動物消化道內存在著大量的微生物，在長期進化過程中與宿主動物協同進化而具有許多重要功能，其中參與宿主消化道物質代謝與能量代謝是其最重要的功能之一。因此，消化道微生物群落結構的穩定，對於宿主營養物質的消化與吸收有重要作用。草魚是全球淡水養殖產量最大的一個品種，2009年草魚養殖產量佔我國淡水養殖總產量的21.4%，但迄今為止，尚缺乏對於草魚腸道微生物的深入研究。
近年來，中國科學院水生生物研究所王桂堂研究員學科組在「973」項目「淡水池塘集約化養殖的基礎科學問題研究」的支持下，對草魚消化道微生物開展了一系列研究工作。研究發現，草魚腸道存在核心的微生物區系，潛在的病原菌和益生菌都是草魚腸道區系的重要成員；消化道中有許多對食物消化起重要作用的纖維素降解細菌；底泥和水體中的微生物會最終影響腸道微生物群落結構，而食物中的細菌能夠快速改變腸道微生物區系；生長發育差異顯著的草魚其消化道微生物存在明顯差異。進一步的培養實驗發現，潛在的病原菌——氣單胞菌屬的種類恰恰又是消化道纖維素食物降解的重要類群之一。
該研究工作主要由吳山功副研究員等人完成，部分研究成果已經在《公共科學圖書館—綜合》（PLoS ONE）發表。（來源：中科院水生生物研究所）
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