2020年10月22日,北京大學湯富酬及付衛共同通訊在Cancer Cell 在線發表題為「Single-Cell Multiomics Sequencing Reveals Prevalent Genomic Alterations in Tumor Stromal Cells of Human Colorectal Cancer」的研究論文,該研究對21例微衛星穩定結直腸癌患者和6名無癌老年患者進行了單細胞多組學測序。
圖源:Cancer Cell
這篇文章提供了CRC中TME基質細胞中普遍的基因組改變的證據和功能相關性。
因為目前尚未探索腫瘤微環境(TME)中的基質細胞被結直腸癌(CRC)轉化到何種程度,為了剖析這些非惡性細胞的變化,文章對21例微衛星穩定CRC和6名無癌的老年患者進行了單細胞多組學測序,結果發現,體細胞拷貝數改變(SCNA)在TME和每個個體的正常組織中的免疫細胞,成纖維細胞和內皮細胞中普遍存在。
圖源自Cancer Cell
此外,腫瘤中SCNA的成纖維細胞比例(11.1%–47.7%)遠高於鄰近正常組織的比例(1.1%–10.6%),其中第7號染色體的增益顯著富集於TME中,清楚地表明了克隆擴增。而五個基因(BGN,RCN3,TAGLN,MYL9和TPM2)被鑑定為成纖維細胞特異性的生物標誌物。
圖源自Cancer Cell
重點如下:
1.SCNA在CRC的TME中普遍存在於免疫細胞,成纖維細胞和內皮細胞中
2.SCNA成纖維細胞在腫瘤中的比例遠高於正常組織中的比例
3.具有SCNA的成纖維細胞在腫瘤中的克隆擴增,尤其是chr7獲得
4.5種成纖維細胞特異性基因被鑑定為CRC預後較差的生物標誌物
文章參考:https://doi.org/10.1016/j.ccell.2020.09.015
如果文章對你有幫助的話,歡迎關注我們了解更多資訊
珍美思醫學研究院
微信公眾號:珍美思
微信:ncbiomed8014