APE是一款序列分析軟體,可以對序列進行分析比對,引物設計,DNA序列翻譯等等,因此它的用途是十分廣泛的,如分子克隆等。那麼今天就給大家介紹一下它的下具體應用步驟吧。打開軟體後,點擊File-new,建立對話框,複製所要分析序列。或者點擊open,打開下載的序列(fasta或者gb格式)。
點擊Enzymes,進入Enzymes select,可以對序列進行包含酶切位點分析,在進行克隆實驗時,儘量避免選擇序列所包含的限制性內切酶,避免插入片段被酶切。為克隆實驗提供參考。
選中序列後,點擊Tool中Find primer,軟體默認引物長度為20—25nt,GC含量45-60%,Tm值55-60度,軟體可以自動分析序列,設計特異性引物,非常方便。
打開兩個序列文件,點擊Tool中Align two sequence, 可以對兩個文件進行序列比對,其中不同序列部分軟體進行紅色標註,一目了然。
選中序列後,點擊Tool中 sgRNA可以進行輔助設CRISPR/CAS9引物。建議作為參考。
選中序列後,點擊Ctrl+T,可以將選中序列翻譯為蛋白質序列。
該軟體還有許多其他功能,在這裡不一一介紹了,大家可以親自體驗下軟體的應用。忘記一件重要的事情,想獲得,回復「
APE」獲取軟體壓縮包哦!!!「醫學方」始終致力於服務「醫學人」,將最前沿、最有價值的臨床、科研原創文章推送給各位臨床醫師、科研人員
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