化學學院何川/賈桂芳課題組在Angew. Chem. Int. Ed.發文報導RNA...

2021-01-07 北京大學新聞網

2018年10月，北京大學化學與分子工程學院何川/賈桂芳副研究員課題組在Angew. Chem. Int. Ed.（《德國應用化學》）雜誌在線發表題為「An Elongation and Ligation-Based qPCR Amplification Method for the Radiolabeling-Free Detection of Locus-Specific N6-methyladenosine Modifications」的研究論文(DOI:10.1002/anie.201807942)，報導了一種快捷檢測RNA中N6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine，m6A）的新方法。

表觀轉錄組學（epitranscriptomics，又稱「RNA表觀遺傳學」）是近年來興起的前沿科研領域。RNA化學修飾m6A作為表觀轉錄組學中的明星修飾，是真核mRNA和非編碼RNA中的主要化學修飾。m6A可以被修飾酶和去修飾酶進行動態可逆調節，並被結合蛋白識別調控RNA加工代謝，參與許多重要生物學調節，如周期節律、幹細胞分化、癌症發生發展及RNA病毒等。m6A檢測對於其分子生物學功能和相關疾病研究非常重要。目前報導的檢測方法中只有SCARLET能夠實現單mRNA和lncRNA中m6A單鹼基解析度的檢測，但該方法操作複雜耗時，需要較大劑量的放射性同位素標記，難以廣泛應用。

何川/賈桂芳課題組開發了SELECT方法（其原理如下圖所示），該方法簡單快捷，只需三小時就能夠實現低豐度轉錄本中m6A單鹼基解析度的檢測。該方法基於m6A修飾的兩點特性：（i）能夠阻礙DNA聚合酶在反轉錄過程的單鹼基延伸；（ii）能夠降低缺口連接酶的連接效率。SELECT方法採用螢光定量PCR的方法進行定量，結合方法優化，其又發展了三個應用實例：（i）在生物學樣本總RNA或總mRNA中檢測mRNA或lncRNA上單位點是否含有m6A修飾；（ii）檢測生物學樣本中特定m6A位點的修飾比例；（iii）鑑定m6A甲基轉移酶或去甲基酶的生理作用靶點。SELECT方法不僅簡化了生物學樣品中m6A修飾的檢測過程，實現低豐度RNA中m6A單鹼基解析度的檢測，還能夠應用於其它RNA化學修飾的檢測中，例如N1-甲基腺嘌呤（N1-methyladenosine，m1A）和2』-O-甲基化修飾（2』-O-methylation，Nm)等。

SELECT方法原理示意圖

北京大學化學與分子工程學院2014級博士研究生肖雨為第一作者，賈桂芳為通訊作者，相關工作得到國家科技部和國家自然科學基金委等經費資助。

編輯：麥洛

責編：凌薇


相關焦點

  • ...Chem. Int. Ed.發文報導RNA修飾m6A單基因單鹼基...
    2018年10月，北京大學化學與分子工程學院何川/賈桂芳副研究員課題組在Angew. Chem. Int. Ed..201807942)，報導了一種快捷檢測RNA中N6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenosine，m6A）的新方法。
  • 趙俊偉教授課題組在化學期刊Angew. Chem. Int. Ed上發表論文
    近日，化學化工學院、河南省多酸化學重點實驗室趙俊偉教授課題組，在高核稀土嵌入鎢氧納米簇的組裝及功能化的方面取得重大研究進展，相關成果「Aggregation of Giant Cerium-Bismuth Tungstate Clusters into a 3D Porous Framework with High Proton Conductivity
  • 趙勇教授課題組在Angew. Chem. Int. Ed.報導鋰金屬電池新進展
    近期，我校特種功能材料教育部重點實驗室、材料學院趙勇教授課題組，在鋰金屬電池領域取得新進展，相關成果以「A Liquid/Liquid Electrolyte Interface that Inhibits Corrosion and Dendrite Growth of Lithium in Lithium-Metal Batteries」為題，以全文形式在國際化學頂級期刊
  • 雲南大學邵志會課題組在Angew. Chem. Int. Ed.發表論文
    日前，雲南大學化學科學與工程學院/自然資源藥物化學教育部重點實驗室邵志會教授課題組在手性催化與手性天然產物/手性藥物合成研究領域取得新進展。2月11日，研究成果在線發表於化學領域國際頂級期刊(Angew. Chem. Int. Ed.
  • 何川課題組JACS：如何流水線般的構建矽中心手性？
    何川課題組JACS：如何流水線般的構建矽中心手性？Soc., 2020, DOI: 10.1021/jacs.0c04863南方科技大學何川課題組簡介課題組PI介紹：何川博士，副教授，課題組長。2008年本科畢業於武漢大學化學與分子科學學院。隨後繼續在武漢大學化學學院攻讀有機化學博士，導師雷愛文教授。2013年博士畢業後，加入英國劍橋大學化學系Matthew Gaunt教授課題組從事博士後研究，並在2015年獲得瑪麗居裡獎學金。
  • 化學學院劉忠範、彭海琳課題組在Chem. Rev.和Adv. Mater.發文介紹...
    「製備決定未來」，石墨烯的化學氣相沉積（Chemical Vapor Deposition，CVD）製備方法自2009年被發明以來，已經取得了長足進展，是目前低成本製備大面積高品質石墨烯薄膜的最有效方法，具有良好的可控性和可放大性。然而，CVD石墨烯薄膜在製備的過程中會產生缺陷、晶界和褶皺，製備和轉移的過程也會造成表面汙染與破損，因此限制了其進一步應用。
  • 清華生命學院梁鑫課題組發文報導果蠅機械力信號轉導新機制
    清華生命學院梁鑫課題組發文報導果蠅機械力信號轉導新機制清華新聞網3月29日電 3月28日，清華大學生命學院梁鑫課題組在《美國科學院院刊》（PNAS）發表了題為「果蠅機械力感受器中NompC的超微結構」（Ultrastructural Organization of NompC in the Mechanoreceptive Organelle
  • 生命學院葛亮課題組發文報導蛋白非經典分泌過程關鍵步驟
    生命學院葛亮課題組發文報導蛋白非經典分泌過程關鍵步驟清華新聞網4月9日電 4月8日，清華大學生命學院葛亮課題組在《細胞》（Cell）期刊上在線發表題為「蛋白跨膜轉運調節非經典蛋白分泌」（A translocation pathway for vesicle-mediated unconventional protein secretion）
  • 清華生命學院黃善金課題組發文報導花粉管頂端微絲聚合控制機制
    清華生命學院黃善金課題組發文報導花粉管頂端微絲聚合控制機制清華新聞網5月28日電 5月23日，清華大學生命學院黃善金課題組在《美國科學院院刊》（PNAS）發表了題為「腺苷酸環化酶相關蛋白1介導的花粉管頂端微絲聚合機制」（Mechanism of CAP1-mediated Apical Actin Polymerization
  • 清華生命學院頡偉課題組發文報導哺乳動物早期胚胎譜系特異表觀...
    清華生命學院頡偉課題組發文報導哺乳動物早期胚胎譜系特異表觀基因組的建立過程及動態調控清華新聞網12月8日電 12月5日，清華大學生命科學學院頡偉研究組在《自然-遺傳》期刊（Nature Genetics）以長文形式發表了題為《小鼠早期胚胎發育譜系分化過程中表觀基因組動態調控》（Dynamic epigenomic
  • 生命學院何塞課題組發文報導異位的微管會引起多倍體細胞的試圖分裂
    生命學院何塞課題組發文報導異位的微管會引起多倍體細胞的試圖分裂清華新聞網4月24日電 4月18日，清華大學生命學院何塞（José Carlos Pastor-Pareja）課題組在《發育細胞》（Developmental Cell）期刊上發表了題為「血影斑蛋白Shot在果蠅多倍體細胞中維持核周微管網絡」 （Spectraplakin Shot
  • Angew. Chem. Int. Ed.∣新型細菌四氫異喹啉生物鹼
    在天然產物中，植物來源的苄基異喹啉族生物鹼約有800種獨特的化學結構，其中morphine、papaverine和noscapine等具有較高的藥用價值。細菌來源的四氫異喹啉天然產物雖不常見，但仍具有重要的抗癌作用。例如saframycins A和Mx、quinocarcin、dnacins和ecteinascidins強有力的抗癌活性和遷移抑制活性。
  • 生命學院王宏偉課題組發文報導目前利用冷凍電鏡方法解析的最小...
    生命學院王宏偉課題組發文報導目前利用冷凍電鏡方法解析的最小分子量蛋白清華新聞網6月4日電  6月3日，生命學院教授王宏偉課題組及合作者在《自然·通訊》在線發表題為《分子量52千道爾頓的鏈黴親和素蛋白的3.2埃解析度冷凍電鏡單顆粒三維重構》（Single particle cryo-EM reconstruction
  • RNA表觀遺傳學開創者何川:總想著賺錢太急功近利
    【編者按】網易科技今年推出大型系列報導《科學家說》，專訪全球頂尖科學家，洞見趨勢，分享智慧。今天推出《科學家說》第19期，專訪芝加哥大學生物物理動態研究所主任, 北京大學合成與功能生物分子中心主任何川。
  • 全世界搞化學的超級大牛 學化學的不能錯過
    今天給大家搜集了部分化學界的超級大牛，並給出了課題組網址，搞化學的不能封閉，有空去牛人那兒看看吧......　　有機合成方法學(含Organometallics)：　　1. B.M.LarMa (University of California, Davis)　　課題組網址：http://chemgroups.ucdavis.edu/~lamar/ 　　2.
  • 【Angew. Chem. Int. Ed.】二碘(III)的滷鍵給體有機催化劑
    滷鍵（XB）是指親電的滷素取代基和路易斯鹼之間的非共價相互作用，這種作用力現今已在晶體工程、分子和陰離子的識別、以及肽化學等許多領域得到了廣泛的應用
  • 齊魯工業大學陳建賓團隊在Angew. Chem. Int. Ed.發表科研論文
    近日，齊魯工業大學化學與製藥工程學院陳建賓教授團隊在國際頂級化學期刊《Angew. Chem. Int. Ed.》作者利用「推拉效應」和「離域作用」，實現了環境友好條件下電化學產生氮中心自由基（NCR）。通過改變電極材料進而控制電流密度，高選擇性的實現脫氫C-N鍵與N-N鍵的偶聯反應。基於此，高效合成了一系列吡啶[1,2-a]苯並咪唑和四芳基肼骨架衍生物，具有廣泛的通用性。初步的機理研究和密度泛函理論（DFT）計算揭示了可能的反應途徑。
  • 生命科學學院伊成器課題組報導新型RNA甲基化修飾的高清圖譜
    2017年10月26日，北京大學生命科學學院伊成器課題組在Molecular Cell雜誌在線發表題為「Base-Resolution Mapping Reveals Distinct m1A Methylome in Nuclear- and Mitochondrial-Encoded Transcripts」的研究論文。
  • 清華大學張強Angew. Chem. Int. Ed.:調控鋰離子溶劑化層,增強鋰...
    然而，鋰化學性質活潑，易於電解液反應在鋰負極表面生成固態電解質界面膜（SEI）。由於SEI的組成和結構上的不均勻性，鋰在沉積過程中容易生成枝晶，從而造成電解液損耗、電極粉化以及體積膨脹等問題，導致其不能應用於商業化電池。因此，調控SEI均勻性，抑制鋰枝晶生成，增強鋰金屬電池循環穩定性成為當下的主要挑戰。
  • ...學院伊成器研究組在《自然·化學生物學》報導新型甲基化腺嘌呤...
    2016年2月10日，北京大學生命科學學院伊成器研究組在《自然·化學生物學》（Nature Chemical Biology）雜誌在線發表題為「Transcriptome-wide mapping reveals reversible and dynamic N1-methyladenosine methylome」的研究論文（DOI: 10.1038/NCHEMBIO.2040）