網易歌手發Nature,構建首個人類細胞圖譜基本框架

2020-12-08 騰訊網

2020年3月26日,Nature雜誌在線發表來自浙江大學醫學院幹細胞與再生醫學中心郭國驥團隊與浙江大學附屬醫院張丹團隊、王偉林團隊、陳江華團隊、梁廷波團隊和黃河團隊等題為「Construction of a Human Cell Landscape at Single-cell Level」的研究論文。

該研究通過單細胞測序技術構建首個人類細胞圖譜基本框架。

該研究對60種人體組織樣品和7種細胞培養樣品進行了Microwell-seq高通量單細胞測序分析,系統性地繪製了全球首個跨越胚胎和成年兩個時期、涵蓋人體八大系統的人類細胞圖譜。

據悉Microwell-seq高通量單細胞分析平臺是該團隊自主研發,具有成本低廉、雙細胞汙染率低和細胞普適性廣等優勢。同時,研究團隊開發了scHCL單細胞比對系統用於人體細胞類型的識別,並搭建了人類細胞藍圖網站。

通過這張圖譜,團隊發現,多種成人的上皮、內皮和基質細胞在組織中似乎扮演著免疫細胞的角色。比如趨化因子陽性上皮細胞、抗原呈遞陽性內皮細胞等非專職的免疫細胞廣泛地分布在成體的各種組織器官之中,並在分類上獨立於傳統的上皮、內皮、基質和免疫細胞。研究團隊認為,成年人非免疫細胞的廣泛免疫激活是人體區域免疫的一種重要調節機制。

總之,該工作是人類細胞圖譜計劃裡非常重要的階段性成果,構建了人類細胞圖譜的基本框架,對未來圖譜的進一步完善具有指導性意義。

郭國驥

現為浙江大學醫學院幹細胞與再生醫學中心教授、博士生導師,浙江大學附屬第一醫院雙聘教授,浙江大學醫學院幹細胞與再生醫學中心副主任,浙江大學血液學研究所副所長。

他於2005年本科畢業於武漢大學,2010年畢業於新加坡國立大學獲得理學博士學位。之後赴美國哈佛大學醫學院從事博士後研究工作,2014年入職浙江大學醫學院。2017年獲「國家優秀青年基金」,2019年入選「萬人計劃」科技創新領軍人才,曾獲「樹蘭醫學青年獎」,「霍英東青年教師獎」,「細胞生物學會青年科學家獎」等榮譽。

值得注意的是,郭國驥還是一位歌手。本文來源iPlants。

論文連結:

相關焦點

  • 中國構建首個人類細胞圖譜基本框架,「80後」浙大學者領銜
    細胞是生命的基本單位。由六國科學家參與的人類基因組計劃(HGP)完成之後,我們初步掌握了遺傳「密碼本」,但時至今日,人類尚未能一窺自己的細胞圖譜。近年來,單細胞測序等新技術的湧現,讓科學家對細胞的觀測進入前所未有的精度。
  • 全球首張人類細胞圖譜將給我們帶來什麼驚喜?
    該項目利用自主研發的單細胞分析平臺,通過高通量測序技術,系統性地繪製了跨越胚胎和成年兩個時期,涵蓋八大系統的人類細胞圖譜,建立了70多萬個單細胞的資料庫、鑑定了100餘種人體細胞大類和800餘種細胞亞類。研究團隊還搭建了人類細胞藍圖網站。細胞是生命的基本單位,人體中約有37萬億個細胞。
  • 科學家繪製出全球首張人類細胞圖譜
    一張單細胞水平的人類細胞圖譜浙江大學供圖來源:中國科學報作者 |崔雪芹近日,全球首張人類細胞圖譜在浙江大學繪製成功。3月26日,該校醫學院教授郭國驥團隊的這項研究成果在線發表於《自然》。「這項工作概括來說就是人體細胞數位化。」
  • 世界首個哺乳動物細胞圖譜在浙大誕生
    2018-02-23 16:05 | 浙江新聞客戶端 | 通訊員 周煒 記者 曾福泉浙大學者利用Microwell-seq平臺構建小鼠細胞圖譜簡圖世界上沒有兩片相同的樹葉,也沒有兩個相同的細胞。科學的進步讓我們「讀懂」生命體的每一個細胞成為了可能。
  • 中國科學家繪製出全球首個哺乳動物細胞圖譜
    我國科學家繪製出全球首個哺乳動物細胞圖譜(創新前沿)  本報杭州2月23日電(記者江南)浙江大學醫學院幹細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊研發出低成本、高效率、完全國產化的高通量單細胞測序平臺「Microwell—seq」,對來自小白鼠近50種器官組織的40餘萬個細胞進行了系統性的單細胞轉錄組分析
  • 首個人類細胞圖譜在浙大誕生!又一篇《自然》
    跨越胚胎和成年兩個時期、涵蓋八大系統、建立70多萬個單細胞的轉錄組資料庫、鑑定人體100餘種細胞大類和800餘種細胞亞類……近日,世界首個人類細胞圖譜在浙大繪製成功了。北京時間3月26日,國際頂級期刊《自然》在線刊登了浙江大學醫學院郭國驥教授團隊的這項最新研究成果。
  • 世界首個人類細胞圖譜在浙大誕生
    跨越胚胎和成年兩個時期、涵蓋八大系統、建立70多萬個單細胞的轉錄組資料庫、鑑定人體100餘種細胞大類和800餘種細胞亞類……近日,世界首個人類細胞圖譜在浙大繪製成功了。北京時間3月26日,國際頂級期刊《自然》在線刊登了浙江大學醫學院郭國驥教授團隊的這項最新研究成果。細胞是生命的基本單位。
  • Nature:構建出人類肺部細胞圖譜,為治癒肺部疾病奠定基礎
    在一項新的研究中,來自美國史丹福大學的研究人員構建出人類肺部的細胞圖譜,該細胞圖譜突出了構成肺部不同部分的幾十種細胞類型。相關研究結果於2020年11月18日在線發表在Nature期刊上,論文標題為「A molecular cell atlas of the human lung from single-cell RNA sequencing」。
  • 我國科學家繪製出首個哺乳動物細胞圖譜
    新華社杭州2月23日電(記者朱涵)浙江大學醫學院幹細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊研發出低成本、高效率、完全國產化的高通量單細胞測序平臺「Microwell-seq」,並在短時間內利用這一平臺構建全球首個哺乳動物的細胞圖譜。該成果於23日刊登在國際學術期刊《細胞》雜誌上。
  • 世界首個哺乳動物細胞圖譜在浙大誕生
    人類邁出了新的一大步——昨天上線的著名學術期刊《CELL》(《細胞》)上,刊登了浙江大學醫學院幹細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊的研究成果,團隊自主研發了低成本、高效率、完全國產化的高通量單細胞測序平臺Microwell-seq,並在短時間內利用這一平臺構建了全球首個哺乳動物細胞圖譜。
  • Nature: 繪製出單個人類細胞類型中08個染色質相關蛋白的佔據圖譜
    (來源nature)之前幾個階段的大部分研究使用的都是模型細胞系,而第三階段包含了超過1369個生物樣本來源的503種細胞或組織類型。根據ENCODE已經繪製出的數百萬個元件,研究人員還建立了一個在線註冊庫,裡面包含了926535個人類的和339815個小鼠的候選順式調節元件(調節基因轉錄的非編碼DNA區域),覆蓋到各自基因組的7.9%和3.4%。在ENCODE的第四階段,大量工作將用來拓展所分析的細胞類型和組織。
  • Nature:重大進展!構建出人類肝臟的完整細胞圖譜,鑑定出新的肝細胞...
    如今,在一項新的研究中,來自德國弗賴堡大學、馬克斯普朗克免疫生物學與表觀遺傳學研究所和法國斯特拉斯堡大學的研究人員提供了人類肝臟組織的完整細胞圖譜。通過使用所謂的單細胞RNA測序技術,馬克斯普朗克免疫生物學與表觀遺傳學研究所的Dominic Grün團隊與斯特拉斯堡大學的Thomas F. Baumert團隊成功地構建出健康人肝臟中細胞群體的詳細圖譜。
  • Nature:構建出人類肺部的細胞圖譜,為理解和治癒肺部疾病奠定基礎
    2020年11月23日訊/生物谷BIOON/---在一項新的研究中,來自美國史丹福大學的研究人員構建出人類肺部的細胞圖譜,該細胞圖譜突出了構成肺部不同部分的幾十種細胞類型。為了構建肺部細胞圖譜,這些研究人員從肺部的細支氣管、支氣管和肺泡區域收集了組織樣本,以及相關的血液樣本。每一個樣本都被分解成其細胞成分,然後按類型進行分類:免疫細胞、上皮細胞、內皮細胞或基質細胞。這些研究人員為大約75000個細胞生成了轉錄組。通過使用標誌物,他們隨後對這些細胞進行了聚類分析,揭示了58個不同的細胞群體。
  • 我科研團隊成功繪製首個人類細胞圖譜
    ◎ 洪恆飛 吳雅蘭 科技日報記者 江耘26日,記者從浙江大學獲悉,該校醫學院郭國驥教授團隊通過對60種人體組織樣品和7種細胞培養樣品進行Microwell-seq高通量單細胞測序分析,系統性地繪製了全球首個跨越胚胎和成年兩個時期、涵蓋人體八大系統的人類細胞圖譜。
  • 她創建人類細胞圖譜,繪製人體超37萬億細胞的3D圖
    泰克曼是人類細胞圖譜(Human Cell Atlas)項目的先驅者,這個項目旨在繪製出人體內所有細胞的3D圖。作為英國劍橋桑格研究所(Sanger Institute)細胞遺傳學負責人,泰克曼表示,整理這些生命基本單位的目錄將為研究人員提供前所未有的能力,幫助我們了解和治療人類疾病,並「為新時代的精準醫學奠定基礎」。
  • 學術頭條:國家科技獎提名公布,首個人類細胞圖譜,銀河系邊界找到
    浙大郭國驥團隊繪製世界首個人類細胞圖譜近日,世界首個人類細胞圖譜在浙大繪製成功。北京時間2020年3月26日,浙江大學醫學院郭國驥教授團隊的這項研究成果在線發表於《自然》。該論文建立了人類細胞圖譜的基本框架;發現成人非免疫細胞的廣泛免疫激活;提出體內幹細胞和祖細胞的分化過程是一個細胞基因表達從混亂到有序的過程;並認為基因組中的調節子預先決定了分化終端的穩定狀態。
  • Nature:首張人類表觀基因組圖譜繪製成功
    美國科學家14日公布首張人類表觀基因組圖譜。這一成果將對人類表觀遺傳學研究作出貢獻。表觀遺傳學被稱為基因、疾病和環境之間「迷失的橋梁」。美國薩克研究所(Salk)的研究人員利用功能強大的計算機和新技術繪製了兩種人類細胞的表觀基因組圖譜,它們分別為胚胎幹細胞和肺部纖維原細胞。
  • Circulation:構建出人類心臟細胞圖譜
    2020年9月30日訊/生物谷BIOON/---雖然對許多科學家而言,了解人類心臟疾病的致病機制是一個活躍的研究領域,但關於它的組成和功能的重要知識仍然未知。在一項新的研究中,來自美國布羅德研究所精準心臟病學實驗室、拜耳公司、麻薩諸塞州總醫院和賓夕法尼亞大學的研究人員合作,揭示了一些有關心臟生物學的緊迫問題。
  • Science重磅發布:人類大腦細胞結構的三維概率圖譜
    細胞結構是腦微結構劃分的基本參照。在這裡我們介紹Julich-Brain,一個包含皮層區域和皮層下核團的細胞結構3D圖譜。該圖譜以概率的方式研究了個體大腦之間的差異。
  • Science重磅發布:人類大腦細胞結構的三維概率圖譜
    細胞結構是腦微結構劃分的基本參照。在這裡我們介紹Julich-Brain,一個包含皮層區域和皮層下核團的細胞結構3D圖譜。該圖譜以概率的方式研究了個體大腦之間的差異。構建這樣一個腦圖譜是需要開發嵌套的、相互依賴的工作流程,用於檢測大腦區域之間的邊界、數據處理、起源追蹤,以及靈活地執行處理鏈,以處理不同空間尺度上的大量數據。