纖毛蟲
纖毛蟲屬纖毛門(Ciliophora)，大多數纖毛蟲在生活史的各個階段都有纖毛，以纖毛作為運動細胞器。纖毛在蟲體表面有節律地順序擺動，形成波狀運動，加之纖毛在排列上稍有傾斜，因而推動蟲體以螺旋形旋轉的方式向前運動。蟲體也可依靠纖毛逆向擺動而改變運動方向，向後移動等。在蟲體的近前端有一明顯的胞口，下接胞咽，後端有一個較小的胞肛。多數纖毛蟲營自生生活，少數可寄生於無脊椎動物和脊椎動物的消化道內。
車輪蟲
車輪蟲寄生在多種淡水動物的鰓及皮膚上，主要危害苗種，嚴重感染時可引起苗種大批死亡。車輪蟲用附著盤附著在魚體的鰓絲或皮膚上，並來回滑動。遊泳時一般用反口面向前像車輪一樣轉動，所以稱為車輪蟲。生殖用縱二分裂法和接合生殖。
車輪蟲蟲體側面觀如氈帽狀，反面觀圓碟形，運動是如車輪轉動樣。隆起的一面為前面或稱口面，相對而凹入的一面為反口面。口面上有向左或反時針發方向螺旋狀環繞的口溝，其末端通向胞口。口溝兩側個生一行纖毛，形成口帶，直達前庭腔。反口面的中間為齒環和輻線環。在輻線環上方有一馬蹄形的大核，一個長形的小核和一個伸縮泡，其中部想體內凹入，形成附著盤，用於吸附在宿主身上。車輪蟲用附著盤附著在魚體的鰓絲或皮膚上，並來回滑動。遊泳時一般用反口面向前像車輪一樣轉動，所以稱為車輪蟲。生殖用縱二分裂法和接合生殖。
魚鯴
魚鯴身體橢圓形，透明。蟲體分頭、胸、腹三部分。頭部的腹面有一對用作吸附在魚體上的吸盤和一個刺破魚皮膚的口刺。胸部分四節，每節有一對遊泳足。腹部不分節，為橢圓形的葉片，是魚蝨的呼吸器官。魚蝨沒有卵囊，卵直接產在水生植物或石塊上。卵圓形，黃色或褐色，外面有一層膠質物，藉以固定在其體物體上。水溫29-31℃時，10-14天即可孵出幼蟲。幼蟲孵出後，若兩天內找不到寄主，即行死亡。魚蝨離開魚體後，可在水中自由生活較短時間，所以它可以自行由一尾魚轉移到另一尾魚體上去，也能隨水流入其他水體中。
小瓜蟲
小瓜蟲為凹口科、小瓜蟲屬、多子小瓜蟲。這是一類體型比較大的纖毛蟲。它的形態在幼蟲期和成蟲期有很大的差別。小瓜蟲的幼蟲侵襲魚的皮膚和鰓，尤以皮膚為普遍。當幼蟲感染了寄主後，就鑽進皮膚或鰓的上皮組織，把身體包在由寄主分泌的小囊胞內，在胞內生長發育，變為成蟲。成蟲衝破囊胞落入水中，自由遊動一段時間後落在水體底部，靜止下來，分泌一層膠質的胞囊。胞囊裡的蟲體分裂法繁殖，產生幾百甚至成千的纖毛幼蟲。幼蟲出來，在水中自由遊動，尋找寄主，這就是小瓜蟲的感染期。幼蟲感染了新寄主，又開始它的生活史。
錨頭蚤
錨頭蚤(俗稱錨頭蟲)屬節肢動物甲殼類的一種。只有雌蟲才寄生在魚體上，長約1釐米。蟲體的後端，帶有1對卵囊。頭部分有叉狀兩角，似船錨，故此而得名。蟲體寄生四周組織常紅腫發炎，同時靠近傷口的鱗片被錨頭蚤的分泌物溶解，腐蝕成缺口。魚體初被蟲體侵入時，表現不安，食慾不好，繼而身體瘦弱，遊動緩慢。
此蟲可侵入鯉魚、鰱魚、鱅魚、草魚等魚的體表，對幼魚危害特別嚴重，可引起死亡(對大魚主要是影響生長)。此病流行地區廣，全國各養魚地區都有發現，終年可見，夏、秋季能引起嚴重流行病。
三代蟲
三代蟲，學名Gyrodactylus。三代蟲是雌雄同體，有卵巢2個及精巢一個，位於身體後部。三代蟲為卵胎生，在卵巢的前方有未分裂的受精卵及發育的胚胎，在大胚胎內又有小胚胎，因此稱為三代蟲。三代蟲身體扁平縱長，前端有兩個突起的頭器，能夠主動伸縮，又有單細胞腺的頭腺一對，開口於頭器的前端，此蟲沒有眼點，口位於頭器下方中央，下通咽、食道和兩條盲管狀的腸在體2兩側。體後端的固著器為一大形的固著盤。盤中央有2個大錨,大錨之間由2條橫捧相連，盤的邊緣有16個小鉤，有秩序地排列著。三代蟲用後固著器上的大錨和小鉤固著在寄主的身上，同時前端的頭腺也分泌粘液，用以粘著在寄主體上或像尺蠖一樣的慢慢爬行。
指環蟲
指環蟲的蟲體通常為長圓形，動作像尺蠖，寄生在各種魚類的鰓上、身體前端有4個瓣狀的頭器常常伸縮，頭部背面有4個眼點，在體後端腹面有一個圓形的固著盤，盤的中央有2個大錨，盤的邊緣有14個小構，在兩大鉤之間有l-2條橫棒相連。口通常呈管狀，可以伸縮，位於身體前端腹面靠近眼點附近，口下接一圓形的咽，咽下為食管，接著是分2支的腸，2條腸的末端通常在後固著盤的前面相連，使整個腸成環狀，但也有不相連而呈直管狀的。
九江頭槽絛蟲
九江頭槽絛蟲蟲體扁平，帶狀，乳白色，長20-230毫米。頭節心臟形，頂端有一明顯的頂盤，兩側各自有一個深的吸溝。頸節不明顯。頸節之後由許多片組成，前端節片寬大於長，成熟片近方形，孕卵節片長稍大於寬。每個節片內有一套雌雄性生殖器官。
華枝睪吸蟲
華枝睪吸蟲Clonorchis sinensis (Cobbold, 1875) Looss, 1907,簡稱華支睪吸蟲，又稱肝吸蟲(liver fluke)，華肝蛭。成蟲寄生於人體的肝膽管內，可引起華支睪吸蟲病(Clonorchiasis )，又稱肝吸蟲病。本蟲於1874年首次在加爾各答一華僑的膽管內發現，1908年才在我國證實該病存在。1975年在我國湖北江陵西漢古屍糞便中發現本蟲蟲卵，繼之又在該縣戰國楚墓古屍見該蟲卵，從而證明華支睪吸蟲病在我國至少已有2300年以上歷史。華支睪吸蟲體形狹長，背腹扁平， 前端稍窄，後端鈍圓，狀似葵花子，體表無棘。蟲體大小一般為10~25×3~5mm。
碘孢子蟲
碘泡蟲屬(Myxobolus)是原生動物門、粘體動物亞門、粘孢子蟲綱、雙殼目、碘泡蟲科的一屬。孢子卵形或橢圓形，扁平，前端有2個極囊，等大或不等。孢中質中有1個嗜碘泡。
有些種類可造成嚴重的魚病，如草魚餅形碘泡蟲(M. artus)、鱅鰓上的異型碘泡蟲(M. dispar)、鰱碘泡蟲(M. drjagini)等。它們廣泛寄生於魚類，所有飼養魚類和常見野雜魚均可被寄生。寄生部位有:鰓、皮膚、鰭、腦、膽、脾、腎、肌肉、膀胱、鰾。其他器官如輸尿管、鼻腔、生殖腺亦照樣可受侵襲。不論是江湖的魚類或小溪、小河、池塘，小溝、小蕩的魚類均可檢出。碘泡蟲感染率(粘孢子蟲類的其他屬亦有)有明顯的季節變化，其感染亦與宿主個體的大小有一定的關係，但與性別的關係不大。
斜管蟲
斜管蟲蟲體有背腹之分，背部稍隆起。腹面觀左邊較直，右邊稍彎，左面有9條纖毛線，右面有7條，每條纖毛線上長著一律的纖毛。腹面中部有一條喇叭狀口管。大核近圓形，小核球形，身體左右兩邊各有一個伸縮泡，一前一後。寄生在魚的鰓、體表，刺激寄主分泌大量粘液，使寄主皮膚表面形成蒼白色或淡藍色的粘液層，組織被破壞，影響魚的呼吸功能。病魚食慾差，魚體消瘦發黑，靠近塘邊浮在水面作側臥狀，不久即死亡。此病流行廣泛，對魚苗、魚種危害較大，能引起大量死亡，該寄生蟲繁殖最適溫度為12~18℃，初冬和春季最為流行。
刺激隱核蟲
刺激隱核蟲(Cryptocaryon irritans Brown) 又叫海水小瓜蟲，屬原生動物門、纖毛亞門、寡膜纖毛綱、膜口亞綱、膜口目、凹口科、隱核蟲屬的一種。刺激隱核蟲常寄生於海水硬骨魚類的皮膚、鰓的上皮下，可引起魚類的傳染性疾病。刺激隱核蟲與寄生淡水魚類的多子小瓜蟲(Ichthyophthirius multifiliis)很相似，所以又稱鹹水小瓜蟲。刺激隱核蟲呈球形或卵形，全身被有纖毛，前端有一胞口。區別在於，其大核呈卵圓形團狀，4~8個，一般4個，相連呈念珠狀，作"U"形排列。蟲體透明度低，顯微鏡下常呈黑乳白色，難見其大核。