2019年5月「小張聊科研」就有關注過這類RNA的一個側面：越來越多的研究表明，一些非編碼RNA（LncRNA、circRNA和pri-miRNA）編碼的小肽或蛋白真實存在，並且通常不到100個胺基酸（LncRNA研究領域又一個研究方向，你知道嗎？）。可以說雙功能RNA的出現模糊了編碼與非編碼RNA的界限，促使研究者開始重新考慮其在功能和進化中的特殊角色及其潛在分子機制。近年來，核糖體譜與質譜技術的迅猛發展揭示了ncRNA的普遍翻譯，由此產生的相關短開放閱讀框序列信息以及來源於非編碼區域的微肽數據也得以快速積累，為研究人員提供了新的研究方向和契機。因此，如何從大量、分散的數據資源中快速、準確地獲取已被證實的雙功能RNA及其相關信息，成為研究人員開展雙功能RNA相關結構、功能、上下遊作用機制以及開發新的預測方法等研究的先決條件。今天就來介紹一個非常好用的源自文獻報導、已有實驗證據支持的cncRNA數據資源平臺：cncRNADB。
平臺網址：http://www.rna-society.org/cncrnadb/
使用者可選擇不同方式對cncRNA進行查詢，包括關鍵詞查詢、基因座查詢和序列查詢，各參數項選擇/輸入方法如下所示。
1、關鍵詞查詢（Keyword Search）
（1）下拉框選擇需要查詢的RNA類型（RNA type）：Untranslated mRNA 或Translated ncRNA；
（2）下拉框選擇物種（Species）；
（3）下拉框選擇：Gene name或Disease name；
（4）輸入關鍵詞：如下拉框③中選擇為Gene name，此處可輸入基因名，如「VEGFA」等；如選擇為Disease name，此處可輸入疾病名，如「Breast cancer」等；
（5）勾選是否需要精確查詢關鍵詞，不勾選則執行模糊查詢。
2、基因座查詢（Locus Search）
（6）、（7）同（1）、（2）；
（8）選擇所在染色體（Chromosome）編號；
（9）輸入基因組起始和終止區間（Genome Start/End）；
3、序列查詢（Blast Search）
（10）同1；
（11）選擇查詢的序列類型（Sequence type）：Protein Sequence或RNA Sequence；
（12）輸入序列。
使用者可通過RNA類型（RNA type）、物種（Organism）和證據類型（Method）三個角度對cncRNA進行分層瀏覽。其中「證據類型（Method）」是根據已報導的cncRNA相關文獻或資料庫中使用的實驗方法進行分類，包括3種類型：
（1）Both by High & Low-throughput method：同時使用高通量方法（如Selected reaction monitoring，SRM）和低通量方法（如In vitro translation assay）進行實驗驗證的數據；
（2） Only by Low-throughput method：僅使用低通量方法進行實驗驗證的數據；
（3） Only by High-throughput method：僅使用高通量方法進行實驗驗證的數據。
平臺內的cncRNA數據支持多種途徑免費下載，使用者可通過查詢、瀏覽功能獲得cncRNA詳細信息，並直接下載結果信息，也可在「Download & API」頁面下載全部數據。
以組合參數「Untranslated mRNA & Homo sapiens & Disease name & Breast cancer」為例進行查詢，點擊查詢結果中cncRNA ID 為CNC_M_001422的條目末端「more」按鍵可獲取此cncRNA更多相關注釋信息。
1、基本信息
2、實驗證據
3、物種間同源信息
4、參考文獻相關描述
5、亞細胞定位信息
6、來源於OMIM資料庫的相關疾病表型（提供直達連結）
7、相關的互作信息
更多詳細信息可訪問平臺（http://www.rna-society.org/cncrnadb/）或閱讀文章詳細了解：cncRNAdb: a manually curated resource of experimentally supported RNAs with both protein-coding and noncoding function. Nucleic Acids Research. 2020. doi: 10.1093/nar/gkaa791.