Science子刊:一種新型腺嘌呤鹼基編輯器可讓細胞RNA編輯最小化

2021-01-13 生物谷

2019年5月20日訊/

生物谷

BIOON/---在一項新的研究中，來自美國布羅德研究所和哈佛大學的研究人員發現有證據表明使用鹼基編輯器會導致細胞中出現意想不到的RNA編輯。相關研究結果發表在2019年5月8日的Science Advances期刊上，論文標題為「Analysis and minimization of cellular RNA editing by DNA adenine base editors」。在這篇論文中，他們描述了他們對CRISPR類型腺嘌呤鹼基編輯器（ABE）的研究，以及他們取得的發現。

圖片來自Vossman/Wikipedia。


ABE將一個DNA鹼基對轉換成另一個DNA鹼基對，從而允許修復某些細胞類型中的突變，而不會產生不想要的編輯效應。據認為，ABE還有潛力校正幾乎一半已知的導致醫學疾病的

遺傳

異常。ABE的科學基礎對醫學界來說變得越來越重要。不幸的是，最近的一些研究已發現，ABE可能也會導致意料之外的編輯。在今年3月，一個研究團隊發現胞嘧啶鹼基編輯器3型（CBE3）以高於正常的速率誘導單核苷酸變異。在上個月，另一個研究團隊發現胞嘧啶鹼基編輯器（CBE）和ABE導致RNA中的脫靶編輯。在這項新的研究中，這些研究人員試圖在使用ABE時進一步測試脫靶編輯，並在確認後找到一種解決方案。

這些研究人員以一種包括人細胞系中所有細胞RNA轉錄本的方式分析了ABE的最新版本，稱為ABEmax，而且他們使用比其他人使用的更靈敏的工具來做到這一點。他們報導他們確實在RNA樣本中發現了低水平的脫靶編輯。為了解決這個問題，他們開發了在保留在靶鹼基編輯的能力同時導致較少RNA編輯的新型ABE變體（基於滅活的野生型大腸桿菌）。他們進一步報導說，這些新型變體是以一種讓RNA和DNA編輯過程解耦合的方式構建出來的，這樣就能夠最大限度地減少DNA和RNA中的脫靶編輯。

這些研究人員得出結論：由於較低的RNA編輯且較短的RNA半衰期，對未來研究的幹擾程度可能取決於它們的具體應用。他們建議尋求讓RNA編輯最小化的科學家們使用他們構建出的一種新變體---他們稱之為ABEmaxQW。（生物谷 Bioon.com）

參考資料：Holly A. Rees et al. Analysis and minimization of cellular RNA editing by DNA adenine base editors, Science Advances (2019). DOI: 10.1126/sciadv.aax5717.

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