據不完全統計，2020年上半年美格基因合作文章共計57篇，發表期刊涵蓋The ISME Journal、Water Research、Microbiome、Environment International、Chemical Engineering Journal等國際頂尖學術期刊，平均影響因子高達5.699。在此按樣本類型整理部分合作文章，其中涉及到的組學產品有宏基因組、擴增子、GeoChip、轉錄和調控等。希望這些高分文章的實驗設計和分析方法可以給各位老師的研究提供參考。
至於下半年的項目文章頁會陸續整理出爐，敬請期待喇！
腸道與糞便
NO.1
Arsenic concentrations, diversity and co-occurrence patterns of bacterial and fungal communities in the feces of mice under sub-chronic arsenic exposure through food
小鼠糞便的微生物群落多樣性和共生模式受食物砷濃度的影響
發表期刊：Environment International
影響因子：7.943
發表時間：2020.2.19
合作單位：廣東醫科大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：糞便
NO.2
Variation of antibiotic resistome during commercial livestock manure composting
畜禽糞便堆肥過程中抗生素抗性的變化
發表期刊：Environment International
影響因子：7.943
發表時間：2020.1.2
合作單位：華南師範大學
研究對象與測序策略：宏基因組
樣品類型：糞便
NO.3
Microecological Koch’s postulates reveal that intestinal microbiota dysbiosis contributes to shrimp white feces syndrome
科赫法則揭示腸道微生物群失調與對蝦白糞症候群的關係
發表期刊：Microbiome
影響因子：10.465
發表時間：2020.3.1
合作單位：中山大學
研究對象與測序策略：細菌16S、宏基因組
樣品類型：腸道
土壤
NO.1
Drought changed soil organic carbon composition and bacterial carbon metabolizing patterns in a subtropical evergreen forest
乾旱對亞熱帶常綠森林土壤有機碳組成和細菌碳代謝的影響
發表期刊：Science of the Total Environment
影響因子：5.589
發表時間：2020.5.20
合作單位：華東師範大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：土壤
NO.2
Pollution adaptive responses of root-associated microbiomes induced the promoted but different attenuation of soil residual lindane: Differences between maize and soybean
根系相關微生物對土壤殘留林丹的促效不同衰減的汙染適應性反應：玉米與大豆的差異
發表期刊：Science of the Total Environment
影響因子：5.589
發表時間：2020.5.7
合作單位：浙江大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：土壤
NO.3
Depth-related variability in viral communities in highly stratified sulphidic mine tailings
垂直分層的含硫尾礦中病毒群落隨尾礦深度的變化規律
發表期刊：Microbiome
影響因子：10.465
發表時間：2020.6.10
合作單位：中山大學
研究對象與測序策略：細菌16S、宏基因組
樣品類型：土壤
NO.4
Island biogeography of soil bacteria and fungi: similar patterns, but different mechanisms
島嶼土壤細菌與真菌的生物地理特徵：模式相似但機制不同
發表期刊：ISME
影響因子：9.5
發表時間：2020.4.27
合作單位：華南師範大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：土壤
NO.5
Novel phosphate-solubilizing bacteria enhance soil phosphorus cycling following ecological restoration of land degraded by mining
新型溶磷細菌促進重金屬礦業廢棄地生態修復過程的磷循環
發表期刊：ISME
影響因子：9.5
發表時間：2020.3.23
合作單位：華南師範大學
研究對象與測序策略：宏基因組
樣品類型：礦區土壤
NO.6
Warming-induced permafrost thaw exacerbates tundra soil carbon decomposition mediated by microbial community
溫室效應引起的凍土融化加劇微生物群落介導的土壤有機碳分解
發表期刊：Microbiome
影響因子：10.465
發表時間：2020.1.17
合作單位：俄克拉荷馬大學
研究對象與測序策略：細菌16S、GeoChip
樣品類型：凍土土壤
文章解讀：溫室效應引起的凍土融化加劇微生物群落介導的土壤有機碳分解
反應器
NO.1
Application of acidic conditions and inert-gas sparging to achieve high-efficiency nitrous oxide recovery during nitrite denitrification
應用酸性條件和惰性氣體噴射實現在亞硝酸鹽反硝化過程中高效回收一氧化二氮
發表期刊：Water Research
影響因子：7.913
發表時間：2020.6.5
合作單位：華東理工大學
研究對象與測序策略：細菌16S、宏基因組、宏轉錄組
樣品類型：反應器
NO.2
Effects of N-acyl-homoserine lactones-based quorum sensing on biofilm formation, sludge characteristics, and bacterial community during the start-up of bioaugmented reactors
基於群體感應的N-醯基高絲氨酸內酯對生物強化反應器啟動過程中生物膜形成、汙泥特性和細菌群落的影響
發表期刊：Science of the Total Environment
影響因子：5.589
發表時間：2020.5.11
合作單位：北京大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：反應器
NO.3
Driving microbial sulfur cycle for phenol degradation coupled with Cr(VI) reduction via Fe(III)/Fe(II) transformation
Fe（III）/Fe（II）轉化驅動微生物硫循環降解苯酚並還原Cr（VI）
發表期刊：Chemical Engineering Journal
影響因子：8.355
發表時間：2020.3.19
合作單位：大連理工大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：反應器
NO.4
Progressive Microbial Community Networks with Incremental Organic Loading Rates Underlie Higher Anaerobic Digestion Performance
微生物群落系統的有機負荷率增加可提高厭氧消化性能
發表期刊：mSystems
影響因子：6.519
發表時間：2020.1.7
合作單位：俄克拉荷馬大學
研究對象與測序策略：細菌16S、GeoChip
樣品類型：厭氧反應器
生物膜
NO.1
The unexpected concentration-dependent response of periphytic biofilm during indole acetic acid removal
吲哚乙酸去除過程中生物膜衛生群落的非預期濃度依賴性響應
發表期刊：Bioresource Technology
影響因子：6.669
發表時間：2020.1.29
合作單位：中國科學院南京土壤研究所
研究對象與測序策略：細菌16S、真菌18S
樣品類型：生物膜
NO.2
Chronic exposure to CuO nanoparticles induced community structure shift and a delay inhibition of microbial functions in multi-species biofilms
CuO納米顆粒長期暴露引起生物膜群落結構的改變及對微生物功能的延遲抑制
發表期刊：Journal of Cleaner Production
影響因子：6.395
發表時間：2020.3.3
合作單位：河海大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：生物膜
NO.3
Dynamics of class 1 integrons in aerobic biofilm reactors spiked with antibiotics
抗生素強化好氧生物膜反應器中的動力學研究
發表期刊：Environment International
影響因子：7.943
發表時間：2020.5.28
合作單位：中國科學院大學
研究對象與測序策略：細菌16S、真菌18S
樣品類型：水樣濾膜
水體
NO.1
Nonlinear response of methane release to increased trophic state levels coupled with microbial processes in shallow lakes
淺水湖泊甲烷釋放對水體營養狀態與微生物的非線性響應
發表期刊：Environmental Pollution
影響因子：5.714
發表時間：2020.6.4
合作單位：南京師範大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：水體
NO.2
Integrating high-throughput sequencing and metagenome analysis to reveal the characteristic and resistance mechanism of microbial community in metal contaminated sediments
結合擴增子測序和宏基因組測序分析揭示金屬汙染沉積物中微生物群落特徵及抗性機制
發表期刊：Science of the Total Environment
影響因子：5.589
發表時間：2020.3.10
合作單位：北京科技大學
研究對象與測序策略：細菌16S、宏基因組
樣品類型：水體
NO.3
Suspended particles phoD alkaline phosphatase gene diversity in large shallow eutrophic Lake Taihu
太湖淺水富營養化水體懸浮顆粒物中phoD鹼性磷酸酶基因多樣性研究
發表期刊：Science of the Total Environment
影響因子：5.589
發表時間：2020.4.19
合作單位：南京師範大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：水體
NO.4
Differences in metabolic potential between particle-associated and free-living bacteria along Pearl River Estuary
珠江口中顆粒物附著細菌和自由生活細菌的代謝潛力差異
發表期刊：Science of the Total Environment
影響因子：5.589
發表時間：2020.6.17
合作單位：汕頭大學
研究對象與測序策略：細菌16S、GeoChip
樣品類型：水體
NO.5
Functional profiles of phycospheric microorganisms during a marine dinoflagellate bloom
裸甲藻水華過程中微生物的功能特徵
發表期刊：Water Research
影響因子：7.913
發表時間：2020.1.25
合作單位：清華大學深圳研究院
研究對象與測序策略：細菌16S、宏基因組
樣品類型：水體
淤泥、沉積物
NO.1
Dynamics of coastal bacterial community average ribosomal RNA operon copy number reflect its response and sensitivity to ammonium and phosphate
沿海細菌群落平均核糖體拷貝數動態反映其對銨、磷的反應和敏感性
發表期刊：Environmental Pollution
影響因子：5.714
發表時間：2020.1.10
合作單位：北京大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：沉積物
NO.2
Enhanced removal of antibiotic resistance genes and mobile genetic elements during sewage sludge composting covered with a semi-permeable membrane
汙泥堆肥過程中覆蓋半透明膜可增強抗生素耐藥基因和遺傳移動基因元件的去除
發表期刊：Journal of Hazardous Materials
影響因子：7.65
發表時間：2020.4.13
合作單位：福建農林大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：沉積物
NO.3
Effects of aging and transformation of anatase and rutile TiO2 nanoparticles on biological phosphorus removal in sequencing batch reactors and related toxic mechanisms
銳鈦礦和金紅石礦的二氧化鈦納米顆粒的轉化對生物除磷的影響
發表期刊：Journal of Hazardous Materials
影響因子：7.65
發表時間：2020.5.22
合作單位：河海大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：沉積物
NO.4
Removal of malodorant skatole by two enriched microbial consortia: Performance, dynamic, function prediction and bacteria isolation
兩種強化微生物聯合去除惡臭糞臭素
發表期刊：Science of the Total Environment
影響因子：5.58
發表時間：2020.4.1
合作單位：大連海事大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：沉積物
NO.5
Biotransformation of tris(2-chloroethyl) phosphate (TCEP) in sediment microcosms and the adaptation of microbial communities to TCEP
三氯乙基磷酸酯在沉積物中的生物轉化以及對微生物群落的影響
發表期刊：Environmental Science&Technology
影響因子：7.149
發表時間：2020.4.22
合作單位：廣州地化所
研究對象與測序策略：細菌16S、宏基因組
樣品類型：沉積物
NO.6
Response of sediment bacterial communities to the drainage of wastewater from aquaculture ponds in different seasons
不同季節底泥細菌群落對養殖池塘汙水排放的響應
發表期刊：Science of the Total Environment
影響因子：5.589
發表時間：2020.2.10
合作單位：河海大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：沉積物
NO.7
Enriching indigenous microbial consortia as a promising strategy for xenobiotics』 cleanup
豐富本土微生物群落是異種生物淨化汙水的一種有前途的策略
發表期刊：Journal of Cleaner Production
影響因子：6.395
發表時間：2020.3.21
合作單位：華南農業大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：汙泥
NO.8
Characteristics and mechanisms of H2S production in anaerobic digestion of food waste
餐廚垃圾厭氧消化過程中H2S生成特性及機理
發表期刊：Science of the Total Environment
影響因子：5.589
發表時間：2020.3.16
合作單位：清華大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：汙泥
NO.9
High-efficiency methanogenesis via kitchen wastes served as ethanol source to establish direct interspecies electron transfer during anaerobic Co-digestion with waste activated sludge
以廚餘垃圾為乙醇源的高效產甲烷菌與廢活性汙泥厭氧共消化建立種間直接電子傳遞
發表期刊：Water Research
影響因子：7.913
發表時間：2020.4.1
合作單位：大連理工大學
研究對象與測序策略：細菌16S
樣品類型：汙泥、食品垃圾
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