武漢大學|讀完這篇「搜神記」,畢業論文有救了

【MBA中國網訊】新型冠狀病毒疫情形勢的變化引發了全球範圍的關注，也牽動著億萬民眾的心，各大國際期刊及數字平臺上的相關學術資源正大規模湧現。關鍵時期我們更要相信科學的力量，知己知彼，方能百戰百勝。學者們對病毒研究地越透徹，越有助於調整疫情防治方案、更好地控制疫情。

目前有些資料庫已陸續推出該疾病的防治、心理健康指導等方面的書籍。比如，易閱通電子書平臺和書香中國網際網路數字圖書館均已針對性推出「新型冠狀病毒肺炎防控專題」，從防治、心理健康等角度提出了指導。

下面，小布將分五個步驟來介紹本次文獻搜集、整理過程。

01相關研究與分析

冠狀病毒屬於冠狀病毒科、冠狀病毒屬，是自然界廣泛存在的一大類病毒。此次在武漢首先發現的冠狀病毒被WHO命名為2019新型冠狀病毒（2019-nCoV）。目前研究主要集中在生物醫學領域。由於疫情初次報導為2019年12月，所以近階段，重點關注一個多月以來，期刊和生物醫學網站的相關文獻。

確定檢索詞和檢索式

除WHO命名的2019新型冠狀病毒（2019-nCoV）以外，通過瀏覽國內外政府網站、生物醫學網站、媒體報導等有關2019年新型冠狀病毒的信息，我們初步確定檢索詞和檢索式。

檢索詞中文表述有：2019新型冠狀病毒/新型冠狀病毒/新型肺炎/新冠肺炎/新冠病毒肺炎/武漢肺炎/武漢新型肺炎/武漢病毒性肺炎等。

檢索詞外文表述有：2019-nCoV/nCoV/novel coronavirus/new coronavirus/China coronavirus/new China virus/Wuhan virus/novel chinese virus/newly identified coronavirus等。

根據以上檢索詞，初步擬定檢索式如下：

中文檢索式

SU='2019新型冠狀病毒' OR '新型冠狀病毒' OR '新型肺炎' OR '新冠肺炎' OR '新冠病毒肺炎' OR '武漢肺炎' OR '武漢新型肺炎' OR '武漢病毒性肺炎' OR nCoV

英文檢索式

SU=nCoVOR 「2019-nCoV」 OR「novel coronavirus*」 OR「new coronavirus*」 OR「China coronavirus*」 OR「new China virus*」OR「Wuhan virus*」 OR「novel chinese virus*」 OR「newly identified coronavirus*」

03選擇檢索工具開展檢索

根據本研究的學科特點和疾病的時間發展特點，可以先通過學術發現系統進行一站式搜索，了解概況；然後在能快速反映學術研究的綜合性資料庫和專業資料庫中查找；此外，生物醫學的開放獲取資源（如預印本平臺等）能較快發布相關研究，也是快速獲取研究信息的工具。

01通過學術發現系統搜索

通過武漢大學圖書館的學術發現系統「珞珈學術搜索」進行一站式檢索。學術發現系統除了能幫助研究者一站式發現相關研究文獻外，還能為後續更全面地選擇檢索所需的資料庫提供參考。

下圖是珞珈學術搜索查找出相關文獻的圖示。

下圖顯示了珞珈學術搜索中檢出文獻在不同資料庫中的文獻分布數量，據此可初步了解哪些資料庫中該主題研究較多，為資料庫的選擇提供了思路，後續可進一步利用這些資料庫進行檢索。

02從圖書館訂購的綜合性資料庫中查找

考慮到本研究的學科特性，重點選取綜合性全文資料庫和權威的二次文獻資料庫。

舉個例子，在中國知網中用「新型冠狀病毒」在主題欄位中查找，主要在期刊和報紙中有相關文獻。其中，關於2019年新型肺炎的期刊文獻有26篇。

外文資料庫實例，通過Wiley Online Library檢索後，可檢索到19篇相關文獻。

03從圖書館訂購的生物醫學專業資料庫查找

我館訂購的生物醫學專業資料庫，包括一次文獻庫和二次文獻庫，均能查找到相關文獻。

對於專業資料庫的選擇，可以藉助圖書館的資料庫導航功能，該導航可按學科推薦相關專業的資料庫。針對本研究，在資料庫導航中，重點選擇生物學科分類庫和醫學學科分類庫，使重要的專業資料庫不遺漏。

下圖為資料庫導航推薦的部分醫學學科資料庫。選擇生物學科，同樣可查看生物相關專業資料庫。

目前我館訂購的下列生物醫學專業資料庫中均有與本研究相關的文獻。

例如，EMBASE資料庫是全球權威性的生物醫學與藥理學文摘資料庫，在題名中查找，已收錄12篇相關文獻。

04通過開放獲取資源查找

目前生物醫學或相關學科的開放獲取資源較多，無論是文獻還是數據，都在很大程度上實現了學術成果的共享和研究。

國家科技圖書文獻中心（NSTL）以NSTL館藏資源為基礎，遴選了國內外呼吸道傳染病相關的文獻，同時也包括目前已經發表的最新新冠病毒相關文獻。文獻類型包括中外文期刊、會議錄、學位論文、權威報導等，面向中國大陸用戶提供全文。

Pub Med Central ( PMC )是美國國立衛生研究院下屬的美國國立醫學圖書館開發的生物醫學文獻資料庫。PMC提供部分免費及付費全文連結服務, 如免費的MEDLINE及其他相關資料庫接入服務。

預印本平臺是基於網際網路的新型數字學術交流系統和學術出版平臺，bioRxiv(生物預印本）、medRxiv（醫學預印本）、ChemRxiv（化學預印本）等預印本平臺，近期快速發布了研究新型冠狀病毒的文章。需要特別說明的是，預印本平臺論文不經過同行評審，發表速度快，但論文質量控制機制不如正式出版物，利用預印本資源時需要謹慎判斷。

此外，還有一些病毒資源庫或基因資料庫。例如，2019新型冠狀病毒資源庫（https://bigd.big.ac.cn/ncov/），收錄了來源於NCBI的GenBank資料庫和GISAID資料庫發布的2019新型冠狀病毒(2019-nCoV)病毒株的株名、採樣日期、採樣地點、樣本提供單位、數據遞交單位等元信息。GenBank序列資料庫（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/）可查找新型冠狀病毒的基因組數據。全球流感序列資料庫（GISAID）(https://www.gisaid.org/)收錄流感病毒基因序列，以及相關病毒學、臨床、流行病學和人口統計學信息，包括本次新型冠狀病毒基因組信息的共享。

以bioRxiv為例，從主題途徑查找，已有38篇相關文獻。

04檢索結果分析與檢索優化

01命中文獻情況

從檢索結果看，目前在綜合性資料庫和專業資料庫，以及預印本等開放網站均有相關文獻的發布，而且文獻呈現出每日增長的趨勢。一部分文獻發表在Nature,Nature Medcine,Lancet,Journal of Medical Virology,Eurosurveillance等期刊上。預印本伺服器上和醫學免費網站上也有較多文獻發布。

目前檢出的結果中，中文文獻主要是關於新型冠狀病毒疾病的預防、臨床特徵、治療等，外文文獻主要是研究新型冠狀病毒的起源、流行病學和臨床特徵、感染和免疫反應、傳播途徑、病毒結構或基因組數據等。

由於本次新型冠狀肺炎2019年12月才有報導，如果希望查看最新的研究成果，將查出的結果，按照時間降序排列即可。

02檢索優化策略

用「2019新型冠狀病毒」及其相關詞檢索，可查找到近一個多月的最新研究成果。對於研究者而言，如果希望了解更多文獻或查找冠狀病毒以前的文獻，可採取的擴大檢索範圍的策略包括：

（1）使用概念更寬泛的詞，例如中文用「冠狀病毒」，英文用「coronavirus*「檢索。

（2）調整檢索欄位，如從題名欄位，調整為主題欄位，甚至全文欄位。

（3）查看相關參考文獻。參考文獻反映了研究的引用和繼承關係。為了獲取更多的相關文獻，可以參看上述檢索結果的參考文獻，進一步獲取研究文獻。

（4）關注更多的學科領域。目前論文以生物醫學為主，疫情過後，可能會有更多領域會著手相關研究，如與疾病相關的公共管理，疫情與心理健康等等。

（5）關注更多文獻類型。目前主要關注近期的最新文獻，以期刊論文和網上資源為主。未來，還會有會議論文、學位論文、專利等更多類型的文獻產生。作為研究者而言，查找文獻則需要更廣泛地查找，獲得更為廣闊的視野。

相反，如果研究者希望獲得更精確的檢索結果，或者是權威的學術文獻，可採取的策略包括：

（1）儘量將檢索詞放在題名或關鍵詞中檢索。

（2）英文採用短語檢索，例如：「novel coronavirus」 。

（3）檢索結果限定文獻類型為研究型文獻。目前階段，儘量選擇學術期刊文獻，甚至是同行評審的期刊文獻中的研究論文。由於很多資料庫都含有多種文獻類型，查出來的有些文獻，有可能是相關新聞報導或評論文章等內容。例如在nature電子期刊資料庫上用nCoV查出的文獻中，News有7篇，Editorial有4篇，Comments and Opinion有2篇，Research有2篇，Research Highlights有1篇。重點要閱讀其中類型為Research的文獻。

（4）選擇權威資料庫中的文獻。權威資料庫中的文獻經過甄選，如WOS平臺收錄的文獻。

05檢索結果管理與跟蹤最新研究文獻的方法

預計未來新型冠狀病毒方面的文獻會呈現較快增長。研究者需要有一個高效的文獻管理工具軟體。NoteExpress是目前較流行的參考文獻管理工具軟體，可幫助研究者在整個科研流程中高效利用電子資源：檢索並管理得到的文獻摘要、全文；在撰寫論文時，方便地引用並自動生成參考文獻索引。

研究者如需持續獲取最新研究成果，可以利用資料庫的郵件通告(EMAIL-ALERT)功能。如Wiley Online Library,Elsevier SDOS,Springer等資料庫，在註冊並儲存檢索策略後，資料庫可以定期將研究者感興趣的領域或檢索式相關的最新文獻推送到註冊的郵箱。

好消息

為了支持抗擊疫情，知網、維普、萬方、Springer Nature，Elsevier，Wiley Online Library等超過20個資料庫開通了免費使用，或建立了新型冠狀病毒相關專題，預計未來免費開放的資料庫還會增多。同時，為方便大家使用，我館將陸續把這些免費資源放到圖書館資料庫資源導航中的「網絡免費學術資源」欄目，歡迎大家訪問。

下面將介紹22個新冠病毒免費資料庫，助你把論文寫在戰勝疫情第一線。

01NSTL（國家科技圖書文獻中心）「新型肺炎應急文獻信息專欄」專題資料庫

以NSTL館藏資源為基礎，遴選了國內外呼吸道傳染病相關的文獻，同時也包括目前已經發表的最新新冠病毒相關文獻。文獻類型包括中外文期刊、會議錄、學位論文、權威報導等。

網址：

https://www.nstl.gov.cn/index_coronaviridae.html

全文獲取方式：

中文文獻、開放獲取（OA）文獻，即時下載

館藏外文文獻、免費申請，優先處理

特別說明

面向中國大陸用戶提供全文，相應費用由NSTL全額補貼

02中華醫學會雜誌社新型冠狀病毒肺炎防治相關期刊

開放包括《英國醫學雜誌中文版》《中華醫學雜誌》《中華結核和呼吸雜誌》《中華預防醫學雜誌》《中華傳染病雜誌》等在內的34種與新型冠狀病毒肺炎防治相關學科的醫學期刊，供各界人士免費閱讀。

網址：http://journal.yiigle.com/

特別說明：查看全文需要先行註冊

03萬方醫學網新型冠狀病毒肺炎專題頻道

專題頻道整理了針對疫情國內外相關文獻信息，包括相關指南、相關科普、抗疫專家、文獻速遞等內容。

網址：

http://subject.med.wanfangdata.com.cn/Channel/7

04Springer Nature新型冠狀病毒論文

施普林格•自然精選了旗下期刊最新發表的有關冠狀病毒研究的論文，以及相關評論和圖書章節，提供免費獲取。

網址：

https://www.springernature.com/gp/researchers/campaigns/coronavirus

05Wiley Online Library新型冠狀病毒論文

Wiley開放旗下所有冠狀病毒相關論文

網址：

https://novel-coronavirus.onlinelibrary.wiley.com

機構帳戶用戶名：WUHU123

機構帳戶密碼：WUHU321

免費服務時間：即日起至2020年4 月（暫定）

06Elsevier新型冠狀病毒資源中心

愛思唯爾免費資源中心，內容涉及新型冠狀病毒（2019-nCoV）和中國疫情的最新信息。

網址：

https://www.elsevier.com/connect/coronavirus-information-center

07BioWorld新聞報導：新型冠狀病毒相關專題

該專題的文章來自於BioWorld對新型冠狀病毒暴發的持續報導，包括關於冠狀病毒的突破性研究、臨床、監管和商業發展的新聞，這些新聞可以追溯到1991年。特色話題包含發展中的疫苗和診斷學、病毒相關的科學研究、與以往疫情如SARS和MERS-CoV的比較、全球監管因素以及支持研究的商業新聞，包括發展合作和投資趨勢等。

網址：https://www.bioworld.com/

08Cell Press新型冠狀病毒資源中心

該資源中心頁面可查找2019-nCoV論文的投稿政策，以及Cell Press旗下期刊已發表的有關疫情和病毒的論文。

網址：https://www.cell.com/2019-nCOV

09DynaMed循證醫學資料庫新型冠狀病毒專題

DynaMed匯總了3,000多個醫學臨床課題，為醫生，醫學專業學生或醫護專業人員提供專業綜合信息。該庫中關於新型冠狀病毒的主題，現在免費開放。

網址：

https://www.dynamed.com/condition/novel-coronavirus-2019-ncov#GUID-9F4FF2A8-42A9-4FE5-AF41-5A9274470A90

10美國醫學會（JAMA）新型冠狀病毒專題

冠狀病毒研究專題含JAMA主編演講視頻、作者採訪音頻（含中文翻譯）、疫情發展地圖及其他豐富且實用的科學資源。

網址：

https://jamanetwork.com/journals/jama/pages/coronavirus-alert

11Emerald冠狀病毒及流行病管理相關專題

匯集了與冠狀病毒組和更廣泛的流行有關的許多研究資源。不僅涉及新型冠狀病毒的當前臨床挑戰，及世界如何應對其他先前的冠狀病毒爆發（尤其是SARS）和流行病的期刊圖書文獻資源。研究主題的範圍從諸如2003年SARS的法律和道德課程到針對全球問題的公共衛生方法以及SARS對旅遊業的影響等領域。

網址：

https://www.emeraldgrouppublishing.com/promo/coronavirus.htm?utm_source=twitter&utm_medium=social&utm_campaign=bnd_Coronavirus_landingpage_20200204_free

免費時間：即日期至2020年3月31日

12柳葉刀(Lancet)新型冠狀病毒資源中心

該資源匯集了《柳葉刀》期刊上出版的2019年新型的冠狀病毒（2019-nCoV）新內容。

網址：

https://www.thelancet.com/coronavirus

13全球健康藥物研發中心（GHDDI）

全球健康藥物研發中心（Global Health Drug Discovery Institute, GHDDI）及清華大學藥學院免費開放藥物研發資源，助力攻克新型冠狀病毒。初步措施包括（隨後網站會及時更新數據信息和新資源）：

（1）機構和科研人員開放，旨在共同開展基於不同靶點或表型的藥物篩選。分子庫包括ReFRAME化合物庫（內含全球最大的一萬兩千多個通過臨床一期的安全性已知的藥物分子），多樣性的合成分子庫，天然產物庫，中藥提取物庫等。

（2）開放GHDDI計算化學和藥物虛擬篩選平臺。針對新型冠狀病毒的多個靶點，通過高解析度晶體結構或同源建模，基於短期或中長期藥物開發目標，利用實體分子庫（例如ReFRAME分子庫）或千萬級虛擬篩選分子庫，開展高性能計算虛擬篩選尋找能夠對病毒起作用的起始藥物分子。

（3）運用GHDDI人工智慧藥物研發和大數據平臺，針對SARS/MERS等冠狀病毒的歷史藥物研發進行數據挖掘與集成，開放相關臨床前和臨床數據資源，以及針對新型冠狀病毒「老藥新用（drug repurposing）」預測結果，並跟進新型冠狀病毒最新科研動態，實時向科學界和公眾公布，為新型冠狀病毒科學研究提供重要數據支撐。

（4）協同藥物研發服務公司（感謝北京保諾BioDuro的慷慨貢獻），提供小分子化學合成、藥物設計、藥物化學、藥代動力學、靶點蛋白生產/生物物理實驗/結構生物學等多項服務。

網址：

https://ghddi-ailab.github.io/Targeting2019-nCoV/

14新型冠狀病毒國家科技資源服務系統

由國家微生物科學數據中心和國家病原微生物資源庫聯合建設，由中國疾病預防控制中心、中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所、中國科學院微生物研究所、中國科學院病原微生物與免疫學重點實驗、中國疾病預防控制中心-中國科學院微生物研究所病原微生物資源與大數據聯合研究中心等單位共同建設。系統具備毒種信息、引物信息、全球冠狀病毒序列信息查詢及分析等功能。

系統將隨著新型冠狀病毒科研工作的進展，及時發布關於新型冠狀病毒科技資源和科學數據的權威信息，為新型冠狀病毒科學研究提供重要支撐，並為應對當前新型冠狀病毒感染的肺炎疫情防控提供科技資源專題服務。

網址：http://nmdc.cn/#/nCoV

152019-nCov科研動態監測（中科院文獻情報中心）

科技信息監測服務平臺從情報工作的需求與工作流程出發，自動幫助情報人員從海量的網絡科技信息資源中發現最新最重要的科技資源，藉助信息抽取、自動分類、自動摘要、文本挖掘等方法，自動計算分析科技資源的情報價值、科技資源中包含的重要科技對象、重要科技術語，輔助情報人員快速發現研究領域的研究熱點、重要科技對象等等內容，從而提升情報工作的效率和效度。

網址：

http://stm.las.ac.cn/STMonitor/qbwnew/openhome.htm?serverId=172

16新型冠狀病毒信息中心（世界衛生組織(WHO)）

網址：

https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019

17新型冠狀病毒信息中心（美國疾病預防與控制中心(CDC)）

網址：

https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/index.html

18新型冠狀病毒信息中心（歐洲疾病預防控制中心(ECDC)）

網址：

https://www.ecdc.europa.eu/en/novel-coronavirus-china

18SSRN（預印本）冠狀病毒專題

SSRN是一個開放獲取在線預印社區網站，該專題包括關於新型冠狀病毒、SARS等傳染病的各類研究，涉及醫學、公共健康、法律、經濟等多學科領域。

網址：

https://www.ssrn.com/index.cfm/en/coronavirus/

20國家基因組科學數據中心2019新型冠狀病毒資源庫

收錄了來源於NCBI的GenBank資料庫和GISAID資料庫發布的2019新型冠狀病毒(2019-nCoV)病毒株的株名、採樣日期、採樣地點、樣本提供單位、數據遞交單位等元信息。通過該資源庫還可訪問到國家基因組科學數據中心基因組資料庫GWH從公共資料庫收錄的冠狀病毒科基因組和蛋白序列，用戶可基於Accession號、種名、屬名、採樣日期、採樣地點、宿主、分離源、發布日期等元信息篩選感興趣的冠狀病毒株，個性化選取序列進行下載以開展相關的科學研究。

網址：https://bigd.big.ac.cn/ncov/

21GenBank序列資料庫

由美國國家生物技術信息中心NCBI開發，包含了來自所有可獲得的公共來源的DNA序列，主要通過來自個別實驗室和大規模測序計劃的序列數據的直接提交，並與歐洲生物信息研究所的EMBL資料庫和日本DNA資料庫進行數據交換。

網址：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank

22全球流感序列資料庫（GISAID）

基於GISAID倡議建立，收錄流感病毒基因序列，以及相關病毒學、臨床、流行病學和人口統計學信息，旨在促進此類序列和相關數據的共享、研究和調查。

網址：https://www.gisaid.org/