中國農科院油料所破譯油菜基因組密碼 構建油菜基因轉錄資料庫

2020-08-30 武漢微新聞

湖北日報訊(記者孟靜、通訊員童超波、劉勝毅)8月28日,記者從中國農業科學院油料作物研究所獲悉,近日油料所油料作物基因組學與抗病性改良創新團隊成功破譯了油菜基因組的全轉錄信息密碼,構建了油菜10萬餘個基因的轉錄全景圖,使得油菜基因功能研究第一次有了相對標準的可參考的基因轉錄資料庫,有力支撐油菜功能基因的相關研究。該項研究成果發表在國際知名期刊《The Plant Journal》上。

團隊主要負責人介紹,油菜基因組包含約12億個鹼基和十餘萬個基因,如何解讀這些海量的基因組信息成為功能基因研究的重要任務。根據中心法則,基因通過轉錄形成mRNA再翻譯成蛋白質。由於基因的轉錄通常存在多種可變的剪切方式,一個基因可以形成許多種不同的mRNA。此前,由於技術和資源的限制,油菜一直缺乏全基因組水平所有基因的轉錄mRNA資料庫,導致油菜基因功能研究缺乏可查詢和可參考的基因注釋信息。

為了突破這一瓶頸,基因組學與抗病性改良創新團隊採用最新的三代測序技術準確測定了油菜全長轉錄組,並自主開發了一套用於多倍體油菜複雜基因組的分型方法,成功繪製了油菜基因組的轉錄全景圖,構建了油菜「標準」的參考轉錄本資料庫。該研究成果更新了人們對油菜基因和基因組的認識和理解,將為甘藍型油菜功能基因和遺傳改良研究及基因組設計育種提供數據基礎和理論指導。

該研究得到了國家重點研發計劃項目、國家自然科學基金項目和中國農業科學院創新工程等項目資助。

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【來源:湖北日報】

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