結直腸腺瘤癌變基因圖譜繪出

2020-12-04 陝西黨建網

      近日,北京大學第三醫院付衛研究團隊與北京大學湯富酬研究團隊聯合在國際知名學術期刊《腸道》上在線發表論文,深入探究了結直腸癌的發生發展過程,揭示了腺瘤發生和癌變過程中的重要基因突變和轉錄組變化特徵,為結直腸癌預防、早期篩查和治療提供了新的線索和思路。

  據了解,結直腸癌是全球範圍內發病率第三、致死人數第四的惡性腫瘤,結直腸腺瘤是結直腸癌的癌前病變,從低級別腺瘤發展為腺癌需要10年以上時間。因此,深入解析低級別腺瘤向腺癌轉化的生物學機制對於結直腸癌防治有重要意義。

  家族性腺瘤性息肉病(FAP)是由APC抑癌基因胚系突變導致的常染色體顯性遺傳的結直腸腺瘤症候群,表現為大腸腸腔內布滿大小不一的腺瘤樣息肉,息肉至少在100枚以上。如不及時在腸鏡下切除息肉或者手術切除相應腸管,息肉癌變率高達90%以上。FAP患者手術切除標本中有大量處於不同演進階段的結直腸腫瘤性病變,這非常有助於闡明結直腸腺瘤的癌變過程。

  研究人員對7名FAP患者的手術切除標本進行了全基因組淺測序和全外顯子組深度測序,深入研究了同一個體中不同腫瘤間的譜系發生關係及腺瘤癌變過程中的基因組變異情況。同時,對7名FAP患者及2名散發性結直腸癌患者手術切除標本中的8757個細胞進行了高精度單細胞轉錄組測序,構建了腺瘤癌變過程的轉錄組圖譜,系統闡述了該過程中基因表達變化的重要特徵。

  該研究發現,肉眼可見的腺瘤已處於癌變過程後期,對腺瘤的積極處理和密切隨訪意義重大。出現頻率最高的體細胞致病突變是抑癌基因APC基因的二次失活突變,不同個體在其他致病基因突變譜上表現出強烈的個體間異質性。FAP標本大腸上皮中存在區域癌變現象,此發現對於進一步理解結直腸多發腺瘤的發生機制和臨床治療具有重要指導意義。與非FAP標本相比,在基因表達上FAP標本的癌旁上皮細胞已經表現出明顯的癌變傾向,此發現進一步證實了對APC胚系突變攜帶人群進行密切隨訪的重要意義。

  該研究還揭示了腺瘤發生和癌變過程中基因表達變化的關鍵特徵,部分解釋了腫瘤細胞中糖酵解增強現象,同時表明三羧酸循環和丙酮酸代謝水平的降低是腫瘤發生過程中的最早期事件之一,可能是FAP腺瘤預防和治療的潛在靶點。(特約記者仰東萍 通訊員周鑫)

責任編輯:高原

相關焦點

  • 專家繪出中國高致死性前列腺癌基因圖譜 填補空白
    中國專家繪出中國高致死性前列腺癌基因圖譜。研究示意圖中新網上海7月10日電 (孫國根 秦曉健 陳靜)記者10日獲悉,復旦大學附屬腫瘤醫院泌尿男生殖系統腫瘤多學科綜合診治團隊首席專家葉定偉教授和朱耀教授率領的臨床研究團隊,歷經4年艱苦研究,終於繪出中國高致死性前列腺癌基因圖譜,並發現,中國轉移性前列腺癌患者中胚系DNA修復基因突變率為12%。據悉,這樣的基因圖譜此前未有報導。
  • 科學家繪製正常結直腸上皮細胞體細胞突變圖譜
    科學家繪製正常結直腸上皮細胞體細胞突變圖譜 作者:小柯機器人 發布時間:2019/10/24 15:24:38 英國維康桑格研究所Michael R. Stratton小組繪製了正常結直腸上皮細胞的體細胞突變圖譜。
  • 結腸憩室或無患結直腸腺瘤高風險
    醫脈通編譯,轉載請務必註明出處近期,一項發表在《American Journal of Gastroenterology》雜誌上的前瞻性研究顯示,結腸憩室患者不存在患結直腸腺瘤的更高風險正如發表文獻中所報導的,216例患者(35%)檢出一個或多個結直腸腺瘤。在結腸鏡檢查確診的憩室和腺瘤(比值為,1.0;95%CI 0.7-1.4)或晚期腺瘤(OR 0.8;95%CI 0.4-1.5)的風險增加之間沒有關聯。即使患者有10個或更多的憩室,相較於無憩室的患者,其腺瘤(OR 1.1;95%CI 0.7-1.8)風險也不會增加。
  • 譜系依賴性基因表達程序影響結直腸癌的免疫圖譜
    譜系依賴性基因表達程序影響結直腸癌的免疫圖譜 作者:小柯機器人 發布時間:2020/5/27 14:37:38 韓國三星基因組研究所Woong-Yang Park和比利時魯汶天主教大學
  • 我國帕金森病基因突變圖譜繪出
    該研究從帕金森病(PD)相關基因的角度,首次針對中國大陸家族性帕金森病及早髮型帕金森病人群進行大樣本遺傳學研究,繪製了中國大陸帕金森病相關基因突變圖譜,系統地提出中國大陸人群帕金森病相關基因發病年齡譜,對帕金森病分子診斷與分型、精準治療具有指導性意義。  帕金森病的病因和發病機制多認為是老齡化、遺傳和環境因素及其相互作用。
  • 45歲,結直腸癌篩查年齡要提前了
    45-49歲之間的腫瘤檢出率也比50-54歲之間高出8%。。在40-44歲和45-49歲之間息肉的平均數(如果未經治療可以癌變的結腸內層生長物)和腺瘤檢出率(檢測到一個或多個腺瘤的結腸鏡患者的比例)也分別增加了95.8%和95.4%。這比45-49歲和50-54歲年齡組之間的增長幅度要大得多,分別為19.1%和11.5%。
  • 我國率先繪出石斑魚全基因組序列圖譜
    本報訊 中山大學和深圳華大基因研究院日前聯合宣布,石斑魚基因組序列圖譜繪製完成。中國工程院院士、中山大學生命科學學院林浩然表示,這是我國完成的第三個魚類基因組測序項目和全基因組序列圖譜,也是世界上首個鱸形目鮨科石斑魚類基因組序列圖譜。 石斑魚類隸屬鱸形目(Perciformes),鮨科(Serranidae),石斑魚亞科(Epinephelinae),石斑魚屬(Epinephelus),為暖水性礁棲魚類,廣泛分布於印度洋和太平洋的熱帶、亞熱帶海域。
  • 南林大教授10年研究 繪製我國首例林木基因圖譜
    2009年,他選擇回到了自己的母校,開始致力於解開中國林木基因的密碼,並成功繪製出了楊樹基因圖譜,這也成為我國首例「林木基因圖譜」,在節能減排、生物質新能源開發等領域意義深遠。  上月,尹佟明被評為「江蘇省十大青年科星」。他在接受採訪時說:「林木遺傳育種研究,國內外都還處於同一起跑線上,我更想為自己的祖國多做貢獻。」
  • "基因圖譜之父"薩爾斯頓
    在用中文簡單問候了「大家好」後,這位67歲的「基因圖譜之父」隨即展開了自己的演講,演講的題目名為「科學與倫理的向左走與向右走」。「為什麼有些人比另一些人更容易感冒?為什麼有些人比另一些人更愛發脾氣?除了後天的個性外,主要是先天的基因在不知不覺地影響著我們。」作為排列出首份動物基因圖譜的科學家,2002年諾貝爾生理學或醫學獎得主,薩爾斯頓的開場白並沒有拉出一副「高深莫測」的架勢。
  • 發現基因數據背後的「知識」,全世界第一張獼猴桃基因組圖已繪出
    基因研究,是前沿科學,代表著高新技術發展方向,吸引大批科研人員攻堅。鄭洪坤的團隊正在做的研究,就是發現基因數據背後的「知識」,繪出了全世界第一張獼猴桃的基因組圖,搭建中國第一個基因大數據云計算平臺,讓基因科技從偏重實驗研究逐步向產品化發展,使傳統行業能用上基因科技,讓老百姓享受基因科技應用成果。
  • Hi-C圖譜和ChIA-PET圖譜技術有助解析基因組三維結構
    此外,基因及其調控元件需要交流,染色質必須打開,允許轉錄和複製。因此,人們常常提出這樣的疑問:「基因的線性順序與空間排布如何關聯?」「基因如何被遙遠的元件所調控?」。闡明染色質複雜結構的技術有染色質構象捕獲(chromatin conformation capture,3C)及更高通量的衍生技術4C、5C,這些提供了長距離的染色質相互作用,但不能擴展到整個染色質相互反應組。
  • 科學家今天聯合公布「正式版」人類基因圖譜
    中新網北京2月12日消息:被譽為繼人類登陸月球之後最偉大的科學成就──「人類基因圖譜」終於繪製完成,科學家今天將正式在華盛頓、倫敦、巴黎、柏林及東京等地同時公布有關資料,並在網際網路免費供人查閱。  科學家去年六月已完成人類基因圖譜草圖,並知道了九成以上鹼基對的位置信息,精確度達百分之九十九點九。
  • 甘藍型油菜表觀基因組圖譜繪
    該研究構建了目前為止最大的甘藍型油菜表觀遺傳學相關數據集,繪製了其表觀遺傳參考基因組圖譜,解釋了甘藍型油菜亞基因組間不平衡的表觀遺傳學基礎,並鑑定出植物中一種新的二價染色質狀態(H3K4me1-H3K27me3),為甘藍型油菜和其他多倍體植物的表觀遺傳學相關研究提供了重要資源。
  • 甘藍型油菜表觀基因組圖譜繪就
    該研究構建了目前為止最大的甘藍型油菜表觀遺傳學相關數據集,繪製了其表觀遺傳參考基因組圖譜,解釋了甘藍型油菜亞基因組間不平衡的表觀遺傳學基礎,並鑑定出植物中一種新的二價染色質狀態(H3K4me1-H3K27me3),為甘藍型油菜和其他多倍體植物的表觀遺傳學相關研究提供了重要資源。
  • 圓明園文化基因圖譜
    該研究院成立之後立即啟動了六個項目,其中一個尤為引人注目,它的名字叫作「圓明園文化基因圖譜研究」。「基因圖譜」本是生命科學領域的專業術語,為何會與圓明園產生關聯?「這個名稱主要是基於項目的系統性,它既有別於『歷史文化研究』,也不能簡單歸之為『品牌視覺識別系統設計』。
  • 廣東科學家首繪精子基因圖譜,揭秘它的14種不同「變身」
    8月31日,國際知名期刊《細胞-幹細胞》在線發表了一項研究成果,首次揭示了人類精子從精原幹細胞到生成精子的具體全過程,繪製了完整精確的人類精子發生的基因圖譜,並首次建立了人類無精症的分子診斷平臺。這一研究由南方醫科大學基礎醫學院趙小陽教授課題組與北京大學湯富酬教授課題組、北京大學第三醫院喬傑課題組共同完成。
  • 科學家繪製出胎兒基因表達的人類細胞圖譜
    科學家繪製出胎兒基因表達的人類細胞圖譜 作者:小柯機器人 發布時間:2020/11/16 13:42:53 美國華盛頓大學Jay Shendure、Cole Trapnell等研究人員合作繪製出胎兒基因表達的人類細胞圖譜。
  • 新研究揭示轉移性結直腸癌的多組學圖譜
    新研究揭示轉移性結直腸癌的多組學圖譜 作者:小柯機器人 發布時間:2020/9/4 20:11:59 中國科學院分子細胞卓越創新中心曾嶸、吳家瑞以及上海長海醫院張衛研究組合作的最新研究揭示了轉移性結直腸癌(CRC)的多組學圖譜
  • 劍橋專家繪出基因圖譜:全球三大變種,武漢流行B類...
    劍橋大學4月9日發表的關於新冠病毒起源的最新研究報告,或許能給出一些解答。報告指出,新冠病毒分三個變種:A、B、C。A類病毒更多發現於美國和澳洲的受感染者。A類在武漢只有極少案例,且來源於在武漢生活過的美國人。A類和從蝙蝠、穿山甲身上提取的病毒最為相似。研究人員稱A類病毒為「爆發根源」( 「the root of the outbreak」 )。