產生了大量的微生物組學數據,想進行數據分析不知道使用什麼工具?不會使用Linux系統?不會寫代碼?沒有合適的參考資料庫?計算資源不足?現在這些問題都可以通過國家微生物數據中心推出的一站式生物信息分析雲平臺解決。
國家微生物科學數據中心面向微生物領域的科學家,提供免費的一站式生物信息分析雲平臺。該平臺可提供包括生物信息在線分析工具、計算資源、公共參考數據的整合在線服務。圖形化操作界面,用戶無需任何編程基礎,無需配置Linux作業系統,無需安裝複雜的生物信息分析軟體,無需下載龐大的生物資料庫,一鍵就能搞定生物數據分析,並且每項分析都可以自定義分析參數,實現在滑鼠點擊之間即可在國家微生物科學數據中心在線進行生物信息數據分析,挖掘出準確、詳細、專業的分析結果。
目前國家微生物科學數據中心已經上線了84個分析工具和自定義的數據分析工作流,涵蓋了宏基因組分析流程、基因組拼接、基因組結構分析、基因組注釋分析、元基因組分析、比較基因組分析、便攜分析等7大功能,分析類型多樣、涵蓋面廣,符合廣大科研人員分析需求,旨在讓更多領域內科研人員能更快、更高效、更自主的完成交互分析。
那麼究竟如何快速使用這些分析工具進行線上數據分析呢,小編手把手教您具體操作步驟:
1) 首先進入國家微生物科學數據中心首頁http://nmdc.cn/,選擇分析工具的入口按鈕,進入分析工具界面。
2)在分析工具主界面,選擇工具進行使用,這裡以SOAPdenovo2為例
3)點擊需求工具的開始按鈕進行使用。
4)首次使用需要先登錄帳號才能使用,如果沒有帳號需要先進行註冊。
5)登錄之後會再次返回工具主界面,選擇需要的工具進行使用。
6)進入工具分析頁面,選擇不同參數構建分析項目,確認無誤後即可開始分析。
7).項目運行後跳轉到任務運行的詳細界面
1 項目匯總信息
2 作業任務運行的詳細狀態
3 輸入參數對應的json文件
8).任務完成之後點擊下載按鈕,下載需要的結果文件
以上是國家微生物科學數據中心單個分析工具示例使用的完整範例,用戶可以圖形化操作界面完成複雜的生物數據分析,得到自己所需的科研結果,具體不同功能的分析工具用戶可以根據自己的分析需求來去選擇。
用戶如果想自己創建一個項目進行相關數據分析,也可以進入http://biocloud.nmdc.cn/網址創建個人分析項目和具體的分析任務,以下是系統操作的詳細步驟:
NO.1 建立個人項目,用於區分不同類型的任務
NO.2 創建項目之後,找到具體的分析工具創建項目
NO.3 找到具體的分析工具之後創建分析項目
NO.4 提交任務
NO.5 提交之後,查看項目的作業
NO.6 查看項目的作業信息
如在使用分析工具的過程中有任何相關的問題請聯繫網站下方服務郵箱或電話諮詢。服務郵箱:nmdc@im.ac.cn;聯繫電話:010-64807385。
後續我們將持續推送手把手教程系列的宏基因組數據提交步驟,敬請關注。
來國家微生物科學數據中心http://nmdc.cn/,獲取更多精彩內容。