蛋白質組學和蛋白翻譯後修飾在精準醫學研究中的應用(Proteomics...

2020-12-04 吉林大學

報告題目：蛋白質組學和蛋白翻譯後修飾在精準醫學研究中的應用（Proteomics and Protein Post-translational Modification(PTM) in Precision medicine）

報 告 人：李琳涵 博士 杭州景傑生物科技有限公司

報告時間：2020年06月12日（周五）下午13:30

公司簡介：杭州景傑生物致力於蛋白質組學/蛋白質修飾組學基礎研究，基於高解析度質譜和全球獨有的抗體開發富集技術，創造了磷酸化，乙醯化，泛素化，甲基化領域內高通量記錄，同時實現了多種新型蛋白質修飾（琥珀醯化，巴豆醯化，2-羥基異丁醯化，丙二醯化，戊二醯化，苯甲醯化）高通量檢測，合作發表文章超過300篇，學術成果多次榮登Cell, Nature, Mol. Cell,PNAS等國際頂級期刊。

相關焦點

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  • Theranostics報導:基於血液蛋白質組學的中醫藥精準醫學研究
    研究基於血液蛋白質組的中醫藥精準醫學研究策略，對於疾病機理及中醫藥的臨床運用研究都有很好的參考意義。 為了找到可用於銀屑病診治的標誌物分子，該團隊在國際上率先提出基於血液蛋白質組的中醫藥精準醫學研究策略。通過系統分析銀屑靈優化方治療銀屑病前後血液蛋白質組的表達數據和臨床數據，不僅證實了以往研究中發現的中性粒細胞和性別對於銀屑病的影響，還發現了5個標誌物分子。
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    從中文方面理解的話就是源於蛋白質和基因組兩個詞的組合，意指一種基因組所表達的全套蛋白質，包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。蛋白質組學本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特徵，包括蛋白質的表達水平，翻譯後的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關於疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。
  • 蛋白質組學技術開發應用前景到底有多值錢 景傑生物完成5.3億元B輪...
    ，英文名為proteomics，其實如果只拿英文名的話就好理解了，這是以蛋白質組為研究對象，研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規律的科學。 從中文方面理解的話就是源於蛋白質和基因組兩個詞的組合，意指一種基因組所表達的全套蛋白質，包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。蛋白質組學本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特徵，包括蛋白質的表達水平，翻譯後的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關於疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。
  • 蛋白質組學技術在病毒研究中的應用
    蛋白質組概念的提出及常用技術蛋白質組（proteome）這一概念由Wilkins和Williams等在1994年首次提出，以它作為研究對象的蛋白質組學是後基因組時代產生和發展的一門新興學科，其從整體上分析組織，細胞內動態變化的蛋白質組成、表達水平與翻譯後修飾，探索蛋白質的功能及蛋白質之間相互作用與聯繫
  • 知名專家在線 蛋白質組學研究技術與方法進展網絡會議即將召開
    建立了一系列複雜背景幹擾下低豐度蛋白質和翻譯後修飾蛋白質的高靈敏鑑定和高準確定量新方法。近年來，主持包括國家重點研發計劃、國家自然基金重點項目和S973課題等在內的國家及省部級項目十餘項，發表SCI論文164篇，被引三千餘次，在質譜分析和蛋白質組學研究領域應邀撰寫多篇綜述。授權中國發明專利十餘項。
  • ABA等植物激素調控與蛋白翻譯後修飾研究
    應用基於質譜的蛋白質組學或蛋白質修飾組學分析特定狀態下植物不同細胞組織或器官中所表達的蛋白質組豐度、及翻譯後修飾的動態變化，能夠從分子水平了解特定蛋白質的生物學功能，揭示生物體的發育調控、發育異常等的機制等。今天我們以植物激素ABA為例，淺談植物激素調控如何結合蛋白質組學、蛋白翻譯後修飾等開展研究？
  • 賽默飛:蛋白質組學技術在病毒感染致病機制的亮點研究
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  • 質譜「跨界」醫學 妙用蛋白組學分析——訪威斯康星大學麥迪遜分校...
    當前蛋白質組學的質譜分析主要有bottom-up(自下而上)和top-down（自上而下）兩種方法，Bottom-up是傳統的手段，它將蛋白質的大片段混合物消化/酶解成小片段的肽後再進行分析，是在蛋白質組學的研究中廣泛使用的一種質譜技術，但該方式無法取得與PTMs之間相關聯繫的信息。
  • SWATH採集技術在蛋白質組學中的應用
    蛋白組學是SWATH應用最廣泛和深入的領域。因為SWATH在蛋白組學中的重大貢獻，兩位技術研究者StephenTate 和Ron Bonner在第16界人類蛋白質組世界大會上(HUPO2017)獲得了科學與技術獎。並且2018年SWATH被評為Nature最關注技術。
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    組蛋白修飾是表觀遺傳學研究的核心熱點，隨著蛋白質組學技術以及抗體技術不斷發展，越來越多的新型組蛋白修飾以及新穎的調控機制被揭示出來，並見諸高水平期刊。今天介紹的第一篇文章為19年3月發表在Nature雜誌的，首次報導了神經遞質5-羥色胺能夠進入細胞核使組蛋白發生化學修飾（serotonylation），進而調控基因表達。
  • 科學家發現蛋白翻譯後修飾新方式
    其主要方向是蛋白質組學、蛋白翻譯後修飾和生物質譜學。趙教授研究組是目前世界上發現蛋白質新修飾最多的實驗室，已首先報導了賴氨酸的丙醯化、丁醯化、琥珀醯化、巴豆醯化、丙二酸醯等新蛋白修飾。曾在Cell, Nature, Science, Nat Chem Biol, Mol Cell, PNAS等一流學術期刊上發表多項研究成果。
  • 蛋白質修飾研究的最新篇章
    通常，蛋白質在表達以後還需要經過不同程度的修飾才能發揮所需要的功能。這種翻譯後修飾過程受到一系列修飾酶和去修飾酶的嚴格調控，使得在某一瞬間細胞中蛋白質表現出某種穩定或動態的特定功能。蛋白質翻譯後修飾（PTM）通過共價添加官能團或蛋白質，調節亞基的蛋白水解切割或整個蛋白質的降解來增加蛋白質組的功能多樣性。
  • LabelFree定量蛋白質組學技術研究蛋白質互作——背景介紹(下)
    蛋白互作的研究背景內容比較豐富，我們分成兩期定量蛋白質組學非標記定LabelFree定量蛋白質組學技術研究蛋白互作的背景進行介紹。本期我們接著說蛋白-蛋白互作方法的研究背景。LC-MS/MS還促進了研究人員對蛋白質異構體和翻譯後修飾（PTMs）如何控制和調節多個細胞的了解。在蛋白質互作分析中，親和純化與多種定量質譜方法相結合非常常見。在本文中，我們將質譜採集策略分為「數據相關採集（DDA）」和「數據獨立採集（DIA）」。目前為止，DDA最常見的用途是通過「鳥槍」技術鑑定化合物。
  • 趙英明課題組揭示新型蛋白質翻譯後修飾並鑑定出63個組蛋白修飾位點
    隨著人們對蛋白質功能和生物學機制的研究的逐步深入，蛋白質翻譯後修飾的重要性與日俱增。比如磷酸化、乙醯化、甲基化、泛素化和糖基化等翻譯後修飾是真核細胞生物調節蛋白質發揮生物學功能的重要方式，對發育、代謝、疾病等眾多生理過程均起到關鍵的調控作用。過去十年來， 50%以上的重磅抗癌藥物(年銷售額超過10億美元)的作用靶點是磷酸化調節酶。
  • 驅動精準醫學的高嚴格性人類蛋白組藍圖發布
    該藍圖由HPP組裝了10年，覆蓋了90％以上的人類蛋白質組，這與人類基因組組織（HGP）取得的進展相當。該藍圖提供了基因組學本身無法提供的重要生化和細胞生物學信息，為我們對蛋白質組的動態性質、其修飾以及與人類生物學和疾病的關係的分子理解帶來更多的細緻信息。同時為診斷、預後、治療和精準醫學應用奠定了更好的基礎。
  • 蛋白質定量組學服務
    定量蛋白質組學不是僅僅提供在某個樣品中鑑定的蛋白質列表，而是產生關於兩個生物樣品之間的生理差異的信息。例如，該方法可用於比較來自健康和患病患者的樣品。定量蛋白質組學主要通過二維凝膠電泳進行（2-DE）或質譜（MS）。然而，最近開發的定量斑點印跡（QDB）分析方法能夠以高通量形式測量樣品中單個蛋白質的絕對量和相對量，從而為蛋白質組學研究開闢了新的方向。
  • 聚焦蛋白質組學技術開發及應用,「景傑生物」完成5.3億元B輪融資
    圖片來自企業官方 據官網資料，「景傑生物」目前已研究開發21種蛋白質翻譯後修飾類型，400餘種修飾類抗體，實現33000+修飾位點鑑定通量，是蛋白質修飾泛抗體開發領域的領跑企業 該公司官網目前在售的抗體產品涵蓋診斷原材料、腫瘤免疫學、表觀遺傳學、神經生物學等8個研究領域，共345種，按修飾類型可分為未修飾抗體、組蛋白修飾抗體和蛋白質修飾泛抗體三類。
  • 生物質譜技術在蛋白質組學中的應用
    功能基因組試圖通過大規模實驗方法來回答這些問題。但由於僅從DNA序列尚不能回答某基因的表達時間、表達量、蛋白質翻譯後加工和修飾的情況、以及它們的亞細胞分布等等，因此在整體水平上研究蛋白質表達及其功能變得日益顯得重要。這些在基因組中不能解決的問題可望在蛋白質組研究中找到答案。蛋白質組研究的數據與基因組數據的整合，將會在後基因組研究中發揮重要作用。