附加方案鹼性瓊脂糖凝膠的放射自顯影多數情況下，利用鹼性瓊脂糖凝膠電泳分析的DNA是用3Pp標記的，可以用放射自顯影檢測。因凝膠乾燥後(見下文)可減少信號猝滅，因而使放射自顯影的圖像條帶銳度更好，同時使靈敏度略微提高。
但是，如果DNA中有足夠強的放射性標記，條帶的銳度將不是主要問題，或者在DNA條帶需從凝膠中回收的情況下，凝膠可以不經乾燥而直接進行放射自顯影。
方法1:溼膠的放射自顯影
1.電泳完畢，將凝膠放置於玻璃板上。
2.用KimWipes擦拭紙吸乾凝膠表面及周圍的玻璃板上的殘留液體。
3.用發光標記物標記玻璃板。
4.在感光影像儀上捕獲放射性影像(參見方案7)。
方法2:幹膠的放射自顯影
1.將凝膠浸於7%TCA溶液並於室溫處理30min，不時地搖動溶液以確保凝膠全部被溶液覆蓋。
2.將凝膠置玻璃板上，其上覆蓋幾層紙巾，並用另- -玻璃板覆蓋，乾燥數小時：或凝膠置於兩張Whatman 3MM濾紙上，用市售凝膠乾燥機進行真空乾燥。切勿加熱，以免凝膠融化。
3.將乾燥的凝膠置於3MM濾紙上，粘貼螢光標記物標籤以確保凝膠圖像位置的準確性。
4.在感光影像儀上捕獲放射性影像(參見方案7)。分子克隆實驗中的很多常用技術手段都依賴於在二維(2D)平面上對放射性原子的準確分布定位方法的建立。如果沒有這些方法，Southerm 雜交、Northerm 雜交、放射性DNA序列分析以及文庫篩選等工作都無法開展。