Mol Cell:科學家開發出新型基因編輯技術—CRISPR-Cas

2020-11-28 生物谷

2014年10月23日 訊 /生物谷BIOON/ --經典的基因組編輯技術,即編輯已知的DNA序列,通過增加、刪除基因來實現基因功能的激活或者抑制;該技術可應用於醫學、生物技術、食品及農業等領域。近日,刊登在國際雜誌Molecular Cell上的一篇研究論文中,來自北卡羅來納大學的研究人員檢測了6種關鍵的分子元件,其或許可以幫助開發新型的基因組的編輯系統,即CRISPR-Cas系統。

Rodolphe Barrangou教授表示,利用CRISPR-Cas系統可以對細菌和人類細胞中的特殊DNA序列進行作用,CRISPR表示成簇的規律間隔的短回文重複序列,而Cas是一種和CRISPR系統相關聯的蛋白質、基因家族,其可以以序列依賴性的方式對DNA進行切割和靶向作用。

細菌可以利用CRISPR-Cas系統作為抵禦外來入侵者的防禦機制和免疫機制,這項研究中研究者揭示了CRISPR-Cas系統工作的機制和原理,倘若我們把這個系統比作一個謎語,那麼本文就對該謎語進行了解答;CRISPR-Cas系統讓全球很多尋找新技術控制基因的科學家非常著迷,這項研究可以幫助科學家們增強靶向DNA的特異性和有效性,為進行更多的遺傳修飾提供基礎工作。

而研究者也指出,該系統或許可對相關細菌進行控制來用作人類食品的開發,比如利用益生菌來開發奶酪;而且也可以將CRISPR-Cas系統應用於農業中,包括對穀物進行基因編輯來使其對疾病更加耐受。(生物谷Bioon.com)

本文系生物谷原創編譯整理,歡迎轉載!轉載請註明來源並附原文連結。謝謝!

Guide RNA Functional Modules Direct Cas9 Activity and Orthogonality

Alexandra E. Briner, Paul D. Donohoue, Ahmed A. Gomaa, Kurt Selle, Euan M. Slorach, Christopher H. Nye, Rachel E. Haurwitz, Chase L. Beisel, Andrew P. May, Rodolphe Barrangou.

The RNA-guided Cas9 endonuclease specifically targets and cleaves DNA in a sequence-dependent manner and has been widely used for programmable genome editing. Cas9 activity is dependent on interactions with guide RNAs, and evolutionarily divergent Cas9 nucleases have been shown to work orthogonally. However, the molecular basis of selective Cas9:guide-RNA interactions is poorly understood. Here, we identify and characterize six conserved modules within native crRNA:tracrRNA duplexes and single guide RNAs (sgRNAs) that direct Cas9 endonuclease activity. We show the bulge and nexus are necessary for DNA cleavage and demonstrate that the nexus and hairpins are instrumental in defining orthogonality between systems. In contrast, the crRNA:tracrRNA complementary region can be modified or partially removed. Collectively, our results establish guide RNA features that drive DNA targeting by Cas9 and open new design and engineering avenues for CRISPR technologies.

相關焦點

  • 盤點|CRISPR基因編輯技術研究進展
    由於該研究的發表,導致基因鹼基領域的公司股票暴跌,目前張鋒等人的Editas Medicine公司的股票暴跌,最多跌去每股2美元,共損失9818萬美元(折合人民幣6.59億)。基因編輯技術未知的風險太大,科學家對在人體上直接進行基因編輯非常謹慎。前段時間,基因編輯嬰兒事件一出,就引起了軒然大波。
  • 動物所開發新型基因組編輯工具CRISPR/Cas12b
    近年,CRISPR基因編輯技術及其相關應用成為生命科學領域備受關注的熱點研究方向。基於這種技術,科學家們可高效、快速、便捷地對感興趣的基因進行編輯,從而在基礎科研、農業和醫學的發展中具有重要應用。
  • Science | 科學家成功開發新型檢測技術,可實時檢測基因編輯脫靶效應!
    脫靶效應有可能導致基因突變,其不確定性和未知的安全風險限制了基因編輯技術的推廣應用。目前的基因編輯技術尚無法精準靶向目標序列,並不產生脫靶效應。科學家認為,既然無法完全避免,為安全起見,更好地了解、控制可能產生的脫靶效應是一個不錯的選擇。因此,脫靶檢測方法的開發成為了基因編輯領域的一個研究熱點。
  • CRISPR/Cas基因編輯技術最新研究進展
    以CRISPR/Cas9為基礎的基因編輯技術在一系列基因治療的應用領域都展現出極大的應用前景,如血液病、腫瘤和其他遺傳疾病。CRISPR/Cas9在多種類型的細胞和組織中都具有高效精確的基因編輯能力,在CAR-T、造血幹細胞等體外治療手段中是一個非常理想的操作平臺,在體內也可適用。
  • CRISPR/Cas基因編輯療法的前景與倫理爭議
    用基因編輯治療各類疾病的研究在不斷推進中,那麼,基因編輯技術是否可以用於臨床治療?使用基因編輯技術還存在哪些問題呢?,CRISPR/Cas技術迅速成為基因編輯時代最耀眼的「明星」。科學家你追我趕地利用CRISPR/Cas技術對細菌、真菌、植物、動物,包括人類細胞和胚胎進行基因編輯操作,最火熱的當屬基因編輯療法。
  • 科學家開發新型CRISPR技術的優化方案
    ▎藥明康德內容團隊編輯 新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)疫情暴發以來,世界各地的科學家們全力以赴與病毒賽跑,開發檢測方法、特效療法和疫苗,儘快識別狡猾的病毒並與之對抗。
  • ...利用新型CRISPR/Cas13靶向冠狀病毒SARS-CoV-2等RNA病毒
    2020年3月25日訊/生物谷BIOON/---基於CRISPR的遺傳篩選已幫助科學家們鑑定出在鐮狀細胞性貧血、癌症免疫療法、肺癌轉移和許多其他疾病中起關鍵作用的基因。但是,這些基因篩選的範圍是有限的:它們只能編輯或靶向DNA。
  • CRISPR-Cas9基因編輯技術:熱度背後的冷思考
    近年來,CRISPR/Cas9基因編輯技術正在給整個科研界帶來革命性變化,該技術使用CRISPR系統將Cas9蛋白和嚮導RNA注入小鼠受精卵,就能輕鬆實現基因敲除,同時,注入Donor DNA則可實現基因敲入,甚至國際著名學術期刊Genome Biology有文章指出這項新技術將很快取代使用胚胎幹細胞的基因修飾,看起來小鼠胚胎幹細胞基因修飾技術的終結不可避免。
  • Mol Cell:從結構上揭示出最大最複雜的CRISPR-Cas系統的作用機制
    在一項新的研究中,來自丹麥哥本哈根大學、中國山東大學和華中農業大學的研究人員利用先進的低溫電鏡(CryoEM)技術成功地可視化觀察最大最複雜的CRISPR-Cas系統的三維結構。他們認為這種系統可能在生物醫學和生物技術方面有潛在的應用。
  • Nature子刊:抗CRISPR蛋白介導的CRISPR-Cas9系統可提高基因編輯...
    2020年12月9日訊/生物谷BIOON/---CRISPR-Cas9基因編輯可能會引起不想要的遺傳變化。在一項新的研究中,來自日本廣島大學和東京醫科齒科大學的研究人員開發出一種很有前途的修複方法,即關閉CRISPR-Cas9基因編輯,直到它達到關鍵的細胞周期階段,在這個階段,更精確的修復可能會發生。
  • 發現單鹼基基因編輯造成大量脫靶並開發出優化解決方法
    發現單鹼基基因編輯造成大量脫靶並開發出優化解決方法 2019-07-09 【字體:中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心楊輝團隊與合作者率先建立了一種名為「GOTI」(Genome-wide Off-target analysis by Two-cell embryo Injection)的新型DNA脫靶檢測技術,並使用該技術發現:近年來興起的單鹼基編輯技術有可能導致大量無法預測的脫靶,因而存在嚴重的安全風險。
  • Mol Cell:從結構上揭示出最大最複雜的CRISPR-Cas系統的作用機制
    2020年8月3日訊/生物谷BIOON/---在一項新的研究中,來自丹麥哥本哈根大學、中國山東大學和華中農業大學的研究人員利用先進的低溫電鏡(CryoEM)技術成功地可視化觀察最大最複雜的CRISPR-Cas系統的三維結構。他們認為這種系統可能在生物醫學和生物技術方面有潛在的應用。
  • 基因編輯技術-CRISPR/Cas9
    CRISPR/Cas是進行基因編輯的強大工具,可以對基因進行定點的精確編輯。在嚮導RNA(guide RNA, gRNA)和Cas9蛋白的參與下,待編輯的細胞基因組DNA將被看作病毒或外源DNA,被精確剪切。但是,CRISPR/Cas9的應用也有一些限制條件。首先,待編輯的區域附近需要存在相對保守的PAM序列。其次,嚮導RNA要與PAM上遊的序列鹼基互補配對。
  • 醫療器械開發:2020年諾貝爾獎-CRISPR基因編輯技術
    Doudna 因開發了基因組編輯方法而獲得了諾貝爾化學獎,CRISPR是基因技術中最銳利的工具之一。這種方法正式被稱為CRISPR/Cas9基因編輯,通常簡稱為CRISPR,使科學家能夠精確切割他們想要的任何一條DNA鏈。
  • 多項研究開發出可增強基因組編輯範圍的新型CRISPR/Cas9工具
    在過去的十年裡,科學家們成功地利用這一自然現象,發現了細菌中的CRISPR蛋白--其中最廣泛使用的是Cas9酶。Cas9與嚮導RNA(gRNA)相結合,能夠靶向結合、切割和降解特定的DNA序列。CRISPR的應用範圍從治療遺傳疾病到農作物的營養功效,它已經成為最有前景的基因組編輯工具之一。然而,Cas9酶依賴特定的DNA郵政編碼來確定切割和編輯的位置。
  • ...蛋白介導的CRISPR-Cas9系統可提高基因編輯效率,同時降低脫靶效應
    2020年12月9日訊/生物谷BIOON/---CRISPR-Cas9基因編輯可能會引起不想要的遺傳變化。在一項新的研究中,來自日本廣島大學和東京醫科齒科大學的研究人員開發出一種很有前途的修複方法,即關閉CRISPR-Cas9基因編輯,直到它達到關鍵的細胞周期階段,在這個階段,更精確的修復可能會發生。
  • Cell:通過CRISPR篩選鑑定出抵抗新冠病毒感染的基因和藥物靶標
    圖片來自Cell, 2020, doi:10.1016/j.cell.2020.10.030。為了更好地理解宿主和病毒遺傳依賴性之間的複雜關係,這些作者使用了一系列分析和實驗方法來驗證他們的結果。這種綜合方法包括基因組編輯、單細胞測序、共聚焦成像以及基因表達和蛋白質組數據集的計算分析。
  • CRISPR相關工具網站集錦
       作者:追風    CRISPR系統為代表的基因組編輯工具發展迅猛,被廣泛應用於各種細胞、動物以及植物的定點編輯。新Cas同源物、Cas9抑制劑(Acr)的開發等成果層出不窮。
  • Mol Cell:科學家成功開發出有效治療乳腺癌的新型組合性療法
    2020年10月24日 訊 /生物谷BIOON/ --近日,一項刊登在國際雜誌Molecular Cell上的研究報告中,來自莫納什大學等機構的科學家們通過研究開發出了一種新型的組合性療法,其或有望幫助治療攜帶特定基因突變的乳腺癌患者。
  • 「最小」的CRISPR-Cas3系統 可快速準確刪除DNA片段,編輯效率近100%
    近日,有研究人員開發出一種緊湊型級聯CRISPR-Cas3系統,可快速準確對大規模DNA片段進行刪除。該系統稱為Cascade–Cas3,由進行性核酸酶Cas3,以及一個基於Type IC Cascade的最小系統組成,用於對細菌的基因組進行編輯。