稀有瀕危植物的產生，有自身的原因，也有外界的因素，自身的原因是受植物的個體發育和系統發育特徵所制約，而外因除地質變動等不可抗拒原因外，主要是人類活動所造成的，而這種作用遠遠超過了生物自身的原因。
崑嵛山「瀕危野生動植物種國際貿易公約」的蘭科植物10種，主要有天麻、二葉舌唇蘭、朱蘭、綬草等；「山東稀有瀕危保護植物」46種，主要有白鮮、紫草、玉竹、山東銀蓮花、宜昌莢蒾、鹿蹄草、玉玲花等。
天麻：蘭科天麻屬多年生草本植物，是一味常用較珍貴的中藥。天麻有鎮靜、鎮痛、抗驚厥作用；能增加腦血流量，降低腦血管阻力，輕度收縮腦血管，增加冠狀血管流量；能降低血壓，減慢心率，對心肌缺血有保護作用。在崑嵛山有分布，但近年來分布逐漸減少。
紫草：紫草科紫草屬多年生草本植物，多生長於山坡草地，有涼血活血、清熱解毒、滑腸通便的作用。在崑嵛山有零星分布。
綬草：蘭科綬草屬草本植物，綬草是一種生態指示性植物，它的生長、繁殖都需要真菌、動物的幫忙，形成一個小生物鏈，所以綬草能夠對環境變化做出敏感反應，在植物研究上很有價值。在崑嵛山呈零星分布。
小斑葉蘭：蘭科斑葉蘭屬多年生草本植物，根莖入藥，有清熱解毒，活血止痛，軟堅散結，補腎的作用。
山茴香：傘形科山茴香屬多年生草本，生於山頂巖石縫中。茴香油可作驅風劑，在腹氣脹時排除氣體，減輕疼痛。崑嵛山泰礡頂附近巖石縫中有分布。