植物病原細菌適應環境變化的新機制被發現

2020-09-03 BioArt植物

PLoS Pathogens | 上海交大朱勃/陳功友團隊揭示植物病原細菌通過RNA編輯適應環境變化的新機制


責編 | 逸雲


腺苷-肌苷（A-to-I）RNA編輯是真核生物中重要的轉錄後事件，由ADAR家族的腺苷脫氨酶催化。由於肌苷（I）被聚合酶和翻譯機制識別為鳥苷（G）， mRNA編碼區的 A-to-I 編輯可導緻密碼子改變，從而導致蛋白功能的多樣性。而原核生物中 A-to-I 編輯及其生物學意義還鮮有研究。


2020年8月21日，上海交通大學農業與生物學院朱勃/陳功友合作團隊在國際著名學術期刊PLoS Pathogens發表了題為A-to-I RNA editing in bacteria increases pathogenicity and tolerance against oxidative stress的研究論文，揭示了原核細菌通過 A-to-I 的RNA編輯適應環境變化的新機制。



該研究團隊通過自行開發的Python腳本對稻黃單胞菌稻生致病變種Xanthomonas oryzae pv. oryzicola (Xoc)在氧化應激下的 A-to-I 編輯事件進行識別和分析，發現 A-to-I 編輯在氧化應激脅迫下將鞭毛蛋白FliC第128位胺基酸由絲氨酸（S）變為脯氨酸（P），從而導致鞭毛絲結構的改變。這種轉錄後編輯可以通過增加生物膜的形成來增加氧化應激耐受性和細菌毒力。該研究還發現，原核細菌惡臭假單胞菌（Pseudomonas putida）也存在 A-to-I 編輯響應氧化應激的機制。



Proposed new mechanism that bacteria use to adapt to oxidative stress


上海交通大學農業與生物學院博士研究生聶文翰和王賽以及中國科學技術大學博士後何瑞為論文的共同第一作者，上海交通大學長聘教軌副教授朱勃和長聘教授陳功友為論文的共同通訊作者。朱勃博士2017年以長聘教軌副教授引入交大農業與生物學院。該研究得到了科技部重點研發等項目的資助。


原文連結：

https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1008740

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