太平天國農民起義軍在1853年3月19日攻佔南京後，以此為首都改名「天京」建立了政權。天王洪秀全作為太平天國的天王，曾刻了多種印璽，作為其最高權力的象徵，進行發布命令、調兵遣將之用。
洪秀全的印璽中，最重要的有三方金璽、玉璽和木璽。
隨著太平天國的失敗，這三顆印璽四處流落，分別經歷了不同的命運。
木璽較為簡易，由堅硬木製成，四面龍文，中刻「旨準」二字，這是天王洪秀全日常批籤奏章及批准印行書籍時鈐用的。
金璽與玉璽均十分珍貴，製作精美，洪秀全輕易不用，只有在太平天國重要的詔旨上才加蓋這兩方印璽中的一方。
玉璽為清白玉質，印紐兩側精雕著丹鳳朝陽，四周則刻有雙龍雙鳳，玉璽印面上刻有44個字太平玉璽，天父上帝，恩和輯睦，天王洪日，天兄基督，救世幼主，主王輿篤，八位萬歲，真王貴福，永定乾坤，永錫天祿。
金璽則最為貴重，它由一百多兩黃金鑄成，中刻「太平天王大道君王全」九個字。
1864年7月19日，天京城被曾國藩的湘軍攻破，三璽經歷了不同的命運歷程。城破那天，天王洪秀全已病故，太平軍將士們保護幼天王洪天貴福冒險突圍，突圍前，太平軍首領將天王的木璽密藏於刷書衙房屋的屋頂天花板上，後竟躲過清軍的搜查。一直未被人發現。
而金璽和玉璽密藏於天王宮殿中，被清軍搜出，上繳到湘軍統帥曾國藩那裡，曾國藩將這兩璽作為最重要的戰利品，派專人送往北京。
兩宮太后繳獲洪秀全金玉兩璽後高興異常，下令將這兩璽放置在皇宮紫禁城中最機密的權力中心：軍機處。
軍機處是清雍正皇帝下令設立的中央最高權力核心機構，只對皇帝個人負責，具有極大的權威性與機密性，地處紫禁城中心，警衛最嚴，不要說一般官員，就是王公顯貴，只要不在軍機處任職，想在這宅前站一下也是不允許的。可是，在金璽存放在這裡整整一年以後，突然竟在一夜之間一下不見了。
恭親王奕訢親自辦案。恭親王不愧是「鬼子六」，腦袋靈活，他派人到北京金銀首飾鋪、古玩店查訪，果然！不久就在東四牌樓的一家首飾鋪中查出：這首飾鋪曾熔化過一方金印，奕訢立即派人將該店老闆夥計嚴加審問，很快真相大白。
此案原來是在軍機處工作的刑部郎中兼軍機章京，滿人薩隆阿所為，此人因浪吃浪喝，入不敷出，經濟困窘，債臺高築，為擺脫困境，看到存放在軍機處已近一年的洪秀全金璽平時無人過問，便見財起意，乘人不備，夾帶在身，偷出宮外，送到一家熟識的首飾鋪熔為10根金條，他把以兩根金條到錢鋪換成的銀錢還了債，多餘的銀錢又很快被他吃喝揮霍掉了。清廷將薩隆阿革去官職，判為死刑。可惜的是，無比珍貴的太平天國金璽卻永遠從人間消失了。
洪秀全的玉璽雖歷經戰火與劫難，卻完好地保存下來，現珍藏於北京中國革命博物館。
至於洪秀全的那方木璽，就更加離奇了。在太平天國失敗後，木璽多年一直下落不明，直到1975年，也就是100多年後，南京瞻園路173號的住戶在翻修舊屋面時，於屋頂天窗的天花板旁，發現了一方被灰塵封沒的木璽，1982年南京市進行文物普查，該住戶將木璽獻出，失落100多年的洪秀全「旨準」木璽重見天日。