Cell:重大突破!發現一種廣譜的CRISPR/Cas9抑制劑

2021-01-09 生物谷

圖片來自Cell, doi:10.1016/j.cell.2017.07.037


2017年9月10日/

生物谷

BIOON/---如果說CRISPR複合物聽起來很熟悉,那是因為它們是新一波基因組編輯技術的最前沿。CRISPR/Cas系統是目前發現存在於大多數

細菌

與所有的古菌中的一種免疫系統,被用來識別和摧毀抗噬菌體和其他病原體入侵的防禦系統。

在CRISPR/Cas系統中,CRISPR是規律間隔性成簇短回文重複序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)的簡稱,涉及細菌基因組中的獨特DNA區域,也是儲存病毒DNA片段從而允許細胞能夠識別任何試圖再次感染它的病毒的地方,CRISPR經轉錄產生的RNA序列(被稱作crRNA)識別入侵性病毒的

遺傳

物質。Cas是CRISPR相關蛋白(CRISPR-associated proteins, Cas)的簡稱,Cas蛋白像一把分子剪刀那樣切割

細菌

基因組上的靶DNA。科學家們已發現他們能夠利用CRISPR降解病毒RNA的天然能力,並且使用CRISPR系統從幾乎任何一種有機體中移除不想要的基因。

目前已在

細菌

中發現三類CRISPR/Cas系統,I型和III型系統需要眾多蛋白的參與。II型系統就簡單得多了,一個Cas9核酸酶利用嚮導RNA(gRNA)就可以完成識別和切割靶雙鏈DNA,因此II型系統也被稱作CRISPR/Cas9系統。

細菌

的免疫系統中,CRISPR-Cas9的作用是靶向結合和摧毀侵入性的DNA,並且被作為一種穩健的基因組編輯技術加以使用。噬菌體編碼的小分子抗CRISPR蛋白(anti-CRISPR proteins, Acr)能夠讓Cas9酶失活,從而為基於Cas9的應用提供一種高效的關閉開關。

在一項新的研究中,來自美國加州大學伯克利分校、麻薩諸塞大學醫學院、哈佛醫學院和加拿大多倫多大學的研究人員證實兩種Acr蛋白,即AcrIIC1和AcrIIC3,利用不同的策略抑制Cas9。相關研究結果發表在2017年9月7日的Cell期刊上,論文標題為「A Broad-Spectrum Inhibitor of CRISPR-Cas9」。

AcrIIC1是一種廣譜Cas9抑制劑,通過直接結合到Cas9的保守性HNH催化結構域上,阻止多種有差異的Cas9直系同源物切割DNA。AcrIIC1-Cas9 HNH結構域複合體的晶體結構展示了AcrIIC1如何將Cas9限制在一種DNA結合的但是沒有催化活性的狀態。相反,AcrIIC3阻斷單個Cas9直系同源物的活性,誘導Cas9形成二聚體,從而阻止Cas9結合到靶DNA上。

這兩種不同的機制允許獨自地控制Cas9的靶標DNA結合和切割,而且也為開展允許Cas9結合到靶DNA上但阻止它切割DNA的應用鋪平道路。(生物谷 Bioon.com)

參考資料:Lucas B. Harrington, Kevin W. Doxzen, Enbo Ma et al. A Broad-Spectrum Inhibitor of CRISPR-Cas9. Cell, 7 September 2017, 170(6):1224–1233, doi:10.1016/j.cell.2017.07.037進一步閱讀:與CRISPR/Cas系統相愛相殺的抗CRISPR蛋白研究最新進展

相關焦點

  • Gene KO Mediated by CRISPR-Cas9 System (Cas9-2hitKO)
    更為重要的是,Ryan願意無償分享cas9系統的全套載體,還可以抽空指導大家實驗。小白們快加入實驗小白微信群和Ryan學習技術吧!What is the CRISPR-Cas9 system?To achieve higher knockout efficiency, vector carrying one cas9 protein and two guide RNA expressing cassettes is generated.
  • Cell Stem Cell:重大突破!開發出比CRISPR-Cas9更好的CRISPRi技術
    基於這種系統的CRISPRi使用一種由兩種蛋白組分融合在一起而形成的蛋白:一種組分是一種可經強力黴素(doxycycline)誘導而失活的Cas9蛋白版本(dCas9),另一種組分是蛋白KRAB的抑制結構域。
  • CRISPR-Cas9應用依舊任重道遠
    CRISPR和DNA片段當地時間6月29日,美國「物理學組織」網站報導,來自英國弗朗西斯克裡克研究所、美國哥倫比亞大學和美國俄勒岡健康與科學大學的三個獨立研究團隊在測試利用CRISPR-Cas9基因編輯系統改變人類胚胎遺傳缺陷的可能性時發現,
  • 【綜述】治療性CRISPR/cas9技術研究進展
    目前為止已經發現的 Crispr/cas9 系統有三種類型,研究得最為透徹的是第二種類型[2]。在細菌防禦反應中,外源性DNA會被切割成很多小段,插入到CRISPR位點旁,然後被轉錄成Cr-RNA前體,繼續通過剪切變成成熟的 Cr-RNA 。相應的反義鏈上會經過轉錄和轉錄後加工,形成一個互補的 traCr-RNA ,跟Cas9核酸酶形成核蛋白複合體繼續識別和切割入侵的外源 DNA[2]。
  • 意想不到的突變,CRISPR-Cas9的應用仍然是任重道遠
    CRISPR和DNA片段據美國「物理學組織」網站報導,當地時間美國「物理學組織」網站報導,來自哥倫比亞大學弗朗西斯克裡克研究所和美國俄勒岡健康與科學大學的三個獨立研究團隊發現,CRISPR-Cas9基因編輯系統可能導致基因組的意外突變。
  • Nature:利用CRISPR-CAS9進行全基因組基因轉錄激活篩選
    2015年2月1日訊 /生物谷BIOON/ --近日,來自美國的科學家在國際期刊Nature發表了他們的最新研究成果,他們利用結構導向的方法改造了CRISPR-CAS9複合物來系統性研究基因功能,並通過構建sgRNA文庫大規模篩選抵抗BRAF抑制劑的激活基因。該文章利用CRISPR-CAS9技術研究基因功能,對後基因組時代的基因功能研究具有推動作用。。
  • CRISPR-Cas9基因編輯技術:熱度背後的冷思考
    2017年初,Broad研究所和合作者們被授權了關於真核生物細胞(包括人類細胞)的基因組編輯的CRISPR專利,而加州大學伯克利分校和合作者授權的專利是關於將CRISPR技術用於到cell-free系統中,並不是涉及真核細胞的基因組編輯。
  • JMC|靶向DDX3X特定結構域的計算策略發現高選擇性廣譜抗病毒抑制劑
    作為絕對寄生體,所有病毒有共同的細胞途徑,這為開發廣譜抗病毒藥提供了靶向宿主因子的可能性。人源DEAD-box RNA解旋酶DDX3X是病毒複製必需但同時對於細胞發育具有重要作用,是抗腫瘤的潛在靶點。因此,開發具有抗病毒但同時不影響宿主細胞發育的高選擇性DDX3X抑制劑具有重意義。傳統DDX3X抑制劑是針對ATP和RNA結合位點,但是該結合位點抑制劑選擇性差。
  • 【重磅消息】MIT和哈佛共建CRISPR-Cas9全球專利技術共享平臺丨醫...
    今天是2017年7月22日  農曆六月二十九  醫麥客:今天是個特別的日子—上海在燃燒  2017年7月22日/醫麥客 eMedClub/--2012年,一種名為「CRISPR/Cas9」的DNA編輯技術橫空出世。
  • 一種廣譜抗SARS-CoV-2等多種病毒活性的口服實驗藥物NHC
    Baric課題組通過在人細胞系上展開試驗,證實核糖核苷類似物β-D-N4-hydroxycytidine(NHC, EIDD-1931)對SARS-CoV-2, MERS-CoV, SARS-CoV和相關的人畜共患病群Bat-CoVs 2B或2C具有廣譜抗病毒活性,並且對一種核糖核苷類似物抑制劑Remdesivir具有耐藥突變的冠狀病毒具有增強效力
  • 5 分鐘學會 cas9 基因敲除——原來設計方案如此簡單
    這是一種見於 crRNA 分子的短核苷酸基序,可以被 Cas9 蛋白特異性識別並切割的 20 個 nt。 而 PAM 序列的特徵為 NGG(其中 N 為任意核苷酸)找敲除目的基因的外顯子根據目的基因選擇待敲除靶基因位點找出敲除目的基因的外顯子。
  • Cell:重大突破!首次鑑定出抑制RAS癌基因的小分子
    在一項新的研究中,來自美國西奈山伊坎醫學院、斯克利普癌症斯研究所、阿爾伯特-愛因斯坦醫學院和紐約結構生物學中心的研究人員鑑定出一種靶向這種重要的癌基因的新機制。儘管分子腫瘤學家在理解這些突變和它們對細胞信號轉導的影響方面取得重大進展,但是在開發系統性地靶向這些RAS癌基因的藥物方面幾乎沒有取得任何進展。這種進展的缺乏導致這個領域的很多人將RAS視為一種「無藥可靶向(undruggable,也譯作無藥可治的,無藥可用的)」的癌基因。在這項研究中,研究人員鑑定出首個小分子能夠同時抑制RAS癌基因激活的不同信號通路。
  • 2019國自然熱門寵兒——CRISPR/Cas9技術
    那就趕緊來試試巴菲爾的CRISPR/Cas 9文庫高通量篩選技術——1,快速準確的找到與某種表型相關的基因2,全基因組水平篩選,利於發現新靶點3,假陽性率較低,靶點命中率高4,應用範圍廣單基因敲除研究路線圖文庫篩選路線圖巴菲爾crispr
  • Science子刊:基因編輯工具CRISPR-Cas9遭遇新挫折!新研究揭示它可...
    2020年2月26日訊/生物谷BIOON/---在一項新的研究中,來自德國明斯特大學的研究人員發現,在小鼠進行常規的CRISPR-Cas9基因插入過程中,不必要的DNA重複頻率很高。他們描述了他們如何發現不必要的DNA重複,並針對這一點提醒了其他的研究人員。圖片來自CRISPR-Cas9是一種在過去十年中開發的基因編輯技術。它切割出基因組中不需要的部分,並插入新的DNA片段。人們已經進行了許多研究來測試這種技術,以期有一天可以將它用於修復導致疾病的遺傳缺陷。有關脫靶編輯的報導阻礙了這一目標的實現,這導致了旨在阻止脫靶編輯的新研究。
  • Cell:新研究發現caspase-2抑制劑有望治療脂肪肝
    在一項新的研究中,來自美國加州大學聖地牙哥分校醫學院的研究人員通過使用小鼠和人類臨床樣本,發現作為一種蛋白裂解酶,caspase-2是NASH的一個關鍵驅動因素。通過鑑定caspase-2的關鍵作用,他們認為這種酶的抑制劑可能提供一種有效的方法來阻止導致NASH的致病進展,甚至可能逆轉這種疾病的早期症狀。
  • PNAS:構建出提高CRISPR-Cas9基因編輯精確度的新變體---SaCas9-HF
    2019年10月13日訊/生物谷BIOON/---在一項新的研究中,來自中國香港城市大學的研究人員開發出基因編輯技術CRISPR-Cas9的一種新變體,它有潛力在人類基因治療期間提高基因編輯的精確度。相比於野生型CRISPR-Cas9,這種新變體降低了DNA中出現的意外變化,這表明它可能在需要高精確度的基因療法中發揮作用。
  • Nature子刊:抗CRISPR蛋白介導的CRISPR-Cas9系統可提高基因編輯...
    對基因編輯進行更多的控制CRISPR-Cas9作為一種更簡單、更便宜的工具,開創了基因編輯的新領域。它的作用就像剪刀一樣,可以切割你想要改變的遺傳物質。然而,這個過程也會產生脫靶效應,從而限制了它在治療領域的應用。
  • 什麼是CRISPR cas9基因編輯技術?
    參考---什麼是CRISPR cas9基因編輯技術?
  • Science子刊:重大突破!首次利用CRISPR/Cas9基因組編輯系統在體內...
    他們開發出一種基於脂質納米顆粒的新型遞送系統,該遞送系統專門針對癌細胞,並通過基因操縱破壞它們。這種稱為CRISPR-LNP的遞送系統攜帶一種編碼Cas9的信使RNA(mRNA),其中Cas9作為分子剪刀切割細胞中的DNA。
  • Nature Cell Biology:鐵死亡抑制劑開闢治療新機會
    2014年11月19日訊 /生物谷BIOON/ --科學家們已經發現,一種新形式的可以控制生物體組織中不成熟細胞死亡的機制,稱為鐵死亡(Ferroptosis),同時還發現了扭轉死亡的機制。測試這個機制可以防止人腎細胞組織損傷,急性腎功能衰竭和肝損傷,幫助開發藥理治療這些疾病的可能性。到現在為止,鐵死亡是細胞死亡的一種形式,僅在腫瘤細胞中被確定。