DLBCL遺傳亞型概率分類工具的治療前景

2020-12-01 科學網

DLBCL遺傳亞型概率分類工具的治療前景

作者:

小柯機器人

發布時間:2020/4/17 19:54:28

美國國立衛生研究院的Louis M. Staudt研究組發現,擴散性大B細胞淋巴瘤(DLBCL)的遺傳亞型的概率分類工具具有治療意義。這一成果發表在2020413日出版的《癌細胞》雜誌上。

他們描述一種算法,該算法根據患者的遺傳特徵確定其淋巴瘤屬於七個遺傳亞型之一的可能性。這種分類揭示了這些DLBCL亞型與各種惰性淋巴結和淋巴結外淋巴瘤類型之間的遺傳相似性,表明存在共同的發病機理。

這些遺傳亞型還具有獨特的基因表達譜、免疫微環境和免疫化學療法後的預後。遺傳亞型模型的功能分析突出了針對性療法的明顯易感性,從而支持此分類在精準醫療試驗中的應用。

據介紹,隨著DLBCL的精準醫療方法的發展,其明顯的遺傳性、表型和臨床異質性使人感到困惑。最近的多平臺基因組研究使用聚類方法揭示了DLBCL遺傳亞型的存在。

附:英文原文

Title: A Probabilistic Classification Tool for Genetic Subtypes of Diffuse Large B Cell Lymphoma with Therapeutic Implications

Author: George W. Wright, Da Wei Huang, James D. Phelan, Zana A. Coulibaly, Sandrine Roulland, Ryan M. Young, James Q. Wang, Roland Schmitz, Ryan D. Morin, Jeffrey Tang, Aixiang Jiang, Aleksander Bagaev, Olga Plotnikova, Nikita Kotlov, Calvin A. Johnson, Wyndham H. Wilson, David W. Scott, Louis M. Staudt

Issue&Volume: 2020/04/13

Abstract: The development of precision medicine approaches for diffuse large B cell lymphoma(DLBCL) is confounded by its pronounced genetic, phenotypic, and clinical heterogeneity.Recent multiplatform genomic studies revealed the existence of genetic subtypes ofDLBCL using clustering methodologies. Here, we describe an algorithm that determinesthe probability that a patient's lymphoma belongs to one of seven genetic subtypesbased on its genetic features. This classification reveals genetic similarities betweenthese DLBCL subtypes and various indolent and extranodal lymphoma types, suggestinga shared pathogenesis. These genetic subtypes also have distinct gene expression profiles,immune microenvironments, and outcomes following immunochemotherapy. Functional analysisof genetic subtype models highlights distinct vulnerabilities to targeted therapy,supporting the use of this classification in precision medicine trials.

DOI: 10.1016/j.ccell.2020.03.015

Source: https://www.cell.com/cancer-cell/fulltext/S1535-6108(20)30155-0

相關焦點

  • 資源| Python上的圖模型與概率建模工具包:pomegranate
    新版本為概率分布、k 均值、混合模型、隱馬爾可夫模型、貝葉斯網絡、樸素貝葉斯/貝葉斯分類器等模型提供模型擬合、結構化學習和推斷過程的修正,並重點關注於處理數據缺失值。pomegranate 簡介pomegranate 是基於 Python 的圖模型和概率模型工具包,它使用 Cython 實現以加快反應速度。它源於 YAHMM,可實現快速、高效和極度靈活的概率模型,如概率分布、貝葉斯網絡、混合隱馬爾可夫模型等。概率建模最基礎的級別是簡單的概率分布。
  • 四象限分類的工具
    用四象限分類去找方向一、四象限是我常用來分類的,以前在看《金字塔原理》的時候,芭芭拉明託提出的一個思考工具MECE法則,意思是「相互獨立,完全窮盡」。也被常稱為「不重疊,不遺漏」,當時還不懂什麼意思。通俗版的,就理解為四象限。
  • 信念醫藥董事長肖嘯:基因治療的風險、前景和挑戰
    討論環節,信念醫藥董事長兼CSO肖嘯博士圍繞基因治療載體的應用場景,基因治療新藥的發展空間、前景和存在的挑戰等行業熱門話題進行了深度分享與探討,啟明創投投資合伙人唐豔旻擔任該場討論的主持人。基因編輯工具CRISPR的應用場景肖嘯博士在對今年獲得諾貝爾獎的CRISPR基因編輯技術介紹時表示,CRISPR在三個方面都有非常強大的優勢。
  • 2018中考數學概率分類匯總
    下面是《2018中考數學概率分類匯總》,僅供參考!    歡迎使用手機、平板等行動裝置訪問中考網,2020中考一路陪伴同行!>>點擊查看
  • [PRML]線性分類模型--概率判別模型
    在這種情況下,通過對後驗概率進行精確建模,然後應用標準決策理論來獲得最優解。3 邏輯回歸從考慮二分類問題開始處理廣義線性模型。在統計學術語中,這種模型稱為邏輯回歸,但應強調這是一種分類模型,而不是回歸模型。
  • 胰腺癌不同治療方式的應用與前景
    筆者主要討論胰腺癌不同治療方式的應用與前景。 一、胰腺癌的手術治療 胰十二指腸切除術是唯一一種有可能治癒胰腺癌的治療方式,手術範圍及手術方式的選擇取決於腫瘤分期。早期胰腺癌出現淋巴結轉移,提示預後不佳,擴大淋巴結清掃術並不能改善胰頭癌患者的預後。
  • 墨跡天氣IPO失敗,工具類軟體前景黯淡
    工具類APP的尷尬有專家稱,工具類軟體IPO前景黯淡,門檻低商業模式落後,用戶體驗和流量變現幾乎是不可以調和的矛盾,墨跡被否理所應當。昨天以超低價發行港股的魯大師今天大跌,7億月活的美圖在港股和4億月活且一度成功出海、AI加持的獵豹在美股,兩者股價都從高點跌了90%。說明無論什麼市場,投資人都用腳投票。
  • 遺傳病學的分類及治療方法
    遺傳病學的分類及治療方法 2020-06-25 07:59 來源:澎湃新聞·澎湃號·湃客
  • 會計相關知識學習筆記——金融工具(概述、分類和重分類、區分)
    其中,企業自身權益工具不包括應當按照金融工具列報準則分類為權益工具的可回售工具或發行方僅在清算時才有義務向另一方按比例交付其淨資產的金融工具,也不包括本身就要求在未來收取或交付企業自身權益工具的合同。衍生工具在未來某一日期結算,表明衍生工具結算需要經歷一段特定期間。衍生工具通常在未來某一特定日期結算,也可能在未來多個日期結算。第二節 金融資產和金融負債的分類和重分類金融資產和金融負債的分類是確認和計量的基礎。企業應當根據其管理金融資產的業務模式和金融資產的合同現金流量特徵,對金融資產進行合理的分類。
  • 上海科學家研發雙鹼基編輯工具助力基因治療
    這四個基因編輯工具雖然名稱各異,但構建方案和功能類似,其中以李大力和劉明耀課題組開發的工具活性最高,編輯窗口更寬泛,具有優勢。該工具打破現有鹼基編輯器作用底物的限制,創新性地開發了新型雙功能鹼基編輯器,為基礎研究和遺傳性疾病如β-地中海貧血的治療提供了新的原創工具體系。   ClinVar數據顯示,人類約58%的遺傳疾病是由於鹼基突變引起的。
  • 全球與中國瘧疾治療藥物行業調查分析及市場前景預測報告(2020...
    《全球與中國瘧疾治療藥物行業調查分析及市場前景預測報告(2020-2026年)》通過瘧疾治療藥物項目研究團隊多年對瘧疾治療藥物行業的監測調研,結合全球及中國瘧疾治療藥物行業發展現狀及前景趨勢,依託國家權威數據資源和一手的調研資料數據,對瘧疾治療藥物行業現狀及趨勢進行全面、細緻的調研分析,採用定量及定性的科學研究方法撰寫而成。
  • 基因治療方面的核心技術及產業前景
    一、 基因治療:基於遺傳操控的疾病治療方案基因治療是指用正常的基因導入人體細胞,以糾正或補充因基因缺陷和異常所引起的疾病,是一種根本性的治療策略。導入的基因可以是與缺陷基因對應、在體內表達具有特異功能的同源基因,也可以是與缺陷基因無關的治療基因。
  • 神經內分泌腫瘤是癌嗎,神經內分泌腫瘤怎麼分類?如何治療
    神經內分泌腫瘤有哪些分類神經內分泌腫瘤是一大類疾病的總稱,是指起源於全身任何部位的神經內分泌細胞的良惡性腫瘤。按照神經內分泌腫瘤細胞可以產生和分泌多種激素的部位分類,包括胰腺神經內分泌腫瘤,胃腸道神經內分泌腫瘤,肺、胸腺神經內分泌腫瘤,腎上腺腫瘤,嗜咯細胞瘤,副神經節瘤等等。
  • 革蘭氏陽性菌的詳細分類及治療
    該測試還可以幫助您的醫生了解細菌是革蘭氏陰性還是革蘭氏陽性,從而選擇合適的治療方式。然而你可能對於革蘭氏陽性菌陰性菌這些概念並不熟悉,今天為大家講解下,革蘭氏陽性菌,革蘭氏陰性菌的區別,革蘭氏染色法,常見的革蘭氏陽性菌類型以及相應的治療。首先,我們了解下,革蘭氏陽性菌和陰性菌各自的特徵。革蘭氏陽性細菌的主要特徵是它們的結構。
  • 前景驚人! 人工智慧在生命科學中的六個重大應用
    這個數字反映了人工智慧(AI)工具幫助醫生、病人、保險公司和監管人員做出更好決策、優化創新以及提高研究和臨床試驗效率的潛力。為此,5月1日,GEN網站整理羅列了人工智慧在生命科學領域內六個最有價值的應用。本文參考了全球五大製藥公司對人工智慧技術的分析。
  • 變廢為寶 前景無限——各地推進垃圾分類掃描
    新華社北京4月30日電 題:變廢為寶 前景無限——各地推進垃圾分類掃描  新華社記者王優玲、鄭生竹  「綠色帳戶」吸引居民參與垃圾分類、智能化垃圾分類、單位生活垃圾強制分類……全國各地正在因地制宜採用激勵辦法和剛性約束手段引導居民參與垃圾分類,推進垃圾無害化處理
  • 腸道裡的醫學未來:利用腸道菌群的治療前景
    頂尖學術期刊《科學》近期發表的一篇綜述文章,總結了目前來看富有治療前景的三種腸道微生物調控策略。在這篇文章中,我們與大家分享其中的要點。這種治療手段指的是,將健康人糞便中的功能菌群移植到患者胃腸道,重建具有正常功能的腸道菌群。 這其實不是一個新概念。早在公元前4世紀,中國醫書中就有使用糞便製劑治療胃腸道疾病的記錄 。
  • 體細胞治療應嚴格分級分類監管
    現行《醫療技術臨床應用管理辦法》對醫療技術實行負面清單制和分類目錄管理;而《生物醫學新技術臨床應用管理條例》(2019年2月 徵求意見稿)對生物醫學新技術臨床研究實行分級管理,將「幹細胞技術、體細胞技術」列為高風險,臨床研究和轉化應用均由國務院衛生主管部門採取「審批制」準入。
  • 快訊:幹細胞移植兩大機制治療缺血性腦梗塞前景廣闊
    隨著近年來幹細胞療法的興起,幹細胞移植技術受到醫學界的越來越多的關注,也為中風等難治性疾病的臨床治療提供了新的方向。 它們被認為是幹預神經系統疾病的良好工具和潛在的自然資源。研究還發現,幹細胞還可以參與腦損傷的修復過程(如腦缺血,外傷性出血或阿爾茨海默氏病,帕金森氏病等)。 因此,許多臨床前研究表明,幹細胞移植可以在各種神經系統疾病的治療中具有重要的補充或替代作用,也為幹預腦梗死帶來了新的希望。
  • 前沿:幹細胞移植治療脊髓損傷前景廣闊!
    隨著再生醫學技術的發展,幹細胞被用於身體各種組織中的種子細胞,在再生修復中顯示出良好的應用前景。在過去的30年中,隨著幹細胞研究的不斷深入,目前,使用間充質幹細胞治療脊髓損傷已成為臨床研究的方向。幹細胞移植為脊髓損傷提供了一種新的臨床幹預辦法。傳統方法幹預脊髓損傷效果不盡人意脊髓損傷(SCI)是一種具有很高致殘率的中樞神經系統損傷。