常用的模式生物資料庫匯總

2021-02-15 i生信

模式生物在科研中的重要地位不必多說,今天給大家匯總了一下常用的模式生物資料庫。

MGI,Mouse Genome Informatics,http://www.informatics.jax.org/

比如我們搜個TP53,可以查看基因信息, 相關疾病,突變、等位基因和表型的信息,不同組織中的表達量,GO注釋信息,相關miRNA。

RGD,Rat Genome Databasehttp,http://rgd.mcw.edu/wg/home

RGD擁有著強大的在線分析和可視化的工具

比如蛋白之間的相互作用分析和可視化

SGD,Saccharomyces Genome Database,https://www.yeastgenome.org/

ZFIN,The Zebrafish Information Network,http://zfin.org/

基因信息查詢

Xenbase,http://www.xenbase.org/entry/

Xenbase不僅提供了相應的基因信息查詢,還提供了實驗Protocols和試劑(抗體等)的查詢

WormBase,http://www.wormbase.org/

這一資料庫包含的物種較多,大名鼎鼎的秀麗隱杆線蟲(Caenorhabditis elegans)自然也包含其中。

同其它模式生物資料庫一樣,查詢分析樣樣俱全

Flybase,http://flybase.org/

生物學家們是真的欠果蠅一個諾獎。。。但是又覺得這樣說似乎對小鼠不太公平。。。

TAIR,http://www.arabidopsis.org/

在之前的文章有比較詳細的介紹過,這裡給一個傳送門——植物研究,沒你不行!

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