防止破裂，透析袋通常在出廠前用10%甘油處理。透析袋含有微量硫化物、重金屬和一些吸收紫外線的雜質，對蛋白質和其他生物活性物質有害，必須在使用前去除。新購買的普通透析袋在使用前必須經過處理。
處理方法如下：
方法1: 將透析袋切成適當長度(10-20釐米)的小段。
將透析袋在大體積(500毫升)的2%(重量比)碳酸氫鈉和1摩爾/升乙二胺四乙酸鈉(酸鹼度=8.0)中煮沸10分鐘。用蒸餾水徹底清洗透析袋。在500毫升1摩爾/升乙二胺四乙酸鈉(pH=8.0)中煮沸10分鐘。冷卻後，將其放入30%或50%的酒精中，並放入4的冰箱中。確保透析袋始終浸沒在溶液中。從現在開始，使用透析袋時必須戴手套。透析袋的內外應在使用前用蒸餾水清洗。
方法2: 用50%乙醇煮沸1小時，依次用50%乙醇、0.01摩爾/升碳酸氫鈉和1摩爾/升乙二胺四乙酸(pH8.0)溶液洗滌，最後用蒸餾水洗滌。
方法3:實驗要求低的可以用簡單的方法處理。用開水煮沸5-10分鐘，然後用蒸餾水清洗使用。然而，也有現成的透析袋，含有非常少的雜質，只能用去離子水清洗，無需預處理。透析袋具有特殊的生物技術膜，不含硫化物和金屬雜質。