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中國農科院繪製油菜基因組轉錄全景圖,構建功能基因資料庫
中國農科院繪製油菜基因組轉錄全景圖,構建功能基因資料庫 劉志偉 童超波 劉勝毅/科技日報 2020-07-31 07:45
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首個油菜基因轉錄資料庫構建成功
中國農科院油料所,油料作物基因組學與抗病性改良創新團隊成功破譯了油菜基因組的全轉錄信息密碼,構建了油菜10萬餘個基因的轉錄全景圖,使得油菜基因功能研究第一次有了標準的可參考的基因轉錄資料庫,將有力支撐油菜功能基因的相關研究。該成果在線發表於國際知名期刊《植物學報》(The Plant Journal)。
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中國科研人員構建油菜基因轉錄資料庫
新華社武漢8月2日電(記者侯文坤)記者日前從中國農業科學院油料作物研究所獲悉,該所油料作物基因組學與抗病性改良創新團隊成功破譯了油菜基因組的全轉錄信息密碼,構建了油菜10萬餘個基因的轉錄全景圖,使得油菜功能基因研究第一次有了相對標準的可參考的基因轉錄資料庫,為相關研究提供了有力支撐。該項研究成果日前在線發表在國際知名期刊《The Plant Journal》上。
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中國科研人員構建油菜基因轉錄資料庫
記者日前從中國農業科學院油料作物研究所獲悉,該所油料作物基因組學與抗病性改良創新團隊成功破譯了油菜基因組的全轉錄信息密碼,構建了油菜10萬餘個基因的轉錄全景圖,使得油菜功能基因研究第一次有了相對標準的可參考的基因轉錄資料庫,為相關研究提供了有力支撐。
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我國科學家構建油菜功能基因資料庫
記者從中國農科院油料所獲悉,該所油料作物基因組學與抗病性改良創新團隊成功破譯了油菜基因組的全轉錄信息密碼,構建了油菜10萬餘個基因的轉錄全景圖,使得油菜基因功能研究第一次有了標準的可參考的基因轉錄資料庫,將有力支撐油菜功能基因的相關研究。該成果最近發表在國際知名期刊《植物》上。
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我科學家構建油菜功能基因資料庫
記者30日從中國農科院油料所獲悉,該所油料作物基因組學與抗病性改良創新團隊成功破譯了油菜基因組的全轉錄信息密碼,構建了油菜10萬餘個基因的轉錄全景圖,使得油菜基因功能研究第一次有了標準的可參考的基因轉錄資料庫,將有力支撐油菜功能基因的相關研究。該成果最近發表在國際知名期刊《植物》上。
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泛基因組資料庫:找到油菜的「好基因」
為何建設油菜泛基因組平臺?這是一個什麼樣的資料庫?油菜相關的多組學數據研究進展情況如何?《中國科學報》對此進行了採訪。「標準地圖」有盲區甘藍型油菜大約在7500年前由白菜和甘藍自然雜交形成,是非常「年輕」的多倍體植物。
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泛基因組資料庫:找到油菜的「好基因」—新聞—科學網
而在過去的幾十年裡,為了提高油菜的產量、品質及適應性等目標性狀,國內外油菜遺傳育種科學家持續地將白菜、芥菜等種質資源中控制重要性狀(如抗性等)的遺傳位點,通過雜交或者遠緣雜交等手段導入到甘藍型油菜中,進一步豐富了其物種的遺傳多樣性。 「現有的研究數據表明,甘藍型油菜基因組中7成以上基因都存在大的遺傳變異,也就是通常所說的結構變異。
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華中農業大學構建油菜泛基因組資料庫助力油菜遺傳育種研究進入泛...
近日,華中農業大學生物信息團隊陳玲玲和楊慶勇課題組與廣西大學合作在植物學期刊Plant Biotechnology Journal在線發表了題為「BnPIR: Brassica napus Pan-genome Information Resource for 1,689 accessions」的論文,構建了首個油菜泛基因組和比較基因組生物信息平臺
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...白菜 全基因組測序 基因組圖譜 科學家 油菜品種 異源四倍體...
東方網10月14日消息:由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,項目組日前獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。 白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目於去年9月啟動,吸引了中國農科院、華中農業大學、湖南大學等多所國內研究機構以及韓、英、加、澳、美等國的相關研究機構科研人員參與,其中中國農科院蔬菜花卉研究所和油料作物研究所為項目主持單位。此次測序所用材料為大白菜品種Chiifu、中國自主培育的甘藍品系11-02和油菜品種中雙11號。
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科學網—科學家破譯油菜多倍體基因組
本報訊(記者黃明明 通訊員餘波)近日,由國際油菜測序聯盟牽頭,中國農業科學院油料作物研究所等國內外相關機構首次完成甘藍型油菜的基因組測序工作
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我國三熟制油菜新品種選育獲突破
新華社武漢5月16日電(記者黃豔)隨著長江流域進入油菜籽的收穫季節,由中國農科院油料所培育的三熟制早熟油菜新品種「陽光131」傳來好消息:「陽光131」在雙季稻主產區表現出良好的極早熟和高產優勢,可解決我國三熟制油菜發展的瓶頸問題。
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前瞻基因產業全球周報第84期:華大基因回應「試劑盒缺陷」,求臻...
據了解,該方案與求臻醫學自主研發的涵蓋泛癌種、肺癌等九大系統腫瘤的20餘項腫瘤檢測產品一起,構建起了精準腫瘤基因檢測服務。,首次闡明了我國6大蜱種的基因組多樣性、群體遺傳結構以及病原體分布特點。中國農科院油料所破譯油菜基因組密碼,構建油菜基因轉錄資料庫近日,中國農業科學院油料作物研究所油料所油料作物基因組學與抗病性改良創新團隊成功破譯了油菜基因組的全轉錄信息密碼,構建了油菜10萬餘個基因的轉錄全景圖,使得油菜基因功能研究第一次有了相對標準的可參考的基因轉錄資料庫,有力支撐油菜功能基因的相關研究。
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科學網—擬南芥為油菜育種開闢新路徑
例如,歐洲油菜每年因果實開裂而造成的損失平均可達年產量的20%,在極端氣候條件下損失會進一步增加到50%甚至更多。因此,選育抗開裂的油菜品種可以有效少果莢開裂造成的經濟損失。 吳鴻介紹,早前對擬南芥果莢開裂的研究主要停留在對轉錄因子的研究層面。轉錄因子是一種結合蛋白,與RNA聚合酶形成轉錄起始複合體,共同參與轉錄起始的過程因此調控著下遊許多基因的轉錄水平。
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浙江大學全球油菜基因資源數位化利用交互式網站上線
近日,浙江大學作物所發布了全球油菜基因資源數位化利用資料庫與交互式網站BnaSNPDB,該網站的原始碼、利用說明以及簡明語音教程的連結等詳盡信息於2020年9月30日在線發表於計算與結構生物領域具有較高影響力的Computation and Structural Biotechnology Journal 雜誌(論文連結:https
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甘藍型油菜表觀基因組圖譜繪
該研究構建了目前為止最大的甘藍型油菜表觀遺傳學相關數據集,繪製了其表觀遺傳參考基因組圖譜,解釋了甘藍型油菜亞基因組間不平衡的表觀遺傳學基礎,並鑑定出植物中一種新的二價染色質狀態(H3K4me1-H3K27me3),為甘藍型油菜和其他多倍體植物的表觀遺傳學相關研究提供了重要資源。
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甘藍型油菜表觀基因組圖譜繪就
該研究構建了目前為止最大的甘藍型油菜表觀遺傳學相關數據集,繪製了其表觀遺傳參考基因組圖譜,解釋了甘藍型油菜亞基因組間不平衡的表觀遺傳學基礎,並鑑定出植物中一種新的二價染色質狀態(H3K4me1-H3K27me3),為甘藍型油菜和其他多倍體植物的表觀遺傳學相關研究提供了重要資源。
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我國建成世界最大油料作物種質資源庫
本報北京10月28日電 記者陳海波日前從中國農業科學院油料作物研究所獲悉,我國已建成世界上最大的油料作物種質資源庫,保存著國內外油菜、花生、大豆、芝麻等油料作物種質3.5萬餘份,成為油料科技創新的基礎性、戰略性資源。
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正值油菜初花期 專家支招抓田管
省農科院供圖□本報記者 左杉近年來,全省油菜籽產量已經躍居全國第一,油菜種植面積和產量連續多年創新高,2018年,我省提出全力打造「天府菜油」區域品牌,衝刺千億級別產業。但隨著疫情爆發,而當下又正值油菜初花期,「天府菜油」如何穩住招牌?「天府菜油」管理會遇到哪些問題?
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中美科學家合作揭示甘藍型油菜育性相關基因功能與進化歷史
. | 中國農科院油料所/美國賓夕法尼亞州立大學合作揭示甘藍型油菜育性相關基因功能與進化歷史雄性不育是油菜雜種優勢利用的最主要途徑,發掘具有實用價值的油菜雄性不育基因對我國油菜雄性不育系統研究具有重要意義。