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Masson染色
主要用途：鑑別膠原纖維和肌纖維
檢驗原理：該法染色與陰離子染料分子的大小和組織的滲透有關，小分子量易穿透結構緻密、滲透性低的組織，而大分子量則只能進入結構疏鬆的、滲透性高的組織。然而，苯胺藍的分子量很大，因此Masson染色後肌纖維呈紅色，膠原纖維呈藍色。
腎組織Masson染色油紅O脂肪染色
主要用途：顯示組織內的脂肪
檢驗原理：油紅O為脂溶性染料，在脂肪內能高度溶解，可特異性的使組織內甘油三酯等中性脂肪著色。
肝臟脂肪油紅O脂肪染色天狼星紅染色（Sirius red）
主要用途：用於各種組織病變時對膠原纖維異常或纖維增生的研究中
檢驗原理：天狼星紅和其襯染液都是強酸性染料，易與膠原分子中的鹼性基團結合，吸附牢靠。偏振光鏡檢查，膠原纖維有正的單軸雙折射光的屬性，與天狼星紅染色液結合後，可增強雙折射，提高解析度，從而區分兩型膠原纖維，Ⅰ型膠原纖維呈現橙黃色或者紅色，Ⅲ型膠原纖維呈現綠色。普通光學顯微鏡觀察膠原纖維呈現紅色，細胞核呈現綠色，其他成分呈現黃色。
心臟組織天狼星紅染色 普通光學顯微鏡
天狼星紅染色 偏振光番紅-固綠染色
主要用途：可以直觀反映關節軟骨、軟骨下骨和骨組織的結構。
檢測原理：番紅O（safranin O）-固綠（fast green）染色軟骨呈紅色，成骨呈綠色。嗜鹼性的軟骨與鹼性染料番紅結合呈現紅色，嗜酸性的骨和酸性染料固綠結合而呈綠色或藍色，與呈現紅色的軟骨對比鮮明，從而將軟骨組織與骨組織區分開。
番紅-固綠染色HE染色
主要用途：組織學、病理學教學與科研中最基礎、使用最廣泛的技術方法之一
檢驗原理：蘇木精染液為鹼性，可以將組織的嗜鹼性結構（如核糖體、細胞核及細胞質中的核糖核酸等）染成藍紫色；伊紅為酸性染料，可以將組織的嗜酸性結構（如細胞內及細胞間的蛋白質，包括路易體、酒精小體以及細胞質的大部分）染成粉紅色，使整個細胞組織的形態清晰可見。
肝臟HE染色免疫組化
主要用途：惡性腫瘤的診斷與鑑別診斷、確定轉移性惡性腫瘤的原發部位、對某類腫瘤進行進一步的病理分型等
檢驗原理：抗體和抗原之間的結合具有高度的特異性，免疫組織化學正是利用了這一原理。先將組織或細胞中的某種化學物質提取出來，以此作為抗原或半抗原，通過免疫動物後獲得特異性的抗體，再以此抗體去探測組織或細胞中的同類的抗原物質。由於抗原與抗體的複合物是無色的，因此還必須藉助於組織化學的方法將抗原抗體結合的部位顯示出來，以其達到對組織或細胞中的未知抗原進行定性，定位或定量的研究。
腎臟免疫組化染色免疫螢光
主要用途：顯示和檢查細胞或組織內抗原或半抗原物質
檢驗原理：免疫學的基本反應是抗原-抗體反應。由於抗原抗體反應具有高度的特異性，所以當抗原抗體發生反應時，只要知道其中的一個因素，就可以查出另一個因素。免疫螢光技術就是將不影響抗原抗體活性的螢光色素標記在抗體（或抗原）上，與其相應的抗原（或抗體）結合後，在螢光顯微鏡下呈現一種特異性螢光反應。
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