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劉光慧等合作繪製人類幹細胞多譜系分化和重編程多維表觀遺傳圖譜
該研究系統繪製了人類胚胎幹細胞多譜系分化和細胞重編程過程的全基因組R-loop圖譜、轉錄圖譜及多維表觀遺傳修飾圖譜，首次揭示了R-loop在人類細胞命運決定過程中的作用，並提出R-loop可作為一種新型的表觀遺傳記憶發揮功能。
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【科技前沿】劉光慧/曲靜/孫前文/張維綺合作繪製人類幹細胞多譜系...
【科技前沿】劉光慧/曲靜/孫前文/張維綺合作繪製人類幹細胞多譜系分化和重編程的多維表觀遺傳圖譜 2020-07-08 17:00 來源：澎湃新聞·澎湃號·政務
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劉光慧/曲靜/孫前文/張維綺等繪製人類細胞分化和重編程過程R-loop等多維表觀圖譜
該研究通過體外誘導分化人類胚胎幹細胞， 系統繪製了人類胚胎幹細胞分化為多種細胞類型過程和細胞重編程過程的單鹼基精度的 R-loop 圖譜，並同時描繪了相應過程的轉錄組、組蛋白修飾組、染色質結構開放性和 DNA 甲基化修飾等多組學變化，並提出 R-loop 可作為一種關鍵的表觀遺傳修飾因子調控人類細胞命運決定。
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人類早期胚胎發育組蛋白修飾重編程規律
表觀遺傳學修飾參與基因表達調控並調控個體發育。在哺乳動物早期發育過程中，卵母細胞受精後形成具有全能性的受精卵，並經過細胞分裂與分化形成植入前囊胚，後者包含具有多能性的內細胞團（ICM）。伴隨著發育的進行，表觀遺傳學修飾經歷了劇烈的重編程。
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中國科學家發現人類早期胚胎發育組蛋白重編程規律
表觀遺傳學修飾參與基因表達調控並調控個體發育。在哺乳動物早期發育過程中，卵母細胞受精形成具有全能性的受精卵，並經過細胞分裂與分化形成植入前囊胚，後者包含具有多能性的內細胞團。伴隨著發育的進行，表觀遺傳學修飾經歷了劇烈的重編程。近年來，以小鼠等模式生物為研究模型，DNA甲基化、染色質開放性、染色質高級結構以及組蛋白修飾等表觀遺傳學特徵的動態變化過程和規律都逐漸被揭示。
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細胞編程與重編程的機制
細胞編程與重編程研究是對生命本質的探索，其對推動幹細胞研究走向應用和臨床都具有重要的作用，加強相關研究對未來人類健康的保障至關重要。 (3) 揭示了m6A甲基化對細胞重編程的調控作用 周琪研究組與中科院北京基因組研究所楊運桂課題組、中科院遺傳與發育生物學研究所王秀傑課題組合作，揭示了microRNA通過序列互補調控mRNA 甲基化修飾形成這一全新的作用機制，以及m6A修飾在促進體細胞重編程為多能性幹細胞中的重要作用，在解析m6A修飾形成的位點選擇機制、拓展microRNA的新功能和發現新的細胞重編程調控因素方面均取得了開創性的重要突破
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多篇文章聚焦細胞重編程研究領域新成果!
【4】Cell Stem Cell：將誘導多能幹細胞重編程為強大的自然殺傷細胞 增強抗腫瘤的潛力和活性doi：10.1016/j.stem.2020.05.008近日，一項刊登在國際雜誌Cell Stem Cell上的研究報告中，來自加利福尼亞大學等機構的科學家們通過研究利用誘導多能幹細胞（ipsCs）並剔除一個關鍵基因，開發出了能在體內和體外對特定白血病具有更強抵禦活性的自然殺傷細胞
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...和梁興群團隊等揭示Isl1在心肌細胞凋亡表觀遺傳控制中的關鍵作用
先鋒轉錄因子在編程表觀基因組中起關鍵作用，並在連續細胞譜系規範和分化步驟中促進其他調節因子的募集。2019年4月25號，同濟大學心律失常教育部重點實驗室孫雲甫和梁興群等團隊合作在Cell Research上在線發表了題為Pioneering function of Isl1 in the epigenetic control of cardiomyocyte cell fate的研究論文。
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某複合物在心肌細胞表觀遺傳控制中起關鍵作用
從單個全能受精卵產生廣泛不同和特化的細胞類型涉及大規模轉錄變化和染色質重組。先鋒轉錄因子在編程表觀基因組中起關鍵作用，並在連續細胞譜系規範和分化步驟中促進其他調節因子的募集。該研究揭示Isl1 / Brg1-Baf60c複合物在協調心臟發生和建立心肌細胞命運的表觀遺傳記憶中起著至關重要的作用。幹細胞/祖細胞分化為不同的譜系涉及到一系列大規模的轉錄變化和染色質重組。組織特異性轉錄因子與表觀遺傳修飾因子協同作用對表觀基因組進行編程，建立細胞同一性，這是由表觀遺傳調控機制進一步維持的。
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廣州生物院闡明lncRNA通過表觀遺傳抑制重編程的發生
米格爾實驗室人員通過分析多能性相關的、分化相關的及p53誘導產生的三種類型的lncRNAs分別在體細胞、未完全重編程的細胞、幹細胞這三種細胞中的表達譜，試圖研究lncRNA在這個過程中表達模式的改變，以此找出可能影響效率的候選者。
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DNA甲基化是體細胞重編程過程中重要的表觀遺傳屏障
點擊查看 DNA甲基化是體細胞重編程過程中重要的表觀遺傳屏障。然而，整個基因組的甲基化是如何被重新編程的，這在很大程度上仍是未知的。Sardina等人通過繪製正在重新編程的細胞的DNA甲基化圖來解決這個問題，並表明TET蛋白和轉錄因子協同配合去甲基化對重新編程至關重要。
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生殖細胞表觀遺傳研究獲新進展 對後代影響重大
日前，國際權威學術期刊《細胞》以封面文章的形式，發表了北京大學喬傑、湯富酬研究團隊的研究成果——人類原始生殖細胞的轉錄組和DNA甲基化組景觀圖。該項成果為探究人類生殖細胞表觀遺傳重編程、DNA甲基化隔代遺傳及幹細胞向精卵定向分化等問題提供了理論基礎，對開展輔助生殖技術安全性評估、疾病對後代影響評價等研究具有重要意義。
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Cell發表關於人類原始生殖細胞中基因表達網絡的表觀遺傳調控機制...
因此，對人類早期胚胎以及原始生殖細胞的發育過程進行深入的研究對於理解人類胚胎發育特徵以及對於反覆流產、胚胎停育、不孕不育等疾病發病機制的認識具有重要意義。基因組DNA甲基化作為一種重要的表觀遺傳修飾方式，是調控細胞分化發育過程中基因表達的主要機制之一，它並不改變基因序列，但是可以遺傳給後代，容易受外界環境的影響而發生改變，在胚胎發育、幹細胞分化、癌症發生等方面發揮著重要的作用。
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頡偉組發表綜述總結哺乳動物早期發育中的表觀遺傳重編程
在這個過程中，一個重要的生物學問題是表觀遺傳記憶是如何進行遺傳和重編程以完成親本到合子的發育轉變。近年來，微量細胞表觀遺傳和表觀基因組分析技術的快速發展使得在分子層面揭示這一過程的動態調控和功能成為可能。
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血細胞分化表觀的遺傳機制是什麼樣的
在骨髓中，血液幹細胞通過前體細胞產生具有各種功能的多種血細胞類型：白細胞負責免疫防禦;紅細胞負責氧氣的運輸;或血小板，對於血液凝結必不可少。細胞發展成哪種細胞取決於多種因素。在最新的研究中，Asifa Akhtar的實驗室表明，正確劑量的表觀遺傳調節劑MOF對細胞命運有重要影響。如果在適當的時間激活，該酶會觸發血液幹細胞和前體細胞的發育程序，並且這些細胞分化為紅細胞。
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河南幹細胞_幹細胞與再生醫學發展目標_鄭大中科博生
(1) 細胞重編程過程研究：比較SCNT、iPS等多種重編程過程，描繪出細胞重編程過程的精細圖譜;揭示參與重編程的各種信號統一協調的作用方式;建立精確的數學模型模擬分析細胞重編程的動態過程。通過細胞類型轉換獲取具有功能和能用於治療的細胞或組織;評估轉分化來源的組織和器官的安全性及有效性。(4) 利用重編程技術建立疾病的細胞模型:利用重編程技術建立患者體細胞來源的多能幹細胞，作為疾病的體外模型;結合基因修飾及重編程技術等多種方法建立大動物和非人靈長類疾病的細胞模型，用於重要疾病的幹細胞治療與藥物開發研究。
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Science|細胞分化過程中狀態圖譜與細胞命運圖譜
譜系追蹤（lineage tracing）是推斷祖細胞和子代之間關係的金標準，即通常使用遺傳手段對表達特定標記基因的祖細胞亞群進行標記，在後續時間點對其分化命運進行檢測【1】。研究人員同時檢測細胞轉錄狀態和細胞命運的策略是：利用遺傳手段對異質性祖細胞群進行DNA條形碼標記，部分細胞立即進行scSeq分析，部分細胞分裂分化後進行scSeq分析。
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Nat.Methods:幹細胞重編程新方法——「間接譜系轉換」
索爾克生物研究所（Salk Institute for Biological Studies）研究人員開發的一種新技術，可以獲得無限量的幹細胞及其衍生物，同時將生產的時間縮短一半還多，從近2個月減少至2周。研究結果已發表於本周的Nature Methods。
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揭示先鋒轉錄因子在細胞凋亡表觀遺傳中的關鍵作用 | Cell Research
fate 期刊：Cell Research 作者：Rui Gao, Xingqun Liang, Sirisha Cheedipudi, Julio Cordero, Xue Jiang, Qingquan Zhang, Luca Caputo, Stefan Günther, Carsten Kuenne, Yonggang
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歷程:從細胞分化到細胞重編程
很長一段時間裡，人們認為在個體發育的過程中，未成熟細胞發展成特定成熟細胞是單向性的，不可能再恢復到多能幹細胞的階段。在19世紀末期到20世紀初，細胞生物學家們普遍認為細胞在分化的過程中只保留了維持細胞特性和功能的基因，當它們分化後就無法逆轉回未分化狀態。