中國的總督一職，形成於明朝，完善於清朝。如非要要探究哪個時期的總督權力更大，這還真不好比，因為明朝的總督，大多是臨時性的，而清朝時期的總督，卻是常設性的。
首先要搞明白的是，明朝為什麼要設立總督？
明朝最早的總督，是因為麓川之役，當時的明宣宗為了更好地調動資源應對雲南麓川宣慰司的思任發、思機發父子叛亂，便任命兵部尚書王驥總督軍務，尤其是雲貴一帶都必須聽從王驥的軍事任務調遣。
還有的就是北京保衛戰時，于謙總督全國軍務，可以調動全國一切資源支援北京城的守衛。
當然了，等戰爭結束，他倆的總督一職也隨之撤銷。也正是如此，明朝發現，如果有什麼事情是需要多個省份相互協同的，那就可以臨時性的設立一個總督，讓這個總督來協調各省之間的工作，從而提高工作效率。
於是乎，1497年為了處理陝西、甘肅、寧夏、延綏的軍務問題，明朝便設立三邊總督，1510年為了解決宣大和陝西等地的軍務及糧餉問題，明朝便設立宣大總督。總而言之，明朝的總督，是為了解決各省之間的某一問題而設立的，和這一問題不相關的，那總督就是沒有權力過問的。
另外大多數情況下，總督都是從中央派到地方去的，甚至可以說是代天巡狩，因此擔任總督一職的，要麼得位高權重，要麼就得深受皇帝信任。也因此，即便他們無法插手地方事務，但地方官員們也得對他們客客氣氣的，畢竟這可是能跟皇帝說上話的人。
但是在明朝後期，由於各種天災人禍導致各地百姓紛紛揭竿而起，明朝為了更好的鎮壓農民起義穩定局勢，便將全國劃分為多個區域，每個區域設立一名總督。這個時候的總督權力極大，不僅深受皇帝信任，代表著皇帝意志，還可以隨意調動轄區內的一切資源，毫無疑問，明朝這個時候的總督，權力是非常非常大的，都可以左右多個省份的走向。
那麼清朝，又為什麼要設立總督呢？
清軍入關後，在很多方面上都是以明朝的為基礎再加以改造，總督一職也因此得到承襲，但也做出了非常多的改變。
清朝將全國劃分為二十多個省，也因此就有二十多個巡撫。另外清朝又設立九個總督，每個總督統領一個或多個巡撫，也就是說，每個總督的轄區，是一個或多個身份。
這時候的總督，就不再是臨時性的，而是常設職務，是地方官，是清朝為了更好地管理地方而設置的。
清朝時期的總督可是封疆大吏，轄區內的政治、經濟、軍事、監察等等，都在總督的管理權限範圍之內。當然了，清朝也擔心總督會擁兵自重做大地方，因此清朝也設立了其他官職，來制約總督。
就例如，各地的地方事務，平時是由巡撫說了算。各地的軍隊，平時是提督說了算。監察工作，平時是監察使說了算。除非是在特殊時期，或者是戰爭期間，這才是總督都說了算。
另外清朝是不是的都會派出欽差大臣巡視地方，為的就是看看各個總督有沒有圖謀不軌的傾向。因此清朝時期的總督，實際上權力上是受到多方面鉗制的。
那麼問題不禁來了，到底是明朝的總督權力大，還是清朝的總督權力大呢？
如果是一般情況下，或者是和平時期，那就是清朝的總督權力大。為什麼呢？因為在一般情況下，明朝是不會設立總督一職，就算是有，也只是負責某一方面的事情，無權過問其他事宜。
但清朝的總督不一樣，一般情況下，他可是轄區內的最高長官，雖說受到各方面的鉗制，但畢竟天高皇帝遠，官大一級壓死人。
如果是在特殊時期，或者說是戰爭時期，那明朝的總督，和清朝的總督，權力是一樣的的。為什麼呢？因為在戰爭時期，他們都可以調動轄區內的一切資源，轄區內的所有人都必須聽從總督的命令。
所以總體上看，總督的權力，還是在清朝的時候比較大。