底，一直到1980年，蕭勁光當了整整30年的海軍司令。