疫苗是人類預防病原微生物感染致病的重要武器,它通過刺激人體主動產生適應性免疫來提供感染前的保護屏障。另外,治療性疫苗也可以通過中和抗體來提供感染後的治療效果。傳統意義上,疫苗接種後可使機體對特定的病原體產生免疫力,但近些年來人們發現疫苗可以對他們原本不打算抵禦的病原體提供保護。
多項研究表明,在初次感染或接種疫苗後產生的適應性免疫應答並非只是適應性免疫細胞(如B細胞和T細胞)的特點,髓系細胞和NK細胞等天然免疫細胞也可以受到影響。卡介苗(BCG)、麻疹、口服脊髓灰質炎疫苗降低嬰幼兒死亡率的原因不僅僅有賴於對目標病原的特異性作用。並且,卡介苗的這種額外作用引起了廣泛關注,目前正在對卡介苗進行試驗,以查看其是否可以提供針對COVID-19的臨時保護[1]。
近日,Cell Host & Microbe在線發表題為「BCG Vaccination in Humans Elicits Trained Immunity via the Hematopoietic Progenitor Compartment」的論述。研究結果稱健康的人類接種卡介苗誘導了與骨髓中造血幹細胞和祖細胞(HSPC)內的髓樣細胞發育和功能相關的持續轉錄程序。
該研究使用人類體內疫苗接種模型來評估健康個體進行卡介苗接種是否會導致骨髓內造血幹細胞和祖細胞(HSPC)以及外周血單核細胞(PBMC)的表觀遺傳、轉錄和功能的變化。
圖1 圖示概要
首先,健康志願者接種卡介苗90天後進行白念珠菌的再刺激,發現了多種細胞因子的釋放,即驗證了卡介苗誘導異源先天免疫的能力。特別是炎性細胞因子IL-1β在白念珠菌再刺激後顯著上調。
並且,雖然骨髓和外周血中的細胞類型並未發生變化,但是卡介苗接種在HSPC的水平誘導了與髓樣和粒細胞譜系相關的轉錄本的上調,即疫苗可能使健康個體發生了髓樣發育偏向。
卡介苗接種後90天會上調與中性粒細胞和單核吞噬細胞發育和功能相關的轉錄組網絡。
為了驗證檢測差異表達基因(DEG)時發現的HSPC中的髓樣偏斜情況,在BCG疫苗接種之前和之後90天對HSPC中上調的DEG進行了無偏基因本體論富集分析(GOEA),確定了以下增強的途徑:「粒細胞激活」、「中性粒細胞介導的免疫」和「對外部刺激反應的積極調節」等。
隨後,基因水平的分析表明,與中性粒細胞的發育和功能有關的重要基因如SERPINA1,S100A12,S100A9,半乳糖凝集素3(LGALS3)和溶菌酶(LYZ)的表達有上調。加之其他證據得出猜想:接種BCG的疫苗會使髓系趨向於粒系。
圖2 BCG疫苗誘導髓系命運啟動
HNF1α和HNF1β可以調節BCG接種後九十天介導的人體HSPC先天免疫訓練
一些基因可以導致與人類先天免疫記憶和髓樣細胞命運相關的基因的表達以及循環中性粒細胞的增加,為了揭示其中保護誘導調控基因網絡的因素,研究針對與不同的順式調控轉錄因子結合基序相關的基因集,分析HSPC從D0到D90的表達倍數變化並進行基因集富集分析(GSEA)。
GSEA預測出兩個具有最強顯著性的轉錄因子,即HNF1α和HNF1β,它們在肝臟和髓樣細胞中均有表達。數據揭示了HNF1α和HNF1β是接種卡介苗90天後靜息的HSPC中參與卡介苗誘導的先天免疫記憶形成的關鍵調節劑。
圖3 基因集富集分析
卡介苗誘導外周CD14 +單核細胞持續的表觀遺傳學變化
基於既往研究,研究者假設先天免疫記憶的誘導是反映在PBMC內的主要效應細胞類型,即CD14+單核細胞的表觀基因組內。為了驗證這一猜想,通過使用ATAC測序手段來分析轉座酶可及染色質的方法,評估了接種前後CD14+單核細胞的染色質可及性差異,發現了多種炎性相關基因的DNA可及性增加,如COL22A1、CXCL6、RBP4。然後,又在CD14+單核細胞的表觀基因組中尋找與HSPC相關的轉錄組變化。
有趣的是,在與HSPC轉錄組內基因上調的更多開放區域相關的啟動子區域中,研究再次確定了CXCL6,CLEC17A,PTGIR和STAT6從HSPC轉錄組到CD14+單核細胞表觀基因組是保守的。反之亦然,在CD14+單核細胞的表觀基因組中,關閉了與髓樣發育和譜系啟動相關的基因座,例如CEBPG,TNFRSF12A和CXCR4,以及與細胞增殖相關的基因座如CDK4和CDK6。
總之,這些分析表明卡介苗在HSPC中誘導的轉錄組變化,在表觀遺傳上主要針對的是PBMC衍生的效應細胞,即CD14+單核細胞。至少部分是通過調節炎症相關基因的DNA可及性來完成的。這使得CD14+單核細胞持續的免疫訓練表型可以超越單個細胞壽命之外。
圖4 外周血單核細胞表觀遺傳改變
討論總結
該研究證明了人類體內的卡介苗接種可誘導健康個體的HSPC中持續的轉錄組變化,這種變化伴隨著固有免疫細胞對異源刺激的持續響應。卡介苗接種與HSPC轉錄程序重新向骨髓生成轉變有關。
在新生兒隨機接種卡介苗的臨床試驗中,接種卡介苗幾天後嗜中性粒細胞計數升高,PBMC對離體細菌和真菌無關刺激的反應性增強,均證實了這種變化的生理相關性。這些發現為確定臨床疫苗開發的目標和免疫訓練的治療靶標提供了新思路。
參考資料:
[1] https://www.the-scientist.com/news-opinion/an-old-tb-vaccine-finds-new-life-in-coronavirus-trials-67504
[2] Cirovic B, Bree L C J D, Groh L, et al. BCG Vaccination inHumans Elicits Trained Immunity via the Hematopoietic ProgenitorCompartment[J]. Cell Host & Microbe, 2020, 28(2).
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