模式生物在科研中的重要地位不必多說,今天給大家匯總了一下常用的模式生物資料庫。
MGI,Mouse Genome Informatics,http://www.informatics.jax.org/
比如我們搜個TP53,可以查看基因信息, 相關疾病,突變、等位基因和表型的信息,不同組織中的表達量,GO注釋信息,相關miRNA。
RGD,Rat Genome Databasehttp,http://rgd.mcw.edu/wg/home
RGD擁有著強大的在線分析和可視化的工具
比如蛋白之間的相互作用分析和可視化
SGD,Saccharomyces Genome Database,https://www.yeastgenome.org/
ZFIN,The Zebrafish Information Network,http://zfin.org/
基因信息查詢
Xenbase,http://www.xenbase.org/entry/
Xenbase不僅提供了相應的基因信息查詢,還提供了實驗Protocols和試劑(抗體等)的查詢
WormBase,http://www.wormbase.org/
這一資料庫包含的物種較多,大名鼎鼎的秀麗隱杆線蟲(Caenorhabditis elegans)自然也包含其中。
同其它模式生物資料庫一樣,查詢分析樣樣俱全
Flybase,http://flybase.org/
生物學家們是真的欠果蠅一個諾獎。。。但是又覺得這樣說似乎對小鼠不太公平。。。
TAIR,http://www.arabidopsis.org/
在之前的文章有比較詳細的介紹過,這裡給一個傳送門——植物研究,沒你不行!