通過對B肝病毒標誌物檢測的深入認識，可以幫助我們把肝損傷和B肝兩對半檢查區分開來，即B肝兩對半是B肝病毒標誌物檢測，也是針對B肝病毒的免疫學指標；但是，B肝大三陽的肝損傷是否嚴重、程度幾何，就無法通過B肝兩對半直接判斷。
轉氨酶高低波動，B肝DNA持續陽性，這對B肝大三陽代表什麼？
由於B肝大三陽的肝損傷程度與B肝兩對半結果沒有直接關係，所以，無論屬於B肝大三陽、B肝小三陽、B肝小二陽等類型，儘量都要查B肝DNA和肝功能，因為這些指標可以直接反映B肝病毒感染者的免疫狀態。有的人認為區分這些不重要，小番健康提醒，實際上還是挺重要的。
比如，正在抗病毒治療的B肝大三陽，經常希望能夠轉為B肝小三陽，進而判斷B肝病情有所好轉。通過小番健康的介紹，也就知道即使大三陽轉小三陽，關鍵還是要看體內的B肝病毒量是否相應減少。因為病毒載量的減少，即受到病毒感染的肝細胞也會同向減少，肝損傷逐漸減輕。
上述在臨床醫藥學稱為，促進B肝病毒複製水平下降至最低，只有這樣無論是對正在抗病毒的B肝大三陽、小三陽、小二陽等類型才是好事。免疫狀態，即通過體內B肝病毒量變化進而判斷，受到B肝病毒感染的肝細胞越多，B肝病毒複製越活躍，當B肝大三陽的免疫細胞被激活後，發生的免疫清除反應範圍也越廣。
原本人體的免疫反應，即免疫系統識別並清除B肝病毒抗原以及受到感染的肝細胞，這是身體自我保護反應。但是，在隨著受感染的肝細胞不斷免疫系統清除後，人體的肝損傷程度也會不斷加深，即轉氨酶、膽紅素持續升高，B肝病毒量反而相應的下降。
尤其是慢性B肝而言，即B肝病程拖延越久的人，這種免疫清除往往是不徹底的，人體會進入這種免疫清除、再破環、再清除的循環過程。原則上，血清出現B肝e抗原轉陰，e抗體轉陽，代表體內B肝病毒複製逐漸平復，病毒量正在減少。但是，還是應該預防B肝病毒變異引起的這種現象，複查B肝DNA和肝功能，輔助判斷病情走向。