DNA及RNA甲基化數據分析、課題設計與基金寫作學習班學習班 2020年...

2021-01-09 網易

2020-11-23 13:09:25 來源: 柳葉刀學術

舉報

  11.14-15

  線上

  11.21-22

  線上

  11.21-22

  線上

  11.21-22

  線上

  11.23-27

  線上

  11.28-29

  線上

  11.28-29

  線上

  11.28-29

  線上

  11.28-29

  線上

  12.4-6

  線上

  12.5-6

  線上

  12.5-6

  線上

  12.5-6

  線上

  12.5-6

  線上

  12.5-6

  線上

  線上互動好 線下服務好

  老師建群 長期回答和指導學員

  贈送同步視頻供回放使用 不限時間

  面向人群

  廣大臨床/科研工作者,碩、博研究生,零基礎也可以參加。

  

  課程背景

  甲基化修飾,特別是DNA中的5-甲基胞嘧啶(5mC)和信使RNA(mRNA)中的N6-甲基腺苷(m6A)的甲基化,是由S-腺苷甲硫氨酸(SAM)依賴性甲基轉移酶產生。這些修飾在動植物的生命活動中發揮著重要的調節功能,並在多種腫瘤的發生發展中發揮著重要的作用。尤其是作為近年來研究熱點的m6A,它是真核細胞中mRNAs豐度最高的甲基化修飾,在包括組織發育、幹細胞自我更新和分化、熱休克以及DNA損傷應答,母本合子(maternal-to-zygotic)轉化等多個重要的生物學過程中扮演重要角色。

  當前高分文章發表及國家自然基金支持情況均反映DNA及RNA甲基化尤其是m6A已成為當前學術研究的熱點方向,是一個增長迅速、擁有巨大研究意義的新興領域。鑑於DNA/RNA甲基化具有重要的臨床研究意義,我們特別邀請到在該領域擁有豐富經驗的專家老師為大家詳細的介紹DNA/RNA甲基化的研究內容、研究方向及課題思路,並通過培訓使學員熟練的掌握甲基化相關課題的數據獲得和分析過程,迅速成為表觀遺傳領域的主力軍。

  

  授課老師

  來自中科院,,目前承擔國家科技部、國家自然基金委和重點研發計劃等多項課題。

  1、理論結合實操;2、案例講解分析結合;3、協助分析學員的實際數據

  

  課程安排

  第一天上午

  8:30-

  11:30

  DNA甲基化調控機制、科研應用及研究思路

  明確DNA甲基化的作用機制及調控機理。

  了解DNA甲基化在疾病等各研究領域中的應用。

  了解DNA甲基化與轉錄組等多組學整合分析思路。

  通過高分文章對DNA甲基化研究思路進行解讀。

  掌握DNA甲基化研究的多種技術方法。

  6. 了解常用DNA甲基化及疾病挖掘資料庫。

  理論

  第一天下午

  1:30-

  17:00

  DNA甲基化晶片及測序數據分析

  DNA甲基化晶片及測序分析常用軟體介紹。

  DNA甲基化晶片及測序數據分析策略。

  DNA甲基化晶片及測序分析圖表解讀。

  差異甲基化鑑定、注釋及富集分析。

  DNA甲基化晶片數據分析 (ChAMP等軟體)。

  DNA甲基化測序數據分析(bismark,methylKit等軟體)。

  DNA甲基化與轉錄組數據整合分析。

  利用公共甲基化數據完成整套甲基化分析流程。

  實操

  第一天晚上

  18:00-21:00

  RNA甲基化功能機制、研究策略及思路分析

  RNA甲基化研究進展概述。

  了解RNA甲基化的概念和修飾類型。

  明確RNA甲基化對RNA加工代謝及生物學功能的調控機制。

  了解RNA甲基化在疾病等領域中的研究應用。

  通過高分文獻思路示例及總結對RNA甲基化調控腫瘤等功能研究思路進行解析。

  了解RNA甲基化常用的各種測序技術。

  m6A甲基化的研究現狀、思路和研究方法。

  理論

  第二天上午

  8:30-

  11:30

  m6A甲基化數據分析

  了解各種RNA甲基化修飾譜分析技術。

  m6A測序技術流程介紹及測序報告解讀。

  m6A常見分析內容及相關軟體介紹。

  m6A peak鑑定(R包exomePeak、MACS2)、peak差異分析(R包exomePeak)、motif分析(Homer、MEME)及peak分布(RMBase)等。

  m6A修飾基因的功能富集分析(DAVID,Metascape、GSEA等)。

  預測m6A甲基化位點在線工具介紹。

  m6A常用資料庫介紹及使用(MeT-DB,m6AVar,RMBase)

  實操

  第二天下午

  1:30-

  17:00

  m6A甲基化多組學整合分析,課題設計與基金申請

  1. m6A甲基化測序的項目延伸及思路拓展。

  2. m6A甲基化與多組學數據(RNA-seq,Ribo-seq等)整合分析。

  3. 非編碼RNA(miRNA及lncRNA等)的m6A甲基化分析。

  4. 通過TGGA、ICGC等資料庫挖掘RNA甲基化癌症研究思路。

  5. RNA甲基化研究策略與課題設計 。

  6. RNA甲基化研究經驗交流。

  7. RNA甲基化相關國自然課題的介紹。

  8. DNA及RNA甲基化基金申請思路、準備內容及方案設計注意事項等。

  9. 討論及個性化問題答疑。

  理論+實操

  【主辦單位】

  瑋瑜科研平臺

  【承辦單位】

  上海瑋瑜生物科技有限公司

  上海婉怡科技服務中心

  【註冊費用】

  單獨參加(單獨參加本班):3200元/人

  兩班連報(任選其他一個班):6000元/人(其他班見尾頁)

  可開會務費 註冊費 檢測費 分析服務費等發票

  【時間地點】

  會務時間:2020年11月28日-29日 線上班

  【匯款帳號】

  A:匯款帳戶

  帳戶名稱:上海婉怡科技服務中心

  帳 戶 號:9734 0154 7300 0076 1

  開 戶 行:上海浦東發展銀行大華支行

  收款人:wybiot@163.com 支付寶戶名:上海瑋瑜生物科技有限公司

  C:信用卡或公務卡支付

  【聯繫人】

  聯繫人:謝老師 13611825136

  【報名方法】

  報名方法一:郵箱報名:您編輯您的姓名、手機號碼 參加班級發送到wybiot@126.com郵箱

  報名方法二:在線報名:

  報名本班的課程

  可享受本班線下的免費復聽

  享受知識、方法的不斷更新與迭代

  - 瑋瑜平臺-

  其他課程安排 關注我們 點擊近期會一和近期會二

  瑋瑜科研平臺

  免費送其他班講義

  瑋瑜所有課程重在實用、力求學有所用、學有所值!

特別聲明:以上內容(如有圖片或視頻亦包括在內)為自媒體平臺「網易號」用戶上傳並發布,本平臺僅提供信息存儲服務。

Notice: The content above (including the pictures and videos if any) is uploaded and posted by a user of NetEase Hao, which is a social media platform and only provides information storage services.

相關焦點

  • m6A(RNA甲基化修飾)課題思路介紹及熱點方向分析
    國家自然基金支持情況既代表國家宏觀層面對學術研究的導向性,也可以反映出當前學術研究的熱點方向,我們以國家自然科學基金中標項目分析m6A甲基化研究。從事相關科研課題設計工作多年,發表論文40餘篇,其中10分以上5篇,主持和參與國自然基金項目5項,其中m6A課題相關的4項。
  • 什麼是甲基化?如何利用NCBI開始甲基化課題
    所以,如果小夥伴你想研究甲基化之類的研究,那你就可以利用CPG島的位置來預測和推測甲基化的位置啦。這些聚集的CPG島主要位於基因的啟動子(promotor)和第一外顯子區域,約有60%以上基因的啟動子含有CpG島。CpG島的GC含量大於50%(這是一個非常重要的特點哦)。
  • 系統評價與meta分析學習班
    中國臨床試驗註冊中心將舉辦系統評價與Meta分析學習班。由吳泰相老師主講。吳老是我國主要的系統評價與meta分析學習班的老師,曾在美國疾病控制與預防中心、荷蘭Erasmus大學、澳大利亞Monash大學/澳大利亞-紐西蘭Cochrane中心(Australasian Cochrane Centre)進修學習;專業和主要研究方向:循證醫學、循證實驗醫學、臨床流行病學、Cochrane系統評價。
  • 單細胞數據挖掘與課題設計實戰課程
    零基礎如何介入單細胞測序領域並快速發文章; 首先,單細胞測序高昂的實驗成本及分析成本阻礙了大部分課題組的步伐。一例樣本的實驗加測序成本約3萬,測6例樣本加分析、驗證、投稿等費用基本超過25萬,然而靠堆積樣本量發高分文章的路子已經不適用,巧妙的課題設計,成熟的數據分析將成為決定文章上限的主要門檻。
  • 清華舉辦2017年青年學術骨幹交流學習班
    清華舉辦2017年青年學術骨幹交流學習班清華新聞網6月19日電 為深化黨管人才工作,加強對黨外青年學術骨幹的政治引領,清華大學黨委組織部和人事處於近日聯合舉辦2017年青年學術骨幹交流學習班。來自15個院系的17名青年學者參加了學習班活動,他們中的絕大多數都有長期海外學習、工作經歷,併入選了優青、長江青年學者等國家級青年人才支持計劃。6月15日,學習班舉行總結座談會。校黨委書記陳旭,常務副書記、副校長姜勝耀出席,與學習班學員就學校人才培養、改革發展和大家關心的問題進行了深入交流。
  • 【課題套路】一篇NC教你組蛋白甲基化課題新套路
    明年的基金申請即將開始,你準備好了嗎?是否已經選定課題方向?現如今,表觀遺傳學在疾病研究中的地位越來越重要,高分論文中不乏DNA/RNA/蛋白的甲基化/乙醯化研究。我們公眾號已經陸續解讀過研究熱點m6A的課題設計思路(後續還會有關於m6A的各種技術帖噠),這一回讓我們來看看組蛋白甲基化修飾的研究應該如何設計。
  • 2018國自然研究熱點二: RNA甲基化研究深度剖析
    ,我們可以發現,RNA甲基化這兩年的基金項目呈指數級增長的趨勢:特別是從2015年的5項到2017年的25項,項目增長尤為顯著。從獲批的項目的研究內容來看,既有單純鑑定RNA甲基化譜的課題,也有從RNA甲基化修飾酶入手的課題,以及針對RNA甲基化的功能機制展開的課題。這表明RNA甲基化的研究還是處於一個基礎篩選與功能機制齊飛,比較多樣化的狀態。值得一提的是,也有課題將RNA甲基化修飾與miRNA以及外泌體分泌聯繫起來,以篩選/鑑定腫瘤分子標誌物,這也是一個值得嘗試的RNA甲基化重要方向。
  • 北大經濟學博士張川川:經濟學實證分析方法與論文寫作經驗分享會...
    分為計量經濟學實證方法與論文寫作暨Stata計量經濟分析高級應用兩大模塊,經濟學實證方法與論文寫作訓練模塊為網絡直播;Stata計量分析與高級應用模塊為網絡視頻錄播(免費贈送),上述課程均可在線回看。
  • 基因測序(視頻+課件),輕鬆學會數據的處理和分析
    它重在數據,因此在這個領域中比較重要的是數學和計算機——計算機指的是:編程能力和算法設計能力。但生物信息畢竟還是和生物有關,毫無生物知識其實也說不過去。那麼對於初學者來說,想要進入這個領域,我覺得一開始需要重點搞清楚幾個基本概念。
  • 甲基化晶片數據的差異分析
    我不是大神,但我可以縮短你走彎路的半年~   就像歌兒唱的那樣,如果你不知道該往哪兒走,就留在這學點生信好不好~   這裡有豆豆和花花的學習歷程,從新手到進階,生信路上有你有我!花花寫於2020-5-1,去年今天籤了勞動合同,正式工作一周年啦~紀念一下。感謝曾老闆!
  • 聊個天就把生存分析給做了?
    該文章於2020年9月24見刊在Cancer Cell雜誌,文章題目是《Next-Generation Analytics for Omics Data》。居然是聊天的方式做生存分析。DrBioRight的3大功能區我們直接進入DrBioRight的主頁:(https://drbioright.org).
  • 基金申請季開啟!評審人分享15條寫作技巧
    整理|劉如楠又一年基金申請季開啟,你的申請書進展如何?近日,中科院昆明動物所研究員陳策實做客中科院文獻情報中心,作了題為「從評委角度談國家自然科學基金申請書寫作」的報告。陳策實表示,申請人首先應把握標書評審的4點基本要素,即重要性、新穎性、實驗內容和設計的合理性、申請人和研究環境條件。與此同時,陳策實從題目、摘要、立項依據、申請書硬傷等15個方面分享了撰寫國家自然科學基金申請書的寫作技巧。《中國科學報》對報告內容進行了整理。
  • DNA甲基化——甲基化DNA PCR & NGS 分析試劑盒
    即未甲基化的胞嘧啶殘基被脫氨成尿嘧啶,甲基化的胞嘧啶(5-mC)殘基不受影響,這使PCR擴增可將尿嘧啶視為胸腺嘧啶,將5-mC或5-hmC識別為胞嘧啶。 這樣便能夠區分甲基化和未甲基化的胞嘧啶殘基,從而提供有關DNA甲基化區域的單核苷酸解析度信息。要成功地進行DNA甲基化研究,必須進行完全轉化,並減少通常由於嚴酷的化學反應而導致的DNA降解量。
  • 科學家闡述血液中細胞特異性的DNA甲基化改變
    表觀遺傳改變,特別是DNA甲基化(DNAm)的改變,被認為在提高疾病發生風險過程中發揮重要作用。大量已有的表觀基因組關聯研究(EWAS)通過繪製血液中DNAm改變的圖譜,探究吸菸如何影響正常細胞DNA甲基化。然而,血液由多種不同類型的細胞組成,因此,學界尚不清楚哪些特定的細胞類型更可能受到吸菸的影響。研究團隊首次通過細胞特異性的方式對血液EWAS進行Meta分析以解決該問題。
  • 基因研究新突破:科學家揭開DNA甲基化之謎
    有了這些知識,你就可以用人工甲基化體構建生物模型,模仿你想要引入DNA的菌株的甲基化模式。這樣你可以確保「生存」介紹了DNA,」專家說,本文的第一作者Torbj rn lsh j從導航系統Biosustain詹森。 當科學家們試圖將外來DNA引入宿主生物,例如細菌或酵母時,常常會遇到甲基化的問題。
  • 試驗對比了RNA測試與DNA-RNA測試診斷不確定甲狀腺結節的有效性
    2020年12月,《JAMA腫瘤學雜誌》發表了該試驗,其首席作者Masha J. 試驗設計 主要終點是RNA測試與DNA-RNA測試的診斷性能。次要終點是比較每種分子測試與以前版本測試性能的不同。 在總共2368名患者中,397名患者由於細胞學不確定被認為符合招募標準,346名患者隨機接受2種測試中的1種。
  • 營養與健康所闡述血液中細胞特異性的DNA甲基化改變
    表觀遺傳改變,特別是DNA甲基化(DNAm)的改變,被認為在提高疾病發生風險過程中發揮重要作用。大量已有的表觀基因組關聯研究(EWAS)通過繪製血液中DNAm改變的圖譜,探究吸菸如何影響正常細胞DNA甲基化。然而,血液由多種不同類型的細胞組成,因此,學界尚不清楚哪些特定的細胞類型更可能受到吸菸的影響。研究團隊首次通過細胞特異性的方式對血液EWAS進行Meta分析以解決該問題。
  • 研究發現RNA介導DNA甲基化參與調控草莓成熟
    Genome Biology 期刊在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心郎曌博研究組和植生生態所張一婧研究組合作完成的題為Downregulation of RdDM during strawberry fruit ripening 的研究論文,該研究揭示了RNA介導DNA甲基化通路在草莓果實成熟過程中的調控作用
  • DNA甲基化 |「雙面間諜」或將為癌症治療帶來新思路!
    毫無疑問,胞嘧啶甲基化的缺陷與發育異常、遺傳疾病以及癌症有關。最新的一項研究中,La Jolla免疫研究所的研究人員揭示了DNA的甲基化和去甲基化之間的平衡是如何阻止基因組不穩定性,進而阻止癌症發展的。
  • 超短DNA低甲基化區域和染色質3D結構的關係
    全基因組亞硫酸鹽測序(WGBS)作為繪製DNA甲基化譜的金標準,有著單鹼基高解析度和全基因組高通量的優勢,因此,全面解析DNA甲基化譜並挖掘其調控功能,是表觀遺傳學研究的前沿課題。在整個DNA甲基化組中,高度甲基化CpG佔據了大部分(70%-80%),低甲基化CpG簇聚形成低甲基化區域,通常聚集在基因調控區,人們已經發現了一些富集於啟動子、增強子和轉錄因子結合區域的低甲基化DNA元件。以往的DNA甲基化分析方法通常認為鄰近的CpG甲基化水平亦高度一致。因此,為了增加分析的可信度,傳統方法通常要求低甲基化區域必須包括至少4個低甲基化CpG。