Cell Rep:揭示p53突變在癌症中的新模式和新功能

2020-11-25 生物谷

2019年8月4日訊 /

生物谷

BIOON /——TP53是研究最廣泛的癌症基因之一,以其抑癌作用而聞名。它能感知細胞的壓力或損傷,並相應地阻止細胞分裂或引發細胞死亡,從而阻止受損細胞的繁殖。該基因的突變消除了一個關鍵的細胞故障安全機制,是導致癌症的一個步驟。貝勒醫學院的研究人員對TP53突變進行了最全面的研究,以更好地理解導致這一重要基因失活的過程。他們的研究結果發表在《Cell Reports》雜誌上,揭示了基因如何發生突變,以及這些突變如何有助於預測臨床前景。


貝勒醫學院的微生物和分子病毒學教授Larry Donehower博士領導的團隊研究了10225名患者、包含32個不同的癌症的樣本的癌症基因組圖譜,並將他們與另一含80000突變的資料庫中的數據作對比。通過對這個

大數據

樣本的分析,他們對TP53基因突變如何影響癌症有了更深入的了解。

圖片來源:NIH


研究小組發現,在所有被研究的癌症類型中,存活率較低的患者中TP53突變更為頻繁。但他們也找到了一種更準確預測預後的方法。Donehower說,他在突變的TP53

腫瘤

中發現了四個上調基因,它們的表達與患者的預後有關。


貝勒Dan L Duncan癌症中心(Dan L Duncan Cancer Center at Baylor)的成員Donehower說,"如果這四種基因的表達水平很高,那麼病人的預後就更有可能很差。相反,如果患者的這些基因表達非常低,他可能活得更長,預後也更好。這將讓你更好地了解他的未來,而不僅僅是知道他是否存在TP53突變。"


在染色體水平上,研究小組發現TP53基因丟失有一個明顯的模式。


Donehower說:"在一些癌症基因中,你會看到這兩個基因的一個副本丟失或變異。超過91%的癌症同時失去了TP53基因,而不僅僅是一個。"


第二種基因丟失是由於突變、染色體缺失或基因複製造成的。但是,Donehower說,基因複製的情況發生的速度比以前認為的要高得多。


研究還表明,TP53突變與基因組不穩定性密切相關,提示正常蛋白在監測染色體完整性方面的作用。在大多數TP53突變瘤中,其他抑癌基因被刪除,而促使癌症發生的癌基因被擴增。


雖然有很多關於TP53的研究,但這是第一次使用五種不同的數據收集方法來檢測如此大量的

腫瘤

和癌症類型。Donehower說,這項研究的規模使他的團隊能夠注意到模式和相關性,這在較小的樣本中可能並不明顯。


"大多數關於TP53的研究都集中在一種癌症類型上," Donehower說。"觀察32種不同的癌症類型,你會發現無論哪種癌症類型,某些模式都是成立的。"


該研究的作者、貝勒醫學院Lester and Sue Smith乳腺中心癌症

基因組學

主任David Wheeler博士說,這項研究的結果可能為治療因失去這種基因而受影響的癌症的新方法打開了大門。


"由於TP53是癌症預防中最重要的看門人之一,我們對這一基因了解得越多,就越能理解癌症的基本生物學。這將導致開發更好的治療方法," Wheeler說,他是人類基因組測序中心和Dan L Duncan綜合癌症中心的成員。(生物谷Bioon.com)


參考資料:


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